DNA精确定量系统简介

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1、DNA精确定量系统简介一、主要用途:DNA精确定量 精确定量检测样品中dsDAN(双链DNA)的含量是高通量测序DNA样品前期必经程序之一,也是购置此设备的主要目的。依靠此设备,在测序样品送交测序公司之前可自行纯化并精确定量,既节省经费,又能加快测序工作进程。当然,该设备还可用于其他样品DNA的定量检测分析,如样品基因组DAN检测,cDNA 文库的构建,克隆DNA 片段的纯化,PCR扩增产物检测,药物中残留DNA 分子的测定等。常规的 DNA 含量的检测方法是在 260nm(A260)处测其吸光值。该方法主要的缺点是单链核苷酸和单核苷酸会产生干扰信号,核酸样品中的杂质也会影响结果。光吸收不能区

2、分 DNA 和 RNA, 灵敏度也相对较低,为g级 (在 A260 值为 0.1 时相对应的双链 DNA 浓度为 5 g/ml )。PicoGreen定量检测方法是与DNA精确定量系统配合使用,该法简便易行,检测灵敏度高,可检测到pg级DNA;检测范围宽,可跨越个数量级;特异性好,基本不受ssDNA和RNA的影响,并且可以耐受一定浓度的盐、尿素、乙醇、氯仿、去垢剂、蛋白等干扰。目前使用Picogreen染料定量检测DNA已经广泛用于生物学检测,并被2010年版中华人民共和国药典选为药物残留DNA定量方法。二、其他用途:(1)结合分析:免疫测定,受体分析(2)功能细胞受体配体结合分析,如GPCR

3、受体分析 细胞分析:细胞毒性,细胞存活率,细胞数量测定,细胞增殖,细胞粘附,自然杀伤细胞活性,氧化爆发,钙吸收,报告基因,噬菌作用(3)动力学分析:酶活性,Ca2+和其他离子通道的测量(4)激酶及信号转导通路检测(5)分子相互作用检测: 双比率检测,如BRET(生物发光能量共振转移) (6)微生物细胞生长曲线测定:在96孔培养板中振荡培养同时实时测定细胞光密度值。附一 PicoGreen荧光染料DNA精确定量方法(本室已购置PicoGreen 双链DNA 定量检测相关试剂)附二 DNA精确定量系统(多功能酶标仪) 性能指标1 工作条件1.1 环境:能在1535室温,相对湿度75%环境下运行。1

4、.2 电源及插头:能在 220V10%,50Hz,16A供电条件下连续工作。2 技术指标2.1 检测模式: 能够进行荧光强度(包括FRET等)、时间分辨荧光,吸收光和化学发光(包括BRET,闪光及慢发光等)等四种模式的检测,并通过电脑来控制各个模式的测定。2.2 检测方法 :终点法,动力学,顺序多发射,顺序多激发,比例(ratiometric),扫描2.3 光学部件2.3.1. 高能氙闪灯,无需预热,有需要才发射,减少反应受热影响 。2.3.2. 光谱 :2.3.2.1. 荧光光谱 :240-740nm(可选配到900nm)2.3.2.2. 吸收光光谱 : 220-1000nm.;2.3.3

5、2个滤光轮,激发、发射滤光片轮各自具有8个位置,可进行高速、周期性切换滤片。2.4 检测器 :专业型的侧窗光电倍增器 (PMT)。2.4.1 顶读/ 底读2.4.2 增益控制(Gain)可通过软件调整或自动增益调整。2.4.3 快速检测:96孔板/9s,384孔板/16s2.4.4 内置1公分比色皿修正功能2.5 微孔板混合器:可控制时间、力度和方向以线性, 圆形或双圆形的轨道运行。2.6 温度调整范围 :上下温控室温+4 C 到 45C,可选配到65C,精度控制为0.1C;温度稳定性 0.2C, 温度均一性 0.5C。2.8 已认证试剂: Promega DLReady, Invitroge

6、n LanthaScreenTM ,Cisbio HTRF,BellBrooks Transcreener FP / FI / TR-FRET2.9 板孔扫描 : 可进行每孔多达30x30点 扫描2.9.1 每点能单独表示,或用整体扫描图表示 2.9.2 能去掉某点数据, 使数据更理想 2.9.3 独特轨道平均 :在特定轨道作出阅读2.10 荧光:2.10.1 检测限度:0.2 fmol/孔荧光素;2.10.2 动态范围:8 decades。2.11 时间分辨荧光:2.11.1 检测限度:30 amol/孔Eu;2.11.2 动态范围:6 decades。2.12 吸收光:光谱范围220-10

7、00nm;1nm步调2.12.1 全波长扫描220-1000nm : 1秒/孔2.12.2 范围:0.000-4.000OD;2.12.3 重复性:0-2 OD:0.010OD,2-3OD:0.030OD2.12.4 准确性 (accuracy) : 1% 2OD2.12.5 精确度 (precision) : 0.5%1OD, 0.8%2OD2.13 化学发光:2.13.1 检测限度:20amol/孔ATP;2.13.2 动态范围:9 decades。2.13.3 专用供电器跟电子部件是屏蔽式, 减少背景噪音 2.15 MARS软件: 人性化软件,图像化视窗式设计2.15.1 符合FDA 21 CFR Part 11规格2.15.2 能通过软件全自动控制仪器2.15.3 动态多窗口运行:在同一个实验里以不同的速率收集数据(最多4种速率),慢速及快速动力学-最快可达每秒50次测读。2.15.4 随机选取实验参数分析数据。2.15.5 具备数据分析所需的一切功能软件和计算方法。2.15.6 数据能够以Microsoft Excel等数据软件进行保存。2.15.7 软件不限制用户数量。

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