信息检索与生物医药研究

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1、信息检索与生物医药研究信息检索与生物医药研究 张巍张巍美国化学文摘社美国化学文摘社(CAS)中国代表处中国代表处2007年年 4月月 排名世界排名世界500强的美国公司中，强的美国公司中，90设有情报信设有情报信息部，企业经营利润中息部，企业经营利润中35是由情报工作创造的。充分是由情报工作创造的。充分利用科技情报，能节约科研经费利用科技情报，能节约科研经费，节省，节省科研时间科研时间。 数据来源：上海科学技术情报研究所数据来源：上海科学技术情报研究所 1. 技术情报技术情报2. 人才情报人才情报3. 市场竞争情报市场竞争情报情报的分类情报的分类 对于企业来说，情报主要分成三大类：对于企业来说

2、，情报主要分成三大类：案例：注射用哌拉西林钠舒巴坦钠案例：注射用哌拉西林钠舒巴坦钠” 的专利纠纷（的专利纠纷（8亿元市场）亿元市场） 2002年，白云山药业等企业（哌年，白云山药业等企业（哌/舒）项目上马后，发现广州舒）项目上马后，发现广州威尔曼药业已申请相关专利，之后，白云山联系十一家企业诉讼威尔曼药业已申请相关专利，之后，白云山联系十一家企业诉讼该专利无效，在长达三年多的专利纠纷案中，上海新先锋出资该专利无效，在长达三年多的专利纠纷案中，上海新先锋出资8000万向广州威尔曼药业购买该专利使用权，目前，案件仍然在万向广州威尔曼药业购买该专利使用权，目前，案件仍然在持续中，可能诉讼无效成功，但

3、是时间已经过去三年。持续中，可能诉讼无效成功，但是时间已经过去三年。在药物研发中利用信息工具在药物研发中利用信息工具 的投资回报的投资回报研发的投资回报研发的投资回报:(以以SciFinder为例为例) 信息检索可以帮助研究人员节省时间，提高研发效率。使研发人信息检索可以帮助研究人员节省时间，提高研发效率。使研发人员能够做出明智的决策，并帮助研发人员借鉴前人的经验，选择合员能够做出明智的决策，并帮助研发人员借鉴前人的经验，选择合适的研发方向。并能够更好地了解相关研究领域已完成的工作和最适的研发方向。并能够更好地了解相关研究领域已完成的工作和最新动向，增强研发信心。根据新动向，增强研发信心。根据

4、HII数据显示，不同熟练程度的人使数据显示，不同熟练程度的人使用用SciFinder，可以获得，可以获得4.460倍的投资回报。倍的投资回报。操作方法操作方法1 电话深入采访了来自于电话深入采访了来自于5个美国公司，世界上其它个美国公司，世界上其它5个国家和公个国家和公司的司的21个用户。个用户。 2 用具体案例分析量化用具体案例分析量化SciFinder 在特定研究领域的收益情况。在特定研究领域的收益情况。 3 根据个案分析完成根据个案分析完成ROI 投资回报报告，并按照应用类型和用户投资回报报告，并按照应用类型和用户类型进行分类。类型进行分类。以下数据来源：以下数据来源：HII公司公司 投

5、资回报投资回报(ROI) - 成本模式成本模式 为了从具体收益方案中计算为了从具体收益方案中计算 ROI， HII 确认了偶尔使用和经常使用确认了偶尔使用和经常使用SciFinder的平均成本的平均成本 。T A B L E 1 SciFinder Cost Model Item Occasional Users Frequent Users Notes SciFinder software license $1,500 $6,000 Specific costs depend on the specific access package, number of seat licenses, a

6、nd additional available options. Internal IT support $500 $500 Costs include software deployment, general hardware support, contract maintenance, and general IT overhead. SciFinder-specific support costs $500 $1,000 Costs include internal user assistance resources, IS/Library support, log-in ID admi

7、nistration, and user training. Total $2,500 $7,500 Cost ranges are for single-user access ranging from a shared access package to a full enterprise license. Source: HII, 2006 投资回报（投资回报（ROI） 概述概述 通过与通过与SciFinder 用户进行访谈用户进行访谈, ROI 收益收益可以分成四个具可以分成四个具体部分：体部分： 提高研究效率 减少、终止无效的努力 提高研究质量 运用SciFinder更好地权衡专利信

8、息 ROI 1 提高效率提高效率 TABLE 2 Scenario 1: Improved Experimental Efficiencies Case Study Example ROI Direct Savings per Instance Cost Avg. Instances Per Year Key Savings Metric(s) 1: Accelerating research through identification of patent prior art and workarounds $10.0 $75,000 $7,500 (1P) Annualized effor

9、t Time savings, comprehensive IP evaluations, identification of workarounds 2: Using SciFinder to skip exploratory research and advance to pilot studies $32.060 $40,000 75,000 $7,500 (1P) 6 Direct costs, labor savings, time savings 3: Using SciFinder to prioritize synthetic pathway options $44 $1,00

10、0,000 $22,500 (3P) Annualized effort Time savings, labor savings 4: Identification of recent patent prior art to validate key processes in a major project $8.7 $86,500 $10,000 (1P/1Oc) 1 Time savings, labor savings Source: HII, 2006 ROI 2 终止无效努力终止无效努力这个部分描述了利用这个部分描述了利用SciFinder 在研发过程中可以终止结束无用的努力。在研发

11、过程中可以终止结束无用的努力。TABLE 3 Scenario 2: Early Termination of Unproductive Efforts Case Study Example ROI Direct Savings per Instance Cost Avg. Instances Per Year Key Savings Metric(s) 1: Identification of new competitor prior art through patent alerts, resulting in project kill $12.3 $46,000 $7,500 (1P)

12、2 Time savings, labor savings Source HII, 2006 ROI 3 提高研究质量提高研究质量 快捷快捷、及时地访问相关信息能够使科学家研究效率提高，富于创造性，、及时地访问相关信息能够使科学家研究效率提高，富于创造性，充分发挥其潜力。充分发挥其潜力。TABLE 4 Scenario 3: Better and Faster Access to Information Case Study Example ROI Direct Savings per Instance Cost Avg. Instances Per Year Key Savings Metr

13、ic(s) 1: SciFinder versus library $4.4 $11,000 $2,500 (1Oc) Annualized effort Time savings, labor savings 2: Enhanced productivity complements industry experience $5.76.4 $14,20016,000 $2,500 (1Oc) Annualized effort Salary savings, time savings Source HII, 2006 ROI 4 有效利用专利有效利用专利对药物研究者来说，专利数据库含有宝贵的信

14、息资源。对药物研究者来说，专利数据库含有宝贵的信息资源。T A B L E 5 S c e n a r i o 4 : B e t t e r L e v e r a g i n g o f t h e P a t e n t L a n d s c a p e Case Study Example ROI Direct Savings per Instance Cost Avg. Instances Per Year Key Savings Metric(s) 1: Early adverse event identification through patent alerts $25.03

15、5.7 $625,000 $17,50025,000 (1P, 4Oc or 2P, 4Oc) Annualized effort Time savings, labor savings 2: Automatic linkage of SciFinder to MicroPatent $2.0 $15,000 $7,500 (1P) Annualized effort Time savings, labor savings Source: HII, 2006 投资回报率（投资回报率（ROI）分析）分析 偶尔使用者间歇地访问偶尔使用者间歇地访问SciFinder，解决特定问题并获取到特定的研究出

16、版，解决特定问题并获取到特定的研究出版物的副本。物的副本。 - 每一元的投资，每一元的投资，ROI为为 4.4元到元到25.0元 经常使用的用户更系统性地访问经常使用的用户更系统性地访问SciFinder。随着他们对。随着他们对SciFinder的运用的运用越发熟练，他们对研究数据和信息的访问更加快捷和有效。越发熟练，他们对研究数据和信息的访问更加快捷和有效。每一元的投资，每一元的投资，ROI为为 10.0元到元到 60元元偶尔使用和经常使用两种用户组成的团队一般是集体协作使用偶尔使用和经常使用两种用户组成的团队一般是集体协作使用Scifinder.团队团队的大小由组织结构和联合体的组合决定，

17、并且直接问题由使用的大小由组织结构和联合体的组合决定，并且直接问题由使用SciFinder调调查查.每一元的投资，每一元的投资，ROI 为为8.7元元 到到 35.7元元新药研究过程中的信息检索新药研究过程中的信息检索Target DiscoveryPre-clinical “Discovery”Clinical “Development”Lead DiscoveryLead OptimizationADMETDevelopmentRegistration2-3 years0.5-1 year1-3 years1-2 years5-6 years1-2 years disease models

18、 target identification target validation assay development screening drug design medicinal chemistry rational drug design Phase I Phase II Phase III USA Europe Japan Rest of world bioavailability systemic exposure animal testing新药研究过程中的信息检索新药研究过程中的信息检索Each step of the drug discovery process needs in

19、formation:1.Target IdentificationLots of enduser searching to screen and monitor candidates. When a target is identified IP questions should be solved. Require a completepicture only available from expert searching.Lead DiscoveryAgain the enduser explores possibilities supported by info pros with ad

20、ditional information. MARPAT searching necesssary to validate IPof possible drug candidates.Lead OptimizationReaction searching, various searches for add. informationADMETToxicity information needed at this stage, candidates already patented. Monitoringof the competitive landscape.DevelopmentRegistr

21、ationLegal information may be needed, marketing information. 检索数据库的正确方法检索数据库的正确方法21世纪科学信息检索世纪科学信息检索科学家通过网络界面进行检索科学家通过网络界面进行检索:21世纪科学信息检索世纪科学信息检索科学家通过网络界面科学家通过网络界面检索数据库检索数据库比如比如, 在一个检索界面上在一个检索界面上 我们输入检索项我们输入检索项CHINESE MEDICINE获得结果获得结果信息检索信息检索: 20世纪和世纪和21世纪世纪20世纪世纪使用检索命令通过在线联机检索系统检索数据库我们找到重要的文章我们得到这些文

22、章 (印刷版) 从图书馆21世纪世纪通过网络界面检索数据库我们找到重要文章然后得到这些文章(电子版) 从网上21世纪世纪但是我们现在也可以直接检索全文，所以我们还需要数据库吗?我们为什么不能只检索全文呢?科学期刊和专利科学期刊和专利:阅读和检索阅读和检索我们我们阅读阅读的和的和检索检索的有很大区别的有很大区别我们我们阅读阅读一篇文献所有细节我们我们检索检索上千文献仅仅是关键信息 阅读阅读 Yes!检索检索- ? 原始文献中的原文原始文献中的原文原文是由原文是由:作者撰写是非系统化的作者可能会使用差别很大的术语当我们阅读文献的时候并不带来问题但当我们要检索上千文献的时候会带来很大问题 我们必须输

23、入很多额外的术语来涵盖这些差别很大的术语原始文献中的原文原始文献中的原文通常我们不能检索通常我们不能检索:表格图形结构式反应式特性数据对波长为470-472 nm的光感兴趣但是在原文中可能只报道 471 nm然而我们怎么能考虑到这些不同?通常我们不想检索通常我们不想检索:全文的多个部分让我向您演示一个例子让我向您演示一个例子 .一篇期刊中的文章一篇期刊中的文章 (3页文献中的页文献中的 1-2 页页)检索全文检索全文我们不能检索我们不能检索检索全文检索全文我们可能不想我们可能不想检索这些内容检索这些内容检索全文检索全文我们不想检索我们不想检索检索全文检索全文这些内容很这些内容很难检索难检索我要

24、如何才能检索这些内容我要如何才能检索这些内容?检索全文检索全文这些内容很难这些内容很难检索到检索到我们无法检索我们无法检索这些内容这些内容我们无法检我们无法检索这些内容索这些内容我们无法检我们无法检索这些内容索这些内容我们不想检我们不想检索这些内容索这些内容我们可能不我们可能不想检索这些想检索这些原始文献原始文献我们需要阅读全文我们需要阅读全文但是检索全文有很大的局限但是检索全文有很大的局限所以数据库仍然是一个解决方法所以数据库仍然是一个解决方法?让我们用数据库来看看这些问题让我们用数据库来看看这些问题我们希望从数据库中得到什么我们希望从数据库中得到什么内容内容数据库必须涵盖我们需要的文章然而

25、, 什么是世界上最全面的数据库?附加内容附加内容数据库必须提供给我们附加内容 (检索全文不能获得的)然而, 所有数据库都提供这样的附加内容吗?使用简便使用简便数据库的使用必须简便这实际上意味着 它必须有这样一个界面:能帮助我们检索能帮助我们按照我们的意愿缩小答案数据库增值内容和功能数据库增值内容和功能例子例子让我们看一下一篇来自中国大学关于化学研究的文章让我们看一下一篇来自中国大学关于化学研究的文章Web of Science中的记录中的记录记录包括了记录包括了: 增值内容为一些关键词，但是这些关键词是非系统性的术语增值内容为一些关键词，但是这些关键词是非系统性的术语:LIGHT-HARVES

26、TING ARRAYS, ELECTRON TRANSFER, MOLECULAR WIRES SciFinder Scholar中的记录中的记录记录包含记录包含: 增值内容带来增值内容带来:系统化的主题索引物质索引和物质记录详细的物性信息主题和物质索引主题和物质索引具体物质的索引具体物质的索引: “porphyrin 1”; “porphyrin 2”等等物质记录物质记录我们就是这样解决前面全文检索无法解决的困难的我们就是这样解决前面全文检索无法解决的困难的! 详细的物性信息详细的物性信息我们就是这样解决前面全文检索无法解决的困难的！我们就是这样解决前面全文检索无法解决的困难的！物质结构，谱

27、图与反应物质结构，谱图与反应化合物的实验数据与谱图，如化合物的实验数据与谱图，如MP,IR,MS,NMR涉及该化合物的所有反应信息涉及该化合物的所有反应信息利用结构式查询物质利用结构式查询物质SciFinder分析功能分析功能反应数据的智能化分析与归类反应数据的智能化分析与归类SciFinder提供专门为生物医药行业研发量身打造的亚结构检索提供专门为生物医药行业研发量身打造的亚结构检索帮助科研工作者获得最为广泛的原子修饰信息帮助科研工作者获得最为广泛的原子修饰信息物质和反应的亚结构检索功能物质和反应的亚结构检索功能SciFinder 2006更是提供了相似结构检索更是提供了相似结构检索帮助科研工作获得最为广泛的相似结构信息帮助科研工作获得最为广泛的相似结构信息化学物质的相似性检索专门为药物开发设计化学物质的相似性检索专门为药物开发设计SciFinder介绍介绍全景检索为科技创新提供最强大的支持！全景检索为科技创新提供最强大的支持！全景检索功能帮助你把握全局全景检索功能帮助你把握全局新化学品新化学品化学物质的物理性质化学物质的物理性质药物专利药物专利生物序列生物序列药物名药物名药理和毒理药理和毒理法规法规市场和经济市场和经济药物新闻等药物新闻等STN-世界上最全面的科技和专利数据库世界上最全面的科技和专利数据库