NTsyspc21图解使用说明word文档良心出品
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1、NTsys-pc201图解使用说明 数据的录入方法:iNtedit 接录入数据1)利用No rows ,在(条带编号)。0、1二元数据中的数据缺失记为2其中列标可以写为样品编号格式。No.cols栏中写入样品总数。文件另存为tms栏中写入S 1数据总数,农中直接读入数据从excel?)Excel农中输入数据格式如下图。A1必须为1, B1为0、1数据总数,C1为样品总数。Al f 2A:B j Ci D 丨 E 丨 F | G |2clc2 c3 c4 c5Slrl111111$5t5110110 0 0 0 0 卫 I 説 61 ool5LOjrS00201Tl|r911111J幻| 画1
2、zRShe航矗貢2/Sheet3厂klI|厂打开Ntedit程序,选择从Excel农输入,结果见上图。文件力存为Nts格式从文本文件读取数据:2.聚类分析Ntsys-pc2.02界面如下以下以图中数据为例介绍聚类过程:2.1首先用similarity程序组中的Qualitative data计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM结果输出到另文件。DICE2.2以上步的结果作为input file利用Clustering程序组中的SHAN或者Njoin进行计算,聚类分 法选用UPGMA, ties选用FIND. Maximum no. tied trees至少人于样品数。-(1 X
3、Parameters:Arguments:二InputfileC:Documents and SettingsAdministr(Output tree fileC:Documents and SettingsWministrsClustering methodUPGMA摻In case of tiesFIND摻Maximum r)o lied trees100JTie tolerance0.00000000 二J ComputeClose? Help |Njoin程序组界(fti如下,rooting method可以选用Outgroup.但需输入外元。2.3将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到Graphics程序组中的tree plot程序中计算匐 Tree plot41凶File Edit Options HelpI 11 11 I0j6S0.7S0S2clc4c5c2c3I0S9Coefficient得到树图如下Matrix: p Cj可以对树图进行描述与处理。options利用.
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