分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册

上传人:努力****83 文档编号:40744079 上传时间:2021-11-17 格式:DOCX 页数:24 大小:99.25KB
收藏 版权申诉 举报 下载
分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册_第1页
第1页 / 共24页
分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册_第2页
第2页 / 共24页
分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册_第3页
第3页 / 共24页
资源描述:

《分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册》由会员分享,可在线阅读,更多相关《分子生物学:基础实验技能培训实验操作手册(24页珍藏版)》请在装配图网上搜索。

1、基础实验技能培训实验操作手册2014-08植物基因组DNA提取实验材料:植物样本,植物基因组DNA提取试剂盒,-巯基乙醇,氯仿,无水乙醇实验仪器、耗材:移液器、电泳仪、离心机、研钵、研钵棒、剪刀、天平、液氮实验前准备:1 Buffer GP1在使用前请加入-巯基乙醇,5 ml Buffer GP1加5 l -巯基乙醇。加入 -巯基乙醇的Buffer GP1室温可保存1个月。 2 预热水浴锅 65度,将加入配制好的巯基乙醇预热。3 第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。4 称取植物样本约100 mg。5 在研磨植物材料前,向研钵中倒入酒精,

2、放入剪刀、钥匙高温消毒。6 研钵、剪刀、钥匙冷却后,将液氮加入在研钵中以预冷研钵。实验步骤:1. 取植物新鲜组织约100 mg,用剪刀将样本剪碎,放入研钵,加入液氮充分研磨至粉末状。将粉末转移到离心管中。注意:冻存材料直接研磨,绝对不能化冻。而且粉末应在化冻前转移,否则内源性DNase有可能降解基因组DNA。2. 加入700 l 65预热的Buffer GP1(Buffer GP1在使用前请加入-巯基乙醇,5 ml Buffer GP1加5 l -巯基乙醇),迅速颠倒混匀后,将离心管置于65水浴20分钟,水浴过程中颠倒离心管混匀样品数次。3. 加入700 l 氯仿,充分混匀,12,000 rp

3、m(13,400g)离心5分钟。小心将上层水相转入一新的离心管中,加入700 l Buffer GP2,充分混匀。4. 将上步所得溶液全部加入到已装入收集管(Collection Tube)的吸附柱(Spin Column DM)中。若一次不能加完溶液,可分多次转入。10,000 rpm(11,500g)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。5. 向吸附柱中加入500 l Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),10,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。6. 向吸附柱中加入500 l Buffer GW2(使用前检查是否已加

4、入无水乙醇),10,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。7. 12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。(乙醇一定要吹干, 否则电泳点样时, 样品上漂)8. 将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50l Buffer GE,室温放置2-5分钟,10,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20保存DNA。9. 电泳检测。感受态制备实验材料:菌株:Top10 (Str+)、LB固体培养基,LB液体培养基,洗脱液,保存液实验方法:Cacl2法制备TOP10感受态实验仪器、耗材:4度离心机,分光光

5、度计、50ml离心管、-80度低温冰箱试剂配制方法:1 L 液体LB培养基:10 g蛋白胨+5 g酵母粉+10 g氯化钠,加蒸馏水至1000ml。100 ml 固体LB培养基:1 g蛋白胨+0.5 g酵母粉+1 g氯化钠+1.5 g琼脂粉,加蒸馏水至100ml。1 L洗脱液 :16.264 g MgCl26H2O(80 mM)+ 2.94 g CaCl22H2O(20 mM)200 ml 保存液 :2.205 g CaCl22H2O(75 mM)+ 30 ml甘油(15 %)灭菌条件:122 20 min实验步骤:1. 菌种的划线培养第一天下午4:30分 从-80取甘油菌,在一次性LB平板上进

6、行划线接菌,在37恒温培养箱过夜培养。2. 接菌小摇与培养基的制备第二天下午4:30分 取过夜培养平板,用枪头挑菌于50ml液体LB培养管内,37,250 rpm 摇菌过夜。3. 扩大培养第三天早上8:30分 取过夜小摇菌液 按1:100比例加入250ml三角瓶(含100 ml 液体LB培养基)进行扩大培养,期间监测OD值。4. 冰冻,离心,收菌当OD 600= 0.4 0.5之间时,将摇菌三角瓶置于冰上,冰浴30 min。然后将菌液分别加入50ml离心管中4,3500 rpm,离心10 min收集菌体。5. 洗脱,冰冻,离心将收集的菌体加入洗脱液 12.5 ml, 混匀,冰浴20 min。(

7、每100ml菌液量加12.5ml洗脱液,也可根据总体积调整洗脱液的大小。)4,3500 rpm,离心10 min,收集菌体。6. 分装保存加入保存液5ml(每100ml菌液量),混匀,分装细胞即可。PCR扩增实验材料:GFP模板(约750 bp),GFP Forward Primer,GFP Reverse Primer,Taq MasterMix实验仪器、耗材:PCR仪、移液器、PCR管、1.5ml离心管、电泳仪、照胶仪实验步骤:1. 配制PCR反应体系:每组做两个重复。试剂50 l反应体系2Taq MasterMix(含染料)25 lGFP Forward Primer,10 M1 l1

8、lGFP Reverse Primer,10 MGFP 模板1 lRNase-Free Water22 lTotal50 l2. PCR反应条件: 步骤温度时间预变性942 min变性9430个循环30 s退火5530 s延伸721 min终延伸722 min3. 结果检测:反应结束后,取35 l反应产物电泳检测,并准备进行琼脂糖凝胶回收。琼脂糖凝胶回收纯化实验材料:琼脂糖凝胶胶块、琼脂糖凝胶回收纯化试剂盒、无水乙醇实验仪器、耗材:切胶仪/照胶仪、小刀、移液器、分光光度计、水浴锅、1.5ml离心管实验前准备:预热水浴锅至50度。实验步骤1、 取2个1.5ml干净的离心管,称取空管重量,将重量标

9、记于管壁上。2、 将单一目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分),放入离心管中,称重, 计算胶块重量。注意:若胶块的体积过大,可将胶块切成碎块。3、 向胶块中加入3倍体积Buffer PG(如凝胶重为100 mg,其体积可视为100 l,依此类推)。4、 50孵育10分钟,其间每隔2-3分钟温和地上下颠倒离心管,以确保胶块充分溶解。如果 还有未溶的胶块,可再补加一些溶胶液或继续放置几分钟,直至胶块完全溶解。注意:1)当琼脂糖凝胶浓度2%时,适当延长孵育时间。2)胶块完全溶解后最好将胶溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在较高温度时结合DNA的能力较弱。5、 柱平衡:向已装入收集管(C

10、ollection Tube)中的吸附柱(Spin Column DM)中加入200 l Buffer PS,17,900g(13,000 rpm)离心2分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。6、 将步骤3或4所得溶液加入到已装入收集管的吸附柱中,室温放置2分钟,17,900g(13,000 rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。注意:吸附柱容积为700 l,若样品体积大于700 l 可分批加入。7、 向吸附柱中加入500 l Buffer PG,17,900g(13,000 rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。8、 向吸附柱中加

11、入750 l Buffer PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),17,900g(13,000 rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。9、 17,900g(13,000 rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱开盖,置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的乙醇。10、 将吸附柱放到一个新的1.5ml离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加35 l Buffer EB(pH 8.5),室温放置

12、2分钟。17,900g(13,000 rpm)离心1分钟,收集DNA溶液。-20保存DNA。注意:1) 洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围)。2) 为了提高DNA的回收量,可将离心得到的溶液重新滴加到吸附柱中,重复步骤10。3) 洗脱体积不应小于30 l,体积过少会影响回收效率。4) 如果使用TE洗脱,需要考虑其中含有的EDTA是否会影响后续的酶促反应。5) 回收大于10 kb的DNA片段时,Buffer EB应在50水浴中预热,适当延长吸附和洗脱时间,可增加回收效率。11、 结果检测:1) 浓度检测:对回

13、收后的PCR产物进行浓度测定。2) 电泳检测:取4 l回收前的PCR产物、2.5 l回收前的PCR产物及5 l回收后的PCR产物进行电泳检测。TA克隆连接、转化、涂板、鉴定一、 连接:实验材料:pUC-T载体、回收纯化的DNA片段(750 bp)实验仪器、耗材:移液器、PCR管、PCR仪实验步骤:1. 计算插入片段的体积:1)在进行克隆时,载体pUC-T和插入片段的摩尔比一般为1:2-1:10,本实验我们选择1:3。2)本实验使用的载体pUC-T浓度为50ng/l,50ng的摩尔数约为0.03 pmol,因此本实验插入片段的摩尔数为0.09 pmol,插入片段为750bp,那么本实验插入片段D

14、NA的使用量(ng)=0.0910-3660750(插入片段bp数)=44.55 ng。3)插入片段的体积(l)=插入片段DNA的使用量(ng)/插入片段的浓度(ng/l)本次我们使用的插入片段为上次实验中胶回收片段,因此胶回收片段的浓度为40.6 ng/l,那么,插入片段的体积(l) =44.55/40.6=1.097,即在反应体系中加入1 l插入片段。2. 按以下体系配制反应液:每组做4个。试剂体积pUC-T (50 ng/l)1 ml插入片段(750bp)X mlRNase-Free WaterY mlSolution Buffer,25 mlTotal10 ml3. 混匀,22孵育30

15、分钟,或者16过夜连接。二、 转化:实验材料:TOP10感受态细胞、自制感受态细胞、LB液体培养基实验仪器、耗材:移液器、超净台、浮漂、摇床、水浴锅实验前准备:预热水浴锅至42度。实验步骤:1. 取TOP10感受态细胞置于冰浴中,待感受态细胞融化后,进行以下实验。2. 实验组:将10 l连接产物加入至100 l TOP10感受态细胞中,用移液器轻轻吹打混匀, 冰浴30分钟。每组共做2个。对照组:将10 l连接产物加入至100 l自制感受态细胞中,用移液器轻轻吹打混匀,冰浴30分钟。每组做2个。3. 将离心管置于42水浴,热击90秒,迅速将离心管转移到冰浴中,冰上静置2-3分钟。4. 向离心管中

16、加入900L的 LB液体培养基(不含抗生素),混匀后置于37摇床,150 rpm振荡培养45分钟,使菌体复苏。三、 涂板、培养:实验材料:LB固体培养基、LB液体培养基、氨苄、IPTG、X-gal实验仪器、耗材:涂布棒、超净台、移液器、培养箱实验步骤:1 倒板:在LB固体培养基中加入氨苄后,进行倒板。将100mg/mL的氨苄稀释1000倍使用。(300 ml培养基 + 300L的100mg/mL氨苄)注意!培养基温度应在50-60度时,再加入氨苄。2 将40L 的20mg/mL的X-gal和20L 50mg/mL的IPTG涂布于含氨苄青霉素的LB平板上,用无菌的涂布棒均匀涂开。3 离心,倒掉上

17、清,将沉淀中全部转化后的培养物,加到平板上,用无菌的涂布棒将细胞均匀涂开。4 将平板置于室温下至液体被完全吸收,倒置平板,37培养箱,过夜培养。四、 观察、鉴定:1 观察蓝色和白色菌落,计算白色和蓝色菌落数。2 菌落PCR鉴定实验材料: Taq MasterMix、菌液、M13 Forward Primer、M13 Reverse Primer、LB液体培养基、氨苄实验耗材:超净台、15ml离心管、摇床、PCR仪、移液器、LB液体培养基实验步骤:选择平板,每个平板挑取白色菌落(4个)和蓝色菌落(2个),分别放入50 l RNase-Free Water中,取2 l 进行菌落PCR鉴定。剩下的4

18、8 l 等待菌落PCR结果,选取阳性克隆,于当日下午接种于5ml 含氨苄青霉素的LB液体培养基中,置于37摇床,250 rpm振荡培养过夜,用于第二日提取质粒。1) 配制PCR反应体系:试剂20 l反应体系2Taq MasterMix10 lM13 Forward Primer,10 M0.5 lM13 Reverse Primer,10 M0.5 l菌液2 lRNase-Free Water7 lTotal20 l2)配制除菌液外的预混体系,并分装到PCR管中,每个管中加入18 l的预混体系。3)模板加入:每个管中分别加入2 l菌液。混匀,短暂离心。 4)PCR反应条件: 步骤温度时间预变性

19、942 min变性9430个循环30 s退火5530 s延伸721 min终延伸722 min5)结果检测:反应结束后,取5 l反应产物直接电泳检测结果。3 高纯质粒提取鉴定实验材料:菌液,高纯质粒提取试剂盒,无水乙醇实验仪器、耗材:移液器、电泳仪实验前准备:1) Buffer P1中加入RNase A。2) 第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明在Buffer PW中加入无水乙醇。实验步骤:1. 取3ml(根据培养菌体的浓度选择合适的量,建议最多不超过5 ml)过夜培养的菌液,加入离心管中,12,000 rpm(13,400g)离心2-3分钟收集细菌,尽量吸弃全部上清。注意:质粒拷贝数较低或10

20、 kb时,可以使用更多菌液通过二次离心将菌体沉淀收集到同一个离心管中,同时后续所加试剂Buffer P1、P2及N3的量需加倍。所加试剂的量必须能够充分裂解菌体,菌体过多、裂解不充分都会降低质粒的提取效率。2. 向留有菌体沉淀的离心管中加入250 l Buffer P1(请先检查是否已加入RNase A),使用移液器或涡旋振荡器充分混匀,悬浮细菌沉淀。注意:如果菌块未彻底混匀,将会影响裂解效果,使提取量和纯度偏低。3. 向离心管中加入250 l Buffer P2,温和地上下颠倒混匀6-8次,使菌体充分裂解,室温放置3-5分钟。此时溶液应变得清亮粘稠。注意:不要剧烈震荡,以免造成所提质粒中基因

21、组DNA污染。如果溶液未变得清亮,提示可能菌量过大,裂解不彻底,应减少菌体量。4. 向离心管中加入350 l Buffer N3,立即上下颠倒混匀6-8次,此时出现白色絮状沉淀,室温放置5分钟。12,000 rpm离心10分钟。注意:Buffer N3 加入后应立即混匀,避免产生局部沉淀。5. 柱平衡: 向已装入收集管(Collection Tube)的吸附柱(Spin Column CM)中加入200 l Buffer PS,12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。6. 将步骤4中所得的上清液转移到吸附柱(已装入收集管)中,12,000 rpm离心1分钟

22、,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。注意:吸附柱的最大容积为700 l,所以第4步中所得溶液分2次过柱。7. 向吸附柱中加入500 l Buffer PB,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。注意: 如果宿主菌是endA-宿主菌(DH5,TOP10 等),此步可省略。如果宿主菌是end A+宿主菌(TG1,BL21, HB101,JM101, ET12567等),这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒DNA,推荐采用此步,如果提取低拷贝质粒推荐采用此步。8. 向吸附柱中加入600 l Buffer PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12,

23、000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液。9. 重复步骤8。10. 将吸附柱重新放回收集管中,12,000 rpm离心2分钟,倒掉废液,将吸附柱置于室温干燥5分钟。注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR 等)。11. 将吸附柱置于一个新的收集管中,向吸附膜的中间部位加入50-100 l Buffer EB,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心2分钟,将质粒溶液收集到离心管中。-20保存质粒。注意:1)为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,重复步骤11。2)Buffer EB在6570水浴预热,适当延长吸附和洗脱

24、的时间,可以增加提取效率。3)洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5范围内(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0会降低洗脱效率。4)洗脱缓冲液体积不应少于50 l,体积过小影响回收效率。12. 结果检测:取5 l产物进行电泳检测。植物总RNA提取材料:植物样本,超纯RNA提取试剂盒,氯仿,75%乙醇(无RNase的水配制)实验仪器、耗材:移液器、电泳仪、4度离心机、分光光度计、研钵、研钵棒、天平、液氮实验前准备:1 配制75%乙醇,用无RNase的水配制。2 称取植物样本100 mg。3 在研磨植物材料前,向研钵中倒入酒精,放入

25、剪刀、钥匙高温消毒。4 研钵、剪刀、钥匙冷却后,将液氮加入在研钵中以预冷研钵。实验步骤:注意:低温冰上操作1. 样品处理:称取植物样本100 mg,将植物样本剪碎后,放入研钵中,加入液氮,充分研磨,研磨充分后,加入1 ml Buffer RLT。注意:样品体积不超过Buffer RLT体积的10%。 2. 样品中加入Buffer RLT后反复吹打几次,使样本充分裂解。室温放置5分钟,使蛋白核酸复合物完全分离。 3. 每1 ml Buffer RLT加入200 l 氯仿的比例加入氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放置2分钟。 4. 4 12,000 rpm(13,400g)离心10分钟,此时样

26、品分为三层:红色有机相,中间层和上层无色水相,RNA主要在上层水相中,将上层水相移到一个新的RNase-Free离心管(自备)中。 5. 在得到的水相溶液中加入等体积的70%乙醇(无RNase的水配制),颠倒混匀。 6. 将上步所得溶液全部加入到已装入收集管(Collection Tube 2 ml)的吸附柱(Spin Column RM)中。若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 7. 向吸附柱中加入700 l Buffer RW1,12,000 rpm离心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 8.

27、向吸附柱中加入500 l Buffer RW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 9. 重复步骤8。 10. 12,000 rpm离心2 分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。 11. 将吸附柱置于一个新的无RNase离心管(Collection Tube 1.5 ml)中,向吸附柱的中间部位加入30-50 l RNase-Free Water,室温放置1分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集RNA溶液,-70保存RNA,防止降解。 12. 检测:1)电泳检测。2)RNA浓度和纯度测定:

28、纯度:OD260/OD280 = 1.9-2.1 2.2 RNA水解 浓度:RNA(g/l)=40OD260稀释倍数逆转录cDNA合成实验材料:HiFi-Script cDNA第一链合成试剂盒,RNA(植物RNA实验提取)实验仪器、耗材:PCR仪、PCR管、移液器实验步骤:1.将 RNA模板、Primer Mix、dNTP Mix、DTT、RT Buffer、HiFi-Script和RNase-Free Water溶解并置于冰上备用。2. 根据以下表格配置反应体系,总体积为20 l。RNA终浓度建议为1g,需要根据测定的RNA浓度,计算逆转录中需要的RNA体积。试剂20 l 反应体系dNTP

29、Mix,2.5 mM Each4 lPrimer Mix2 lRNA TemplateX l(1g)5RT Buffer4 lDTT,0.1 M2 lHiFi-Script,200 U/l1 lRNase-Free WaterYTotal20 l3. 涡旋震荡混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。4. 42孵育50分钟,85孵育5分钟。反应结束后,短暂离心,置于冰上冷却。5. 逆转录产物可直接用于PCR和荧光定量PCR,或置于-20长期保存。荧光定量PCR实验材料:UltraSYBR Green Mixture,cDNA,actin Forward Primer、actin Reverse

30、 Primer实验仪器、耗材:荧光定量PCR仪、PCR管、1.5ml离心管、移液器、八连管离心机实验步骤:1. 模板稀释:注意:每稀释一个倍数,需要将溶液混匀,并短暂离心。编号模板稀释倍数水用量模板用量110倍90 l10 l (原液)2100倍90 l10 l(从1号管取)2. 配制PCR预混反应体系:做8个样本,配制10个样本的预混体系,配制方式如下:试剂配制10个样本的预混体系20 l反应体系2UltraSYBR Mixture 100 l10 lForward Primer,10 M4 l0.4 lReverse Primer,10 M4 l0.4 l人cDNA0 l2 lRNase-

31、Free Water72 l7.2 lTotal180203. 将配制的预混体系,分装到八连管中。共8个孔,每个孔中加入18 l的预混体系。4. 模板加入:每个孔中分别加入2 l模板,加样顺序如下:加样孔12345678样品原液原液稀释10倍稀释10倍稀释100倍稀释100倍水水加入体积2 l2 l2 l2 l2 l2 l2 l2 l5. 混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。6. 荧光定量PCR反应程序: 步骤温度时间预变性9510 min 变性9540个循环10 s退火/延伸 601 min融解曲线分析 注意事项:1首先配制预混体系,再将预混体系分装到八连管中。2. 稀释模板时,需要混

32、匀。3. 不要直接在八连管管壁或管盖上做标记!植物总蛋白提取实验材料: 植物样本、植物蛋白抽提试剂实验仪器、耗材:研钵、研钵棒、移液器、1.5ml离心管、4度离心机、天平、液氮注意:低温冰上操作实验前准备:1. 将蛋白酶抑制剂混合物加入植物蛋白抽提试剂中,按照1:99比例加入,使蛋白酶抑制剂混合物在抽提试剂中成1工作液。配制方法:990 l植物蛋白抽提试剂 + 10 l蛋白酶抑制剂混合物,冰上放置待用。2. 称取植物样本约100 mg。3. 在研磨植物材料前,先将液氮加入在研钵中以预冷研钵。实验步骤:1. 称量100 mg植物组织,用剪刀将样本剪碎,放入研钵,加入液氮充分研磨至粉末状。将粉末转

33、移到离心管中。2. 按照组织:抽提试剂=1:5(g/ml)的比例加入蛋白抽提试剂,100 mg植物组织加入500l蛋白抽提试剂。 涡旋混匀,冰上孵育30分钟,期间涡旋混匀3次。3. 4 12,000 rpm,离心20分钟。4. 将上清转移至新的离心管中。冰上放置,准备蛋白定量,或将提取的蛋白-20保存。蛋白定量实验材料:提取的植物蛋白、BCA定量试剂盒实验仪器、耗材:移液器、酶标仪/分光光度计、酶标条、酶标板、1.5ml离心管、PCR管实验步骤:1. 标准品稀释(按照下表进行标准品稀释)。2. 样品稀释:将提取的蛋白样品稀释3倍。(60 l ddH2O + 20 l蛋白样品)3. 配置BCA工

34、作液:根据标准品和样品的数量,将试剂A和试剂B以50:1的体积比混匀(6 ml A液+120 l B液)微孔法:1) 将25 l稀释好的样品与稀释好的标准品分别添加于96孔板的微孔中。2) 各孔中加入200 l BCA工作液,充分混匀。3) 盖上96孔板盖,37孵育30分钟。4) 冷却至室温。5) 用酶标仪测定562nm处的吸光值。6) 绘制标准曲线,计算样品中的蛋白浓度。试管法:1)将100 l稀释好的样品与稀释好的BSA标准品分别加到作好标记的试管中。 2)各试管中各加入2 ml BCA工作液,充分混匀。3)37水浴中孵育30分钟或室温孵育2小时。4)将各管冷却至室温。5)用分光光度计测定

35、562nm处的吸光值。6)绘制标准曲线,计算样品中的蛋白浓度。注意事项:标准品测定需在10min内完成,否则会影响蛋白定量的准确度。蛋白电泳(制胶、SDS-PAGE电泳)实验材料:SDS-PAGE凝胶制备试剂盒、电泳缓冲液、提取的蛋白或全细胞裂解液、广谱彩虹预染中分子量蛋白Marker、SDS-PAGE Loading Buffer(还原,5)、G250蛋白快速染色试剂、若干蒸馏水实验仪器、耗材:蛋白电泳仪、制胶仪、水平摇床、15ml离心管、5ml移液器、微量移液器、1.5ml离心管配制溶液:l 配制10%APS溶液:-20度保存0.5g APS + 5ml蒸馏水、2.5g APS + 25m

36、l蒸馏水 l 配制200 ml电泳缓冲液:CW0045 Tris-Glycine SDS(ph8.3,10)20 ml Tris-Glycine SDS + 180 ml 蒸馏水l 配制1 ml loading buffer:200 ul 5loading buffer +800 ul蒸馏水实验步骤:一制胶:1. 参照凝胶模具说明书,装配好凝胶模具。2. 根据分离蛋白的大小配制分离胶和浓缩胶。SDS-PAGE分离胶的浓度与最佳分离范围SDS-PAGE分离胶浓度最佳分离范围6%胶50-150kD8%胶30-90kD10%胶20-80kD12%胶12-60kD15%胶10-40kD 3. 配制10

37、%分离胶:将不同体积的30%Acr-Bis(29:1)、分离胶缓冲液和双蒸水在小烧杯或试管中混合。加入10%APS和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。配制SDS-PAGE分离胶分离胶浓度凝胶体积所需各组分体积(单位:ml)双蒸水30%Acr-Bis(29:1)分离胶缓冲液(4)10%APSTEMED10%5ml2.081.671.250.050.00210ml4.173.332.50.10.00415ml6.255.03.750.150.00620ml8.36.750.20.0084. 待胶灌至距离玻璃板顶端1.5cm的时候停止灌胶,加入蒸馏水水封。静置40分钟至1小时。5. 待分离

38、胶凝固后(水层胶层中间出现折线),倒掉蒸馏水,用滤纸将水溶液吸干。6. 配制5%浓缩胶: 配制5%SDS-PAGE浓缩胶凝胶体积所需各组分体积(单位:ml)双蒸水30%Acr-Bis(29:1)浓缩胶缓冲液(4)10%APSTEMED2ml1.140.340.50.020.0024ml2.280.6810.040.0046ml3.421.021.50.060.0068ml4.561.362.00.080.0087. 将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端。注意:灌胶速度要快,防止凝胶。8. 将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。静置20分钟,等待浓缩胶聚合。9. 待凝胶聚合后,

39、小心地拔出梳子,以免破坏加样孔。赶走气泡。二 SDS-PAGE电泳:1. 在电泳槽的内外槽灌至电泳缓冲液。2. 制备样品:1) 植物蛋白样品:根据植物蛋白定量结果,计算蛋白提取液加入量,制备上样溶液。蛋白提取液 + 5上样缓冲液 + 蒸馏水制备的样品,煮沸5分钟,12,000 rpm离心5分钟,取上清,上样。2) 全细胞裂解液: 可以直接上样,上样20l,约40ug。 3. 上样: K562全细胞裂解液上样顺序如下: 泳道12345678910样品1上样缓冲液Marker样品1样品2样品3样品4样品5样品6样品71上样缓冲液体积10l5 l20l20l20l20l20l20l20l10l4.

40、电泳:浓缩胶80V,约20分钟,分离胶100V,约1小时。四、 考马斯亮蓝染色 注:将提取的植物蛋白进行电泳,电泳后进行考马斯亮蓝染色。全细胞裂解液电泳后,进行western blot检测。1. 将电泳后的PAGE 胶取出放入容器中,加入适量蒸馏水(以充分覆盖PAGE 胶为 宜),加热至沸腾后5分钟,弃去蒸馏水;2. 加入适量考马斯亮蓝染色液(液面覆盖凝胶即可)加热至沸腾后5分钟,弃染色液;3. 加入适量蒸馏水,加热至沸腾后5分钟,弃蒸馏水,重复此步骤至背景清晰。 4. 观察拍照。Western Blot溶液配制:l 配制500 ml 1TBST溶液:50 ml TBST(ph8.3,10)+

41、 450 ml 蒸馏水l 配制100 ml 5%牛奶封闭液:4度保存5克脱脂奶粉+ 100 ml 1TBSTl 配制100 ml转膜缓冲液(甲醇):CW0044 Tris-Glycine(ph8.3,10)10 ml Tris-Glycine + 20 ml 甲醇 + 70 ml 蒸馏水 (4度保存)一转膜及染色实验材料:NC膜、滤纸、转膜缓冲液、丽春红染色试剂实验仪器、耗材:转膜仪实验步骤:1. 电泳完成后,小心打开玻璃板,去除浓缩胶,将分离胶剥离后,放入转膜缓冲液中平衡。2. 用剪刀剪相同大小的NC膜及滤纸,放入转膜缓冲液中平衡。3. 转膜:(半干转)1) 将平衡好的3层滤纸平铺于转膜槽底

42、部。滴加转膜液润湿。2) 将胶平铺在滤纸上,赶平去气泡。3) 将平衡好的NC膜平铺在胶上,用玻璃棒赶平,确保膜与胶之间没有气泡。4) 再将3层滤纸平铺于膜上,赶平。5) 盖好转膜槽上盖,压紧。插上电极,50mA/膜,转膜1小时。转膜:(湿转)150mA/膜,转膜1.5小时4. 丽春红染色1) 将转移后的膜完全浸入丽春红染色液中,摇动3-5分钟。2) 蒸馏水漂洗膜2-3次,直至膜上出现清晰条带。3) 再次用蒸馏水漂洗,去除染料。 二封闭实验材料:5%脱脂奶 封闭液实验步骤:用封闭液将膜室温封闭1小时三抗体检测:检测-actin,分子量43KDa实验材料:5%脱脂奶封闭液、抗-actin鼠单克隆抗

43、体、山羊抗鼠IgG(H+L)HRP、TBST实验步骤:1. 在6 ml 5%的脱脂奶中加入2 l抗-actin鼠单克隆抗体(稀释度为1:3000)。2. 将膜浸入到一抗稀释液中,室温孵育1小时,或者4 孵育过夜。3. TBST漂洗7次,每次5分钟。4. 在10 ml 5%的脱脂奶中加入1 l山羊抗鼠IgG(H+L)HRP(稀释度为1:10000)。5. 将膜浸入到二抗稀释液中,室温孵育1小时。6. TBST漂洗7次,每次5分钟。四显影实验材料:DAB显色液实验步骤:1. 将试剂A和B以1:19的体积比混匀后即为DAB显色工作液。2. 将配制好的DAB工作液滴加到印迹膜上,孵育1-5分钟,显色。

44、3. 将膜放入蒸馏水中,终止反应。ELISA检测实验材料: 包被液、蛋白、一抗、二抗、封闭液、漂洗液PBST、显色液TMB、终止液、脱脂奶粉实验所需试剂,仪器及耗材:酶标仪,酶标板,酶标条,恒温箱或者水浴锅,待测样本。实验前准备:1. 将水浴锅或者恒温箱调整温度至37度。2. 配制1PBST:50 ml PBST+ 450 ml 蒸馏水3. 配制封闭液10%封闭液:10g脱脂奶粉+ 100 ml 1PBST实验步骤:1. 包被:用包被液将蛋白稀释到2g/ml,每孔加入100l,4度过夜,或37度孵育2小时。蛋白原始浓度:3.2mg/ml每组蛋白需要量:(100l122 g/ml)/3.2 mg

45、/ml=0.75 l将0.75ul蛋白溶液加入至1.2ml包被液中,混匀即可。以上溶液配制时,需要扩大样本体积。2. 漂洗:每孔加入300 l PBST,漂洗3遍。3. 封闭:加入10%脱脂奶粉200 l,4度过夜,或37度孵育2小时。4. 漂洗:每孔加入300 l PBST,漂洗3遍。5. 一抗反应:(一抗稀释液PBST)每孔加入一抗100 l,37度孵育30-45分钟。一抗需进行5个梯度的浓度稀释,每个梯度设置2个重复,设置空白对照2个。具体如下:编号123456789101112稀释度1:5万1:5万1:25万1:25万1:125万1:125万1:625万1:625万1:3125万1:3125万水水6. 漂洗:每孔加入300 l PBST,漂洗3遍。7. 二抗反应:(二抗稀释液10%脱脂奶粉PBST)每孔加入二抗100 l,37度孵育20分钟。8. 漂洗:每孔加入300 l PBST,漂洗5遍。9. 显色:加入100 l TMB工作液,37度孵育10分钟。10. 终止:加入50 l 终止液。11. 检测:将样品放入酶标仪中,在450nm处检测。

展开阅读全文
温馨提示:
1: 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
2: 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
3.本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
5. 装配图网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
关于我们 - 网站声明 - 网站地图 - 资源地图 - 友情链接 - 网站客服 - 联系我们

copyright@ 2023-2025  zhuangpeitu.com 装配图网版权所有   联系电话:18123376007

备案号:ICP2024067431-1 川公网安备51140202000466号


本站为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,本站只是中间服务平台,本站所有文档下载所得的收益归上传人(含作者)所有。装配图网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容本身不做任何修改或编辑。若文档所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知装配图网,我们立即给予删除!