LeicaSp2共聚焦操作手册

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1、Leica TCS SP2激光共聚焦显微镜系统操作手册、荧光显微镜Leica DMRE的使用A :步距调节B:电动升台按钮C:电动降台按钮D:微调E:上限设置F:下限设置1、观察、扫描转换拉杆2、卤素灯开关3、透射光探测器开光横档4、荧光光路开关5、荧光滤镜转盘 1: DAPI; 2: TRITC; 3: FITC; 4: SCAN6、镜头侧DIC棱镜转盘7、与镜头相配DIC滤块8、起偏器9、检偏器10、镜头侧DIC棱镜微调旋钮11、光强调节纽12、减光滤光片13、孔径光阑14、视场光阑选择合适的镜头Leica TCS SP2镜头配置镜头类型使用介质放大倍率/数值孔径编号HC PL APO C

2、SDRY10X /0.4506511HC PL APO CSDRY20X/ 0.7506513HC PL APO CSDRY40 X 0.85/ CORR506140HC PL APO Ibd.BCOIL63X /1.4506192Leica TCS SP2 AOBS 镜头配置镜头类型使用介质放大倍率/数值孔径编号HC PL FLUOTARDRY10X/0.3506505HC PL FLUOTARDRY20X/0.5506503HCX PL APOOIL40X/1.25-0.75506176HC PL APO Ibd.BCOIL63X/1.4506192HCX PL APO CSOIL100X

3、/1.40-0.70506038WATER HCX APO L U-V-IWATER63X/0.9506148荧光观察荧光光路开关至“O”位,转轮至“ 1.0X”位,转换拉杆完全推进,荧光滤块换到相应号位(1: DAPI; 2: TRITC; 3: FITC; 4: SCAN)图像输出扫描荧光光路开关至“I”位,转轮至“UV”位,转换拉杆完全拉出,荧光滤块换到4: SCAN)荧光观察(以油镜观察为例)1、样品正面朝上正确放在显微镜样品台上,点上镜油。2、长按电动升台按钮,使镜头和样品上镜油接触,调节微调旋钮,找到样品。3、将光路转换成荧光观察位置,找到预扫描目标,将光路转换至扫描状态。二、Le

4、ica LCS软件的使用(一)、Leica confocal software 界面软件面板介绍左:File View Macro Tools Window Helpnm 400500700800TCS_SP2_RSInstituteUsernameScan ModexyzFormat512 * 512Speed400 Hzlinage Dim. x238.10Image Dim. y238.10jrnlinage Dim. z0.00Voxel-Size465.03 X465.03nmxnAv. Line1Av. Frame1Z.Pos.-0.02ZWide Pos.-22129.80jrn

5、ObjectiveHCX PL APO lbGain PMT 10VGain PMT 20VGain PMT 30VOffset PMT 10%Offset PMT 20%Offset PMT 30%Offset PMT Ti0%Gain PMT Tra0VPinhole AU1.00airyBeginEndZoom1.00Sections1hardware legendTBegin.Series、 EndTCS-menu: accquire view 3D process quantify application右:image windows(二)、设置参数打开软件,默认在Acquire面板

6、中,mode扫描模式为xyz, Format扫描像素为 512x512, average line/frame average 为 1。Mode扫描模式:Format空间扫描模式:xyz xzy 时间扫描模式:xt xyt xzt xyzt 光谱扫描模式:xyA xzKFormat扫描像素一般设置为1024 x1024。average line 一般设为 4 或 8。(三)、软件具体的操作使用单荧光道扫描多荧光扫描DIC图像扫描荧光与DIC图像同时扫描多层扫描时间序列扫描光谱扫描ROI扫描FRETFRAPLIVE MODE多方法组合荧光强度分析单荧光扫描1、按Acquire按钮中的Beam键打

7、开光路设置对话框窗口2、点击Mode选择扫描模式,如平面扫面xyz3、点击Format选择扫描像素,一般用512x512或1024x10244、点击Average line / frame average选择获取图像时平均的次数:4-8次5、双击相应荧光素或染料方法,如FITC、TRITC等6、点击continuous,优化图像质量用快捷钮Z Position调节到最佳层面,点击Q LUT使图像颜色变为伪彩Glow O&U模式 (观察样品荧光强度),用相应PMT调节荧光亮度,Zoom调节电子放大倍率。点击Stop点击Beam path中的save键,保存个人的扫描方法7、点击single键扫描

8、获取图像8、save保存图像到硬盘上。多荧光标记1、按Acquire按钮中的Beam键打开光路设置对话框窗口2、点击Mode选择扫描模式xyz3、点击Format选择扫描像素512x512或1024x10244、点击Average line / frame average选择获取图像时平均的次数5、双击相应荧光素或染料方法,如FITC6、点击continuous,优化图像质量点击Q LUT使图像颜色变为伪彩Glow O&U模式,用快捷钮Z Position调节到最佳层面, 用相应PMT调节荧光亮度,Zoom调节电子放大倍率。Stop点击Beam path中的save键,保存个人的扫描方法其他荧

9、光同样操作后7、点击Beam path中Sequential Scan,将个人的多种荧光扫描方法添加到面板中,选择betweenframes obetween lines各个通道一线一线分先后扫描几乎同时成像between frames各个通道分先后扫描先后成像 (多用此法)between stacks多层扫描中,先扫完一个通道的多层,再扫另一个通道的多层8、点击series键扫描图像9、 点击overlay获取叠加图像,选中叠加图片,单击右键send to - experiment -selection (raw)(保存选中的图片的原始格式,扫描像素一定,固定大小,单通道图片可以在leica

10、软件中再编辑,overlay图片不能再编辑)selection (snapshot)(保存选中的图片的抓图模式,显示大小)All Snapshot(保存抓图模式,整个窗口)9、save保存图像到硬盘上。DIC图像扫描1、 将显微镜DIC棱镜调整至与观察用镜头倍数相配,如镜头为63x,DIC棱镜就调到40/60 的位置2、镜头侧棱镜由BF调整到与观察用镜头型号相配,如镜头标示为8/0.17/D,棱镜就调到D3、双击Beam path面板方法中的Transmission4、点击continuous,优化图像质量用快捷钮Z Position调节到最佳层面,打开signal面板,用signal面板中T

11、r PMT Gain调节图像亮度,Tr offset调节图像对比度(值不宜过小),Zoom调节电子放大倍率。点击Beam path中的save键,保存个人的DIC扫描方法5、点击single键扫描获取图像6、save保存图像到硬盘上。荧光与DIC图像同时扫描1、 将显微镜DIC棱镜调整至与观察用镜头倍数相配,如镜头为63x, DIC棱镜就调到40/60 的位置2、镜头侧棱镜由BF调整到与观察用镜头型号相配,如镜头标示为8/0.17/D,棱镜就调到D3、双击Beam path面板方法中的Transmission4、点击continuous,优化图像质量用快捷钮Z Position调节到最佳层面,

12、打开signal面板,用signal面板中Tr PMT Gain调节图像亮度,Tr offset调节图像对比度,Zoom 调节电子放大倍率。点击Beam path中的save键,保存个人的DIC扫描方法荧光图像扫描方法如前保存5、点击Beam path中Sequential Scan,将个人的荧光扫描方法和DIC扫描方法添加到面板中, 选择 between frames。6、点击series键扫描图像7、点击overlay获取叠加图像,选中叠加图片,单击右键send to - experiment - selection (raw)(保存选中的图片的原始格式,扫描像素一定,固定大小,单通道图片

13、可以再编辑,overlay图片不能再编辑)selection(snapshot)(保存选中的图片的抓图模式,显示大小,图片不再能编辑)All Snapshot(保存抓图模式,整个窗口,图片不再能编辑)8、save保存图像到硬盘上。多层扫描1、点击continuous,优化图像质量用快捷钮Z Position调节不同层面,点击Q LUT使图像颜色变为伪彩Glow O&U模式观 察样品荧光强度,相应PMT调节荧光亮度,Zoom调节电子放大倍率。然后选择需要扫描 的起始、终止层面,分别按begin、end键,保存起始、终止层面位置,select选择扫描的张 数Others可以自由选择扫描层数或是扫描

14、厚度2、单荧光标记样品直接点击series键扫描图像多荧光标记样品 点击Beam path中Sequential Scan,将个人的多种荧光扫描方法添加到 面板中,选择between frames,点击series键扫描图像。3、save保存图像到硬盘上。多层图像的叠加(一)平面叠加选中多层图像的原始文件,点击process面板中的3D projection maximum apply(二)动态叠加1、选中多层图像的原始文件,点击process面板中的3D projection animation maximum2、Rotation面板,图像旋转围绕的轴角度。选择animation面板。选择f

15、rame叠加张数,选择旋转方式:full turn 360度旋转,half turn 180 度旋转,quarter turn 90度旋转,angle自定义角度旋转。3、Apply生成3d文件,右键选中文件,Export .avi格式的文件,可以选择播放的速度。时间序列扫描(一)固定时间间隔1、按Acquire按钮中的Beam键打开光路设置对话框窗口2、点击mode中带时间的扫描模式:xyt3、点击continuous,优化图像质量4、点击Time Series面板,选择扫描间隔时间AT或选择最小扫描间隔Minimize,选择扫描 张数Frames,点击Complete time生成总时间5、

16、点击series开始扫描6、save保存图像到硬盘上选中扫描好的文件,右键Export .avi格式的文件(二)多个时间间隔组合1、按Acquire按钮中的Beam键打开光路设置对话框窗口2、点击mode中带时间的扫描模式:xyt3、点击continuous,优化图像质量4、点击Time Lapse面板,就第一个时间段进行定义,点击Start,再点击Time Series面板, 选择扫描间隔时间AT或选择最小扫描间隔Minimize,选择扫描张数Frames,点击Complete time生成总时间再依此定义第二个时间段。5、点击series开始扫描。6、save保存图像到硬盘上多重荧光图像扫

17、描结合Sequential Scan即可。光谱扫描只能进行单激发单通道接受。1、按Acquire按钮中的Beam键打开光路设置对话框窗口2、点击mode中带入的扫描模式:xy入3、双点击接受光谱条,选择光谱开始接受范围如:500nm520nm,点击K begin,再选择结束接受范围如:700nm720nm,点击K end(光谱最小接受范围5nm)4、点击select选择扫描张数。5、点击continuous,稍稍优化图像质量6、点击series开始扫描7、save保存图像到硬盘上ROI扫描1、按Acquire按钮中的Beam键打开光路设置对话框窗口2、点击Mode选择扫描模式,如平面扫面xyz

18、3、点击Format选择扫描像素,一般用512x512或1024x10244、点击Average line / frame average选择获取图像时平均的次数:4-8次5、双击相应荧光素或染料方法,如FITC、TRITC等6、点击continuous,优化图像质量用快捷钮Z Position调节到最佳层面,点击Q LUT使图像颜色变为伪彩Glow O&U模式(观察样品荧光强度),用相应PMT调节荧光亮度,Zoom调节电子放大倍率。点击Stop点击Beam path中的save键,保存个人的扫描方法7、扫描laser强度降到08、点击ROI,画出感兴趣区域,点击config,选中相应lase

19、r, ok9、扫描laser强度恢复到开始状态。10、点击single键扫描获取图像。11、save保存图像到硬盘上。荧光强度分析1、按quality按钮Profile(线性荧光强度分析)一条线上的荧光强度Histogram(面积荧光强度分析)ROI区域的大小及其中的平均荧光强度Stack profile (多层荧光强度分析)某区域内多层荧光强度的变化Material(材料的分析)2、选择某一种分析方式后,Viewer图像上画线段或ROI区域Graph 所画线段或ROI区域的荧光强度曲线Statistics所画线段或ROI区域的荧光统计数据3、Generate report 将数据导出Save

20、 report as 将 Viewer、Graph、Statistics 显示的图像、数据保存Export as将Graph、Statistics显示的数据保存为文本格式Applications(一)FRAP1、设置漂白及漂白前后参数漂白前扫面几张图像,每张图像的间隔时间漂白几次漂白后扫描几张图像,每张图像的间隔时间2、设置漂白区域、漂白光源及光强度3、running4、荧光恢复数据的统计5、report保存导出数据(二)FRET1、设置并保存扫描donor和accepter的参数2、设置漂白区域、漂白光源及光强度,和漂白次数3、run4、荧光共振能量传递数据5、report(三)LIVE M

21、ODE1、Basic单一时间间隔2、Advanced多时间间隔组合Job 1 time intervals:扫描时间间隔Frames: infinite or numberNext job job 23、new 设置 job 2PROCESSING(一)Arithmetic and Boolean Logic图像的加、减、乘、除等算法(二)Conversion图像比特的转换(三)Editing图像的合并、拆分(四)Enhancement图像亮度、对比度、gamma值、phase (位移)等参数的调整(五)Extend Focus从3D图像转成2D图像(六)Image Filers滤镜功能(七)Materials材料分析(八)Dye finder荧光染料划分(九)Segmentation图像分割(十)3D visualization and animation图像投影及动画

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