使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知的结合位点(精品)
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使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知的结合位点TANSFAC是德国生物工程研究所开发的真核生物基因调控转录因子数据库,是当今世界上最大的转录因子数据库,包括顺式元件、基因、转录因子、细胞来源、分类和调控位点核甘酸分布6个子库。TANSFAC 5.4版本收录有4774种转录因子蛋白信息,结合位点信息11537个,以及相关基因1928个,参考文献9095条,对于顺式元件的分析功能非常强大。现在的版本TANSFAC 6.0应该包含更多信息。1.其主页:http:/www.gene-。进入主页后先注册,登录。点击TANSFAC进入数据库。2.点击SEARCH,进入SEARCH页后点击factor3.选择factor name,输入待查转录因子名称,例如:sp14点击人类的sp15.进入sp1的页面, 点击BS,点击sp1下游基因的GENE accession no,如G000193BS条目解释为Binding SITEG000193的页面
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