基因差异性表达分析系列产品课件

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1、 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryAtlas（11852）SmartLiving ColorsMatchmakerAdvantage厂家优势技术厂家优势技术 Innovative Tools To Accelarate Discovery基因差异性表达分析系列产品基因差异性表达分析系列产品 Innovative Tools To Accelarate Discovery一一.mRNA水平上差异表达基因的获得水平上差异表达基因的获得 Innovative Tools To Accelarate Discovery此类产品的客户群此类产品的客户群 I

2、nnovative Tools To Accelarate DiscoveryAtlas Arrays 系列产品介绍系列产品介绍 Innovative Tools To Accelarate Discovery Innovative Tools To Accelarate Discovery Innovative Tools To Accelarate DiscoveryArray Array 的的 用用 途途寻找样本之间在寻找样本之间在mRNAmRNA水平上表达差异的基因（已知）水平上表达差异的基因（已知）Innovative Tools To Accelarate Discovery转基因

3、和基因突变对功能的影响转基因和基因突变对功能的影响 鉴定与之相关的基因和信号鉴定与之相关的基因和信号疾病和肿瘤学研究疾病和肿瘤学研究 研究疾病的分子机制研究疾病的分子机制药物方面的研究药物方面的研究 药物的作用靶点和相关的路径药物的作用靶点和相关的路径环境危害的影响环境危害的影响 生理反应的分子机制生理反应的分子机制临床样品的诊断临床样品的诊断 鉴定疾病类型和发病阶段鉴定疾病类型和发病阶段 Innovative Tools To Accelarate Discovery 尼龙膜尼龙膜 Innovative Tools To Accelarate Discovery产品特点产品特点经过筛选适合杂

4、交的经过筛选适合杂交的200-600200-600碱基的碱基的cDNAcDNA片段。片段。目前有人、小鼠、大鼠的芯片，覆盖面广。目前有人、小鼠、大鼠的芯片，覆盖面广。随芯片提供标记探针用的随芯片提供标记探针用的CDS Primer MixCDS Primer Mix可用同位素可用同位素/生物素进行标记生物素进行标记588588个基因以下的膜可用凝胶成象系统进行分析个基因以下的膜可用凝胶成象系统进行分析 Innovative Tools To Accelarate Discovery生物素检测系统生物素检测系统 Innovative Tools To Accelarate Discovery产品

5、种类产品种类1.2 Array1.2 Array肿瘤肿瘤细胞周期细胞周期心血管心血管神经生物学神经生物学应急反应应急反应 Innovative Tools To Accelarate Discovery其其 他他 配配 套套 产产 品：品：Qiagen的的mRNA纯化纯化Ambion的的RNA沉淀剂沉淀剂Epicentre的的9902K生物素标记试剂盒生物素标记试剂盒生物素检测试剂盒生物素检测试剂盒Smart cDNA 扩增试剂盒扩增试剂盒 Innovative Tools To Accelarate Discovery Glass Arrays Innovative Tools To Acc

6、elarate Discovery产品特点产品特点近近8080个碱基的单链个碱基的单链cDNAcDNA点在玻片上，不带任何重点在玻片上，不带任何重复序列和同源性序列复序列和同源性序列目前有人、小鼠、大鼠的芯片，有目前有人、小鼠、大鼠的芯片，有10811081个基因个基因（Human 3.8Human 3.8有有38003800个），覆盖面广个），覆盖面广随芯片提供标记探针用的随芯片提供标记探针用的CDS Primer MixCDS Primer Mix和玻片和玻片杂交液及洗脱液杂交液及洗脱液芯片适用于市场上大多数的芯片扫描仪（规格芯片适用于市场上大多数的芯片扫描仪（规格75x25x1mm75x

7、25x1mm）可用任何荧光团标记探针（可用任何荧光团标记探针（Cy3,Cy5,BODIPY,Cy3,Cy5,BODIPY,FITC,Alexa Fluor dyes,Texas Red FITC,Alexa Fluor dyes,Texas Red Innovative Tools To Accelarate Discovery玻玻 片片 产产 品品 种种 类类Human 3.8（3800个基因的个基因的80-base oligo）Human 1.0（1081 个基因的个基因的80-base oligo）Rat 1.0（1081 个基因的个基因的80-base oligo）Mouse 1.0（

8、1081 个基因的个基因的80-base oligo）Innovative Tools To Accelarate Discovery其其 他他 配配 套套 产产 品品Qiagen的的mRNA纯化纯化Ambion的的RNA沉淀剂沉淀剂生物素标记试剂盒生物素标记试剂盒生物素检测试剂盒生物素检测试剂盒Smart cDNA 扩增试剂盒扩增试剂盒 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryAtlas Plastic Human 8K Microarray8300个已命名基因的个已命名基因的Long oligos点在塑料片基上点在塑料片基上塑料片基大小为塑料片基大小

9、为 8 cm x 12 cm独特的独特的Long oligos设计，近设计，近80个碱基的长度个碱基的长度 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryPlasticNylon基因数量基因数量83001176、588结合的片段结合的片段80200-600探针标记方法探针标记方法同位素同位素同位素同位素荧光荧光生物素生物素/同位素同位素灵敏度灵敏度高高高高低低高高间距间距分辨率分辨率中中中中高高低低PhosphoimagePhosphoimageFluorescentPhosphoimageautoradiogram scannerautoradiogram是

10、否可以重复使用是否可以重复使用是是是是（34次）次）非特异性杂交影响非特异性杂交影响高高低低高高检测设备检测设备Glass380080否否几种几种Array的相互比较的相互比较 Innovative Tools To Accelarate Discovery竞争厂家竞争厂家 Innovative Tools To Accelarate Discovery二二.SSH杂交试剂杂交试剂PCR-Select Substraction Kit卖卖 点：点：无需同位素无需同位素阳性率高阳性率高对低表达量的对低表达量的RNA同样有效同样有效 Innovative Tools To Accelarate D

11、iscovery销售指导销售指导总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒（QIAGEN）PCR Kit(1905-Y)TA克隆试剂盒克隆试剂盒（QIAGEN/UA Cloning、Clontech advanTAge）质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒/晶泰晶泰PCR-Select Differential Screening KitNorthern相关相关kit（Ambion/S&S)Smart PCR cDNA 合成试剂盒合成试剂盒 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryDD-PCR试剂试剂Delta Differencial Display Kit传

12、统方法，比传统方法，比SSH的假阳的假阳性率高，且操作复杂性率高，且操作复杂卖卖 点：点：随机引物设计较长，扩增重复性好随机引物设计较长，扩增重复性好90对引物组合，覆盖性好对引物组合，覆盖性好LD-PCR需要做需要做PAGE电泳电泳总总RNA的抽提试剂的抽提试剂 Innovative Tools To Accelarate Discovery总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒（QIAGEN）K1910-Y/1;8430-1/2TA克隆试剂盒克隆试剂盒（QIAGEN/UA Cloning、Clontech advanTAge）质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒/晶泰晶泰Northern相关相

13、关kit（Ambion/S&S)Smart PCR cDNA 合成试剂盒合成试剂盒 Innovative Tools To Accelarate Discovery全长基因及相关序列的获得全长基因及相关序列的获得 Innovative Tools To Accelarate Discovery Innovative Tools To Accelarate DiscoverySMART RACE 3&5 end Amplification Kit卖卖 点点无接头连接无接头连接(这是最关键的优点）这是最关键的优点）操作步骤少（这也是一个关键的操作步骤少（这也是一个关键的 优点）优点）SMART合成

14、全长合成全长cDNA可同时获得可同时获得5和和3的末端片段的末端片段起始起始RNA用量只需用量只需 50ng/1000cells Innovative Tools To Accelarate Discovery销售指导销售指导QIAGEN总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒QIAGEN质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒TA克隆试剂盒克隆试剂盒（QIAGEN/UA Cloning、Clontech advanTAge）Innovative Tools To Accelarate DiscoverySMART cDNA Library Construction Kit卖卖 点点无接头连接无接头连接

15、(这是最关键的优点）这是最关键的优点）全长（这也是一个关键的全长（这也是一个关键的 优点）优点）无需甲基化无需甲基化定向（定向（Sfi I)三种阅读框同时表达三种阅读框同时表达一步质粒化一步质粒化(loxP)起始起始RNA用量只需用量只需 Innovative Tools To Accelarate Discovery销售指导销售指导总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒（QIAGEN）噬菌体包装蛋白噬菌体包装蛋白（Epicentre MaxPlax Lamda Packaging Extracts）cDNA筛选试剂盒筛选试剂盒（ClonCapture）S&S的杂交膜的杂交膜Ambion的

16、生物素标记试剂盒及杂交试剂盒的生物素标记试剂盒及杂交试剂盒Ambion的的RNA Later Innovative Tools To Accelarate Discovery销售指导销售指导基因组步行试剂盒基因组步行试剂盒 Innovative Tools To Accelarate Discovery基因表达时空及剪切的确定基因表达时空及剪切的确定 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryMTE膜膜Human Multiple Tissue Expression Array 76种人的组织和肿瘤细胞系种人的组织和肿瘤细胞系的的polyA+RNA点阵点阵

17、Mouse RNA Master Blot 2 2 种 小 鼠 的 组 织 的种 小 鼠 的 组 织 的polyA+RNA点阵点阵 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryMTC膜膜是将是将mRNA电泳后转移到膜上电泳后转移到膜上这不仅可以确定表达谱还可以确定是否有不同的剪切这不仅可以确定表达谱还可以确定是否有不同的剪切 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryLiving Living ColorsColorsTMTM荧光蛋白荧光蛋白 绿色荧光蛋白(GFP&EGFP)蓝色荧光蛋白(EBFP)黄色荧光蛋白(EYFP

18、)Innovative Tools To Accelarate Discovery基因的表达与调空基因的表达与调空 Innovative Tools To Accelarate Discovery原核表达系统原核表达系统 昆虫表达系统昆虫表达系统 酵母表达系统酵母表达系统 Innovative Tools To Accelarate Discovery 逆转录表达系统逆转录表达系统Retro-XMSCVPantropicPrimary cellsHematopoietic,embrynic stem,embryonal carcinoma cellsMammalian or nomammali

19、an Innovative Tools To Accelarate Discovery腺病毒表达系统腺病毒表达系统 Innovative Tools To Accelarate Discovery腺病毒在寄主细胞中呈游离腺病毒在寄主细胞中呈游离态，基因瞬时表达态，基因瞬时表达可侵染处于分裂期或非分裂可侵染处于分裂期或非分裂期的寄主细胞期的寄主细胞高水平的蛋白质表达高水平的蛋白质表达双载体系统的操作双载体系统的操作病毒的效价可达病毒的效价可达 1012 pfu/ml平均可插入平均可插入8kb的外源片段的外源片段会引起体内的免疫反应会引起体内的免疫反应长期、稳定的基因表达，可长期、稳定的基因表达，

20、可以遗传以遗传只能侵染分裂期的寄主细胞只能侵染分裂期的寄主细胞中度的蛋白表达水平中度的蛋白表达水平单一载体操作单一载体操作病毒效价达病毒效价达 106 pfu/ml平均可插入平均可插入6.5kb的外源片段的外源片段不会引起体内免疫反应不会引起体内免疫反应腺病毒表达系统腺病毒表达系统 逆转录病毒表达系统逆转录病毒表达系统 腺病毒载体与逆转录病毒载体的比较腺病毒载体与逆转录病毒载体的比较 Innovative Tools To Accelarate Discovery酵母杂交系统酵母杂交系统 Innovative Tools To Accelarate Discovery酵母杂交系统酵母杂交系统阳

21、性率高阳性率高三个不同的启动子三个不同的启动子表达三个不同的报表达三个不同的报告基因告基因质粒上带有半抗原质粒上带有半抗原 Innovative Tools To Accelarate Discovery酵母杂交系统酵母杂交系统 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryMutagenesis Kit Diversity PCR Random Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：通过降低通过降低PCR反应中的反应中的Mn+和和dGTP的浓度来的浓度来增加增加PCR反应的错配率，产生随机突变，这种突变反应的错配率，产生随机突变，这种突变的分布是

22、均匀的。的分布是均匀的。Transformer Site-Directed Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：定点将突变位点通过定点将突变位点通过PCR引物带入目标质粒中引物带入目标质粒中 Innovative Tools To Accelarate DiscoveryMutagenesis Kit Diversity PCR Random Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：通过降低通过降低PCR反应中的反应中的Mn+和和dGTP的浓度来的浓度来增加增加PCR反应的错配率，产生随机突变，这种突变反应的错配率，产生随机突变，这种突变的分布是均匀的。的分布是均匀的。Transformer Site-Directed Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：定点将突变位点通过定点将突变位点通过PCR引物带入目标质粒中引物带入目标质粒中NoImage Innovative Tools To Accelarate Discovery怎样拓展怎样拓展Clontech的市场的市场