PDB数据库中查找蛋白质结构数据
上传人:ta****u
文档编号:137910213
上传时间:2022-08-19
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1. 查找蛋白质结构,在检索框输入关键字或名称。.在线观看三维输入内容:比如2DC34. 选择3D view,可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建, 且数据量较大,需要较长的时间才能在窗口显示。5. 蛋白结构显示的参数设定:脚本选项:一、下载三维数据文件1. 在查询结果窗口的右边找到以下图型。如图:选择 Download Files。2. 确定下载的文件类型,一根据你要使用蛋白质结构数据而定。选择 PDB FileCrext.3. 用写字板打开pDb文件,可以看到蛋白映据库文件实商也是文本文件。 自定义设定4. 下载Pymol,并安装。点DOWNLOAD进入下载,选择windows版本,并安装(需要pay monhy )。或到此网站下载:选择win32,1.7.1.1版本。并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接安装。安装如图: 使用详情参见教程,注意打开程序需要找到python的安装目录:C:Python27PyMOL,找 到文件,双击启动程序。打开 或使用RasMol软件进行三维视图分析,步骤同上。
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