中国生物医学文献数据库(CBM)检索方法与技巧

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1、 文摘索引数据库 北京大学医学图书馆信息咨询部北京大学医学图书馆信息咨询部 刘春艳刘春艳主要内容n中国生物医学文献数据库(CBM)n中文生物医学期刊文献数据库(CMCC)n中国医学学术会议论文数据库(CMAC)中国生物医学文献数据库nCBM简介n检索方法与技巧 基本检索 主题检索 分类检索 期刊检索 作者检索 索引检索 限定检索 定题检索n检索结果的处理n检索实习n习题1. CBM简介n中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约 40 万条。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的

2、各个领域。n中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识管理: 美国国立医学图书馆最新版医学主题词表; 中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表; 中国图书馆分类法 医学专业分类表。 1. CBM简介n 中国生物医学文献数据具有如下特点: n 词表辅助检索功能:检索系统具有多种词表辅助检索功能,建有主题词表、中英文主题词轮排表、分类表、期刊表、索引词表、作者表等多种词表,且有丰富的注释信息。n 检索入口多:除 30 多个检索入口外, 更提供特色的主题词检索、分类检索、第一著者检索、文献类型、资助项目和参考文献等检索方式。n检索功能完备:定题检索、限定检索、截词检索、通配符检索,各

3、种逻辑组配检索功能会大大提高检索效率。n全文获取:目前 CBM 已经实现了与维普全文数据库的链接功能,对于 1989 年以来的全文,可以直接链接维普全文数据库。CBM有三个版本:光盘版: CBMdiscWeb版:CBMweb 系统集成版:SinoMed2. 检索方法与技巧n 基本检索n 主题检索n 分类检索n 期刊检索n 作者检索n 索引检索n 限定检索n 定题检索2.1基本检索n基本检索过程包括3个步骤 :n例如,查找题目题目中含有“高血压高血压”有关文献。第1步,从检索入口的下拉菜单中选择“题目”;第2步,输入检索词“高血压”;第3步,点击检索按钮,基本检索完成。 2.1基本检索n为缩小检

4、索范围,可以进行二次检索。二次检索是在已有的检索结果中再检索,与上一个检索词之间的关系为“AND”。 例如,在1999-2003发表的题目中含有“高血压”的文献: 重新选择“检索入口”“出版年”,在检索框内输入相应的检索词“1999-2003”,选中“二次检索”,点击检索按钮,进行二次检索。 2.1基本检索n可以用单字通配符 ? 替代一个字符: 如检索式“血?动力”,可检索出含有以下字符串的文献:血液动力、血流动力等等。 注意 ? 必须以半角状态输入。n可以用任意通配符 * 替代任意个字符: 如检索式“肝炎*疫苗”,可检索出含有以下字符串的文献:肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎

5、灭活疫苗等等。n可以用半角引号”检索含有“()”、“-”等特殊字符短语的文献: 例如检索有关“邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯”的文献,需加半角引号。n可以用逻辑运算符AND、OR、NOT进行逻辑组配检索: 如异烟肼 AND 结核 NOT 肺结核,可检索出除肺结核外其他结核病中有关异烟肼的相关文献。2.1基本检索2.2主题检索 n主题检索是基于文献内容的主题概念进行检索,有利于提高查全率和查准率。n主题检索的依据 : 医学主题词表(MeSH)中译本 中国中医药学主题词表2.2主题检索n主题检索过程包括6个步骤。n例如,用主题词途径查找“高血压的治疗”有关文献。第1步,从检索入口的下拉菜单中选择“

6、中文主题词”。第2步,输入检索词“高血压”。第3步,点击“查找”按钮。查找结果列出所有含有“高血压”的款目词和主题词。浏览查找结果,找到主题词“高血压”。第4步,点击“高血压”。结果显示该主题词可组配的副主题词、主题词的详细解释和所在的树形结构。可以根据检索需要,选择是否“加权检索”、 “扩展检索”。 “加权检索”可提高检索结果的相关性。“扩展检索”对该主题词及其下位词检索进行选择。第5步,选择相应的副主题词。系统默认“扩展副主题词”进行检索。 “高血压的治疗”选择副主题词“治疗”,将包含“药物疗法”等14个下位副主题词。第6步,点击“主题检索”按钮。2.2主题检索2.3分类检索 n分类检索是

7、按照中国图书馆分类法 医学专业分类表中分类号和分类名进行检索。n分类检索过程包括6个步骤。n例如,查找“婴幼儿麻疹的传播方式”有关文献。第1步,从检索入口的下拉菜单中选择“类名”。第2步,输入检索词“麻疹”。第3步,点击“查找”按钮。查找结果列出所有含有“麻疹”的分类名和对应的分类号。通过浏览查找结果,找到“婴幼儿麻疹”对应的分类名“小儿麻疹”和分类号R725.111。第4步,点击“小儿麻疹”。结果显示小儿麻疹可组配的复分号。系统默认“扩展检索”。第5步,选择相应的复分号。“婴幼儿麻疹的传播方式”的复分号选择“传播途径”第6步,点击“分类检索”按钮。2.3分类检索 2.4期刊检索 n期刊检索是

8、根据刊名、出版地、出版单位及期刊主题词等相关信息进行检索。 n期刊检索过程包括6个步骤。n例如,查找“中华医学会北京分会出版的医院管理方面的期刊,并查找2004年第6期刊载的文献”。第1步,从检索入口的下拉菜单中选择“出版单位”。第2步,输入检索词“中华医学会北京分会”。第3步,点击“查找”按钮。查找结果列出中华医学会北京分会出版的所有期刊名称。浏览查找结果,找到“医院管理”方面的期刊“中华医院管理杂志”。第4步,点击“中华医院管理杂志”。结果显示期刊出版年代和期输入框。同时显示中华医院管理杂志的详细信息。可以根据检索需要,选择期刊刊名或代码检索。期刊代码”是医科院信息所为每种期刊分配的内部编

9、码,期刊更名时内部编码不变。用“期刊代码”检索,有助于更名期刊的检索。第5步,选择相应的出版年代和期。查找 “2004年第6期刊载的文献” ,期刊年代输入“2004”,刊期输入“6”。第6步,点击“期刊检索”按钮。2.4期刊检索 2.4期刊检索n也可以通过页面中期刊导航,按照学科分类,依次点击即可找到该学科类目下的期刊名称。如预防医学、卫生学医疗卫生制度与机构中华医院管理杂志。重复上述第4-6步,完成期刊检索。 2.5作者检索 n作者检索过程包括3个步骤。n例如,查找“北京大学医学部韩济生教授发表的文章”。第1步,在检索入口输入作者姓名“韩济生”。第2步,点击“查找”按钮。查找结果列出所有姓名

10、中含有“韩济生”二字的作者及其发表文献篇数。点击“韩济生”第一作者后相应的图标,即可查找沈岩作为第一作者发表的文献。第3步,点击“韩济生”。这是“韩济生”发表的所有文献。浏览检索结果发现,很多著者单位不是北京大学医学部。重新选择“检索入口”“地址”,在输入框内输入相应的检索词“北京大学”,选中“二次检索”,点击检索按钮,进行二次检索。2.6索引检索 n索引检索可依据数据库中所有可检索字段中的所有单个字和部分词组、主题词和期刊名称等词组构成的索引列表,进行浏览、选词检索。n索引检索过程包括3个步骤。n例如,查找“老年帕金森病”的文献。第1步,从检索入口输入框中输入检索词“帕金森”。第2步,点击“

11、查找”按钮。查找结果列出所有含有“帕金森”的索引词。浏览查找结果,找到准确的索引词“老年帕金森病”。第3步,点击“老年帕金森病”。2.7限定检索 n“限定检索”是把年代、文献类型、研究对象等常用的限定条件整合到一个对话框,方便检索。 限定年代范围; 限定文献类型; 限定年龄组; 限定性别; 限定研究对象是人类或者动物; 限定妊娠状态、体外研究;n限定内容可以多选,同一组内的限定为“OR”关系,不同组之间的限定为“AND”关系。n限定完成后,点击“确认”按钮完成限定设置,点击“检索”按钮完成检索2.7限定检索n以“高血压”检索课题为例,要限定 在19952005年核心期刊上发表的综述文献:n可以

12、在限定检索页面的年代限定中输入“19952005”;n同时钩选 “核心期刊”“综述”的选择框;n最后点击“确认”按钮,点击“检索”。n红色字样显著标出本次检索的限定条件。n限定内容可以通过清除按钮进行取消。2.8定题检索 n“定题检索”可定制和跟踪某一课题的最新文献。n(1)检索策略的定制过程包括两个步骤:第一步如常检索,得到检索结果,如检索课题“高血压的治疗”;第二步,点击“定题检索”后,输入定题检索的用户名和密码。 首次使用该项功能则需要注册,注册是免费的。在“检索策略名称”输入框中给当前检索史一个名称,比如本例中输入“有关高血压治疗的中文文献”点击“存储检索策略”,将检索史存储下来, 即

13、完成了检索策略的定制过程。2.8定题检索n(2)跟踪检索最新文献的过程包括三步:第一步:点击“定题检索”按钮,输入用户名和密码,登录定题检索功能;第二步:在检索策略名称列表中选取需要跟踪的检索策略名称。本例选择“有关高血压治疗的中文文献”的策略。第三步:点击“最新文献检索”,得到上次检索与本次检索间隔期间该检索策略命中的新文献;检索式中会显示两次检索之间的时间间隔。n点击重新检索则不限定时间把本检索策略重新检索一遍;点击删除检索策略即取消该检索策略的定制和检索。3. 检索结果的处理 检索结果的显示、打印、保存、标注。n显示格式有 “题录格式”、“文摘格式”和“详细格式”。 n排序格式:包括作者

14、、年代、期刊。 当不指定排序格式时,记录按数据入库时间显示。显示排序要限定在10000条以内。 n输出: “文本显示”表示全屏显示检索结果,便于打印。 “文件保存”表示把检索结果保存到本地,形成文档。n“标注”记录指点选题录前的复选框。 标注所选定的记录后,点击“显示”按钮,显示被标记的记录。n点击右上角的全文获取图标即可链接到相应的维普数据库中的全文。 4. 检索实习n例1:腹痛的并发症 n检索课题中包含两个主要概念:腹痛、并发症n采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检索。n第一步,输入相应的中文主题词 “腹痛”为了不遗漏文献,主题检索有关设置为:主题词扩展、不加权 ,组配相应的副主题词“

15、并发症”, 并设置为“扩展副主题词” ;n第二步,在缺省字段中输入(腹痛 OR 腹疼)AND 并发症进行基本检索;n第三步,点击“检索历史”,根据尽量不遗漏文献的需要, 在检索框中输入 #1 OR #2 或者点选相应检索式前的方框,再点击“OR”按钮,进行检索。例1:腹痛的并发症n检索策略:n#1 主题词=腹痛/CO/全部树n#2 (腹痛 OR 腹疼)AND 并发症n#3 #1 OR #2 习题(采用主题词/副主题词途径检索)n1. 检索有关“新生儿窒息的诊断”的综述文献 n2. 检索“北京大学的王宪2002年发表的有关动脉粥样硬化”的文献n3. 检索“女贞子治疗老年便秘”的文献 nCMCC简

16、介n检索方法与技巧 自由词检索 作者检索 单位检索 刊名检索 字段检索 表达式检索 组配检索n检索结果的显示1.CMCC简介n是由解放军医学图书馆数据库研究部开发的中文生物医学文献目录型数据库。n收录范围:基础医学,临床医学,预防医学,医学生物学,中医药学,药学,医院管理,医学信息学等卫生相关信息。nCMCC新,更新速度快,收录期刊全(1400余种),可弥补CBM时滞长的缺点,特别有利于课题的查新和追踪检索。nCMCC由1994年正式出版,半月一期,按年度存放文献数据。CMCC基本检索语法n? 代表一个字符,? 代表一个汉字n*代表0-N个字符n在检索词输入框内键入以空格分隔的两个词,则两词之

17、间是AND的关系n作者、刊名项检索时采用精确匹配方式,请输入全名。如需模糊检索,可在检索词后加 * 。 CMCC基本检索语法n概念扩展:检索时如选中“概念扩展”,系统会自动搜索疾病名称同义词表,并以逻辑或的关系进行运算,以提高查全率。例如,检索“小儿麻痹症”方面的文献,只要输入下面任一个词:脊髓灰质炎;脊髓前角灰质炎;小儿麻痹;脊灰;小儿惊瘫;polio;poliomyelitis; infantile paralysis;central myelitis;系统即可自动检索出所有含有小儿麻痹症同义词的文献。CMCC有三个版本:n单独的CMCC n与CMCI集成在一起n与CMAC集成在一起200

18、7年以年以前的数据前的数据最新的最新的数据数据一、单独的CMCC系统2. 检索方法与技巧 自由词检索 作者检索 单位检索 刊名检索 字段检索 表达式检索 组配检索检索界面二、与CMCI集成在一起n检索方法与技巧基本检索高级检索引文检索n检索结果的处理1.基本检索1.基本检索1.基本检索检索示例n检索胡大一以第一作者身份发表的文献n检索北京大学第三医院发表的文献 北京*第三*医院高级检索高级检索示例:禽流感的流行病学检索结果的处理4. CBM与CMCC的比较n一般中文生物医学文献课题的检索过程 课题的主题分析和策略制定检索CBMdisc数据库(课题的回溯检索,了解课题的主要文献)结合现刊和网检文

19、献的阅读,每半月检索一次CMCC(掌握最新文献信息,定题跟踪检索)课题修正循环检索课题完成4.1 CBM的特点n主题检索功能强:CBM是受控的检索数据库,具有主题检索功能。它既可对单个主题词加权检索,也可扩展检索,还可以选择副主题词进行方面组配,对查全率和查准率都有一定保证。nCBMWIN,界面友好,方便操作,检索途径多,还可以进行分类途径检索,还可以进行年限的限制。n收录1979年以来的文献题录 ,可进行课题的回溯检索。nCBM属于浅标引,用主题词检索途径易造成漏检,要配合自由词检索。nCBM更新慢,平均每四个月更新一次。4.1 CBM的特点4.2 CMCC的特点n新、快、全。更新快,半月一期。与印刷版比较,平均时滞为3个月,很好地补充了CBM的时间差。收录生物医学期刊1100余种,几乎囊括了(90%以上)生物医学正式出版的期刊。n采用关键词标引,非受控数据库,没有主题词和分类检索途径,查全率和查准率难以保证。nCMAC简介n检索方法与技巧 自由词检索 作者检索 单位检索 会名检索 字段检索 表达式检索 组配检索2. 检索方法与技巧会名检索

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