（推荐）实验室常用实验方法

《（推荐）实验室常用实验方法》由会员分享，可在线阅读，更多相关《（推荐）实验室常用实验方法（70页珍藏版）》请在装配图网上搜索。

1、如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!总RNA的提取（Trizol法提取）在收集到生物材料之后，最好能即刻进行RNA制备工作。若需暂时储存，则应以液氮将生物材料急速冷冻后，储存于-80冷冻柜。在制备RNA时，将储存于冷冻柜的材料取出，立即以加入液氮研磨的方式打破细胞，不可以先行解冻，以避免RNase的作用。1. 提取组织RNA时，每50100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解；提取细胞RNA时，先离心沉淀细胞，每5-10 106个细胞加1ml Trizol后，反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞；2. 将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温1530C下放置5分钟

2、；3. 在上述EP管中，按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿，盖上EP管盖子，在手中用力震荡15秒，在室温下（1530）放置23分钟后，12000g（28）离心15分钟；4. 取上层水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇，在室温下（1530）放置10分钟,12000g（28）离心10分钟；5. 弃上清，按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇进行洗涤，涡旋混合，7500g（28）离心5分钟，弃上清；6. 让沉淀的RNA在室温下自然干燥；7. 用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。 RT合成cDNA1、 使RNA展开与

3、OligoDT结合，25ul体系用2ug的RNA，整个溶液体积小于15ulRNase-free H2O(DEPC水)9.5ulOligo DT1ulRNA 溶解液2ul 浓度过高则减少RNA溶解液的量，但要求RNA溶解液的量+RNase-Free H2O(DEPC水)的量为12.5ul如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!70,10min让RNA充分展开；立即至于冰上0,5min 10min 让Oligo DT 与其充分结合。不能超过15ul。（此时间正好用于配下个体系液体）继续在PCR管中加入5buffer5uldNTP5ulRnasin0.625ul(0.5ul)MMLV-RT1ulR

4、Nase-Free H2Oo.875ul(1ul)总共是25ul37，60min 延伸94，10min 灭活逆转录酶，即合成cDNAPCR 实验室常用DNA聚合酶有三种：TaKaRa TaqTM，TaKaRa EXTaqTM和PyrobestTM DNA Polymerase。TaKaRa TaqTM是一般的DNA聚合酶，保真性较差，但价钱便宜，一般用于基因表达的检测等。TaKaRa EXTaqTM是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶，具有一定的保真性，而且其扩增得到的PCR产物3端附有一个“A”碱基，如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。PyrobestTM

5、 DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶，其特点是保真性极高，扩增得到的PCR产物为平滑末端。如果进行基因的扩增请使用此酶。1. 按下列组成在PCR反应管中调制反应液：TaKaRa TaqTM或TaKaRa EXTaqTM的配方ReagentQuantity, for 50l of reaction mixture10X PCR buffer （Mg2+ free）5 lMgCl2（25mM）如TaKaRa TaqTM加3 l 如TaKaRa EXTaqTM加4 l如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!2.5mM dNTP mix4 l 10

6、M Primer 上游1 l10M Primer下游1 lTemplate DNA1 lTaq或EXTaqDNA Polymerase0.25 lSterile deionized waterUp to 50lTotal50 l /SamplePyrobestTM DNA Polymerase的配方ReagentQuantity, for 50l of reaction mixture10X Pyrobest buffer 5l2.5mM dNTP mix4l 10M Primer上游1l10M Primer 下游1lTemplate DNA1lPyrobestTM DNA Polymeras

7、e0.25lSterile deionized waterUp to 50lTotal50l /Sample 反应总体积根据实际情况进行调控，可以做2050l以节约试剂； 将上表各成分加入到0.2ml或0.5ml灭菌的PCR薄壁管中； 如果不用PCR仪的加热盖，在反应混合液的上层加30 50l 的矿物油防止样品在PCR的过程中蒸发；2. 按以下程序进行PCR扩增。PCR反应条件视模板、引物等的结构条件不同而各异，在实际操作中需根据具体的情况以及PCR结果而进行优化。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!StepTemperature, C Time, minNumber of cycles

8、Note起始变性94951-31变性94950.5-225-35退火温度比理论退火温度大概低5C，再根据反应结果优化退火37-700.5-2延伸70-75根据扩增产物的大小每分钟延伸1000bp最终延伸70-75101反应结束后，抽取扩增样品5l，用琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果，用DNA marker判断扩增片段的大小或冷冻保存，以备以后分析使用。RT-PCRProtocol: TaKaRa One Step RNA PCR Kit (AMV) 1. 按下列组成在PCR反应管中调制反应液ReagentQuantity, for 50lof reaction mixture10One Step R

9、NA PCR Buffer5l25 mM MgCl210l10 mM dNTP mix5lRNase Inhibitor (40 U/l)1l如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!AMV-Optimized Taq1lAMV RTase XL (5 U/l)1l上游特异Primer (20 M)1l下游特异Primer (20 M)1l实验样品RNA（1 g Total RNA）1lRNase Free dH2O24lTotal50l /Sample1. 反应总体积根据实际情况进行调控，可以做2050l以节约试剂；2. 将上表各成分加入到0.2ml或0.5ml灭菌的PCR薄壁管中；3. 如

10、果不用PCR仪的加热盖，在反应混合液的上层加30 50l 的矿物油防止样品在PCR的过程中蒸发；2 按以下条件进行反应StepTemperature, CTime, minNumber of cyclesNote逆转录50301逆转录酶失活9421变性940.525-35退火37-650.5退火温度比理论退火温度大概低5C，再根据反应结果优化延伸72根据扩增产物的大小Taq酶每分钟延伸1000bp最终延伸72101如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!反应结束后，抽取扩增样品5l，用琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果，用DNA marker判断扩增片段的大小或冷冻保存，以备以后分析使用。琼脂糖核酸

11、电泳1. 用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净，放在制胶平板上，封闭模具边缘，架好梳子；2. 根据欲分离DNA片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶：准确称量琼脂糖干粉，加入到配胶用的三角烧瓶内，定量加入电泳缓冲液（一般2030 ml）；3. 放入到微波炉内加热熔化。冷却片刻，加入一滴荧光染料，轻轻旋转以充分混匀凝胶溶液，倒入电泳槽中，待其凝固；4. 室温下3045分钟后凝胶完全凝结，小心拔出梳子，将凝胶安放在电泳槽内；5. 向电泳槽中倒入电泳缓冲液，其量以没过胶面1mm为宜，如样品孔内有气泡，应设法除去；6. 在DNA样品中加入10体积的载样缓冲液（loading buffer），混匀后，

12、用枪将样品混合液缓慢加入被浸没的凝胶加样孔内；7. 接通电源，红色为正极，黑色为负极，切记DNA样品由负极往正极泳动 (靠近加样孔的一端为负)。一般60100V电压，电泳2040min即可；8. 根据指示剂泳动的位置，判断是否终止电泳；9. 电泳完毕，关上电源，在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置，并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产物的大小。 琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围琼脂糖凝胶浓度线形DNA的最佳分辨范围（bp）0.5%1,00030,0000.7%80012,0001.0%50010,0001.2%4007,0001.5%2003,0002.0%502,000如果您需要使

13、用本文档，请点击下载按钮下载!胶回收纯化DNA1. 琼脂糖电泳，将特异电泳带用刀切下放入到EP管中，称琼脂糖带的重量；2. 按照每100mg加400l的量加入binding buffer，放入到EP管振荡器中，4555温育振荡，直到所有的琼脂糖都溶解（大概要5分钟）；3. 取出纯化柱，将上述溶解液转移至柱中，室温下放置2分钟，8,000rpm 离心1分钟，弃EP管中的液体，将纯化柱放回EP管中；4. 加500l的wash buffer至柱中，8,000rpm 离心1分钟。弃管中的溶液；5. 重复操作4步的操作1次，最后将纯化柱放入EP管中10,000rpm离心30秒，除去痕量的wash buf

14、fer；6. 将纯化柱放入一个新的EP管。加3040l H2O或者elution buffer至纯化柱膜的中央，在37或50下放置2分钟，10,000rpm离心1分钟洗脱DNA，将EP管中的DNA溶液放在-20保存。7. 注：若想要不电泳而直接纯化DNA溶液，只需要在第2步中按100l液量加400l的binding buffer,其余的步骤不变。大肠杆菌质粒DNA的提取（碱裂解法）此方法适用于小量质粒DNA的提取提取的质粒DNA可直接用于酶切PCR扩增。1. 取1.5ml细菌培养物于EP管中，4000rpm离心1分钟，弃上清液，使细菌沉淀尽量干燥；2. 将细菌沉淀重悬于用冰预冷的100 l溶液

15、I (50 mmol/L葡萄糖，10 mmol/L EDTA pH 8.0，25 mmol/L Tris-HCl pH 8.0) 中，剧烈振荡；3. 加入200 l新配制的溶液II(0.2 mol/L NaOH，1SDS（m/v）)，盖紧EP管口，快速颠倒离心管5次，以混合混合物，确保离心管的整个内表面与溶液II接触，不要涡旋，置于冰浴中；4. 加入150 l预冷溶液III(每100 ml 的溶液III中含60 ml 5 mol/L 乙酸钾，11.5 ml冰乙酸，28.5 ml H2O)，盖紧EP管口，反复颠倒数次，使溶液III在粘稠的细菌裂解物中分散均匀，之后将管置于冰上35分钟；5. 在最

16、大转速下离心5min，取上清液于另一新EP管；6. 用两倍体积的乙醇室温沉淀双链DNA，振荡混合于室温放置2分钟，最大转速离心5分钟；7. 小心吸去上清液，将离心管倒置于滤纸上，以使所有液体都流出，在将附于管壁的液滴除尽；8. 加1ml 70乙醇洗涤沉淀，振荡混合，用12,000g离心2分钟，弃上清，将开口的EP管置于室温使乙醇挥发，直至EP管中内没有可见的液体存在（510分钟），用适量的如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!ddH2O溶解；9. 用0.5l的RNase 37温育510分钟；10. 电泳鉴定。乙醇沉淀DNA1. 加入1/10体积的乙酸钠（3 molL，PH=5.2）于DNA

17、溶液中充分混匀，使其最终浓度为0.3 molL；2. 加入2倍体积用冰预冷的乙醇混合后再次充分混匀置于-20中1530分钟；3. 12,000 g离心10分钟，小心移出上清液，吸去管壁上所有的液滴；4. 加入1/2离心管容量的70乙醇，12000g离心2分钟，小心移出上清液，吸去管壁上所有的液滴；5. 于室温下将开盖的EP管的置于实验桌上以使残留的液体挥发至干；6. 加适量的ddH2O溶解DNA沉淀。酶 切1. 酶切前确定待切样品的浓度, 并选择合适的限制性内切酶和配套Buffer。2. 在离心管中加入如下成分：10Buffer 1l 待切样品 xl酶 0.5-1l 加水补足10l3. 混匀样

18、品并短暂离心使样品沉于管底。4. 将离心管置于37中温育1-3hr，若待切样品为PCR产物，则可将反应时间适当延长。5. 用未酶切的质粒作为对照，琼脂糖电泳鉴定酶切结果。注：当酶切样品用于回收而不是鉴定时，可按比例适当加大反应体积。双酶切可选用二者活性都较高的Buffer或者通用Buffer，但要注意不能有星反应。）连 接1. 连接前先电泳确定待连接载体与片段的浓度。2. 在离心管中加入如下成分：10连接Buffer 1l 待连接的样品（胶回收产物或PCR产物，载体与片段的mol比为13-5）如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!连接酶0.5-1l 加水补足10l3. 混匀样品并短暂离心使

19、样品全部沉于管底。4. 将离心管置于连接酶要求的温度孵育适当的时间（根据不同公司的酶的要求而定，一般为22 1-3hr或16连接过夜）。连接完的样品可直接用于转化，也可放4冰箱短期保存。感受态细胞的制备1. 挑取适当菌株的E.coli 单菌落接种于2ml SOB培养液中，37摇床过夜。2. 取0.5-1ml过夜培养的菌液转种到50ml SOB中，18剧烈震荡，直到A600达到0.6。3. 将培养物转移到50ml离心管中，4 4,000rpm/min离心10min。同时在冰浴上配置TB溶液。4. 弃上清，将离心管倒置于滤纸上，使培养液被吸干。5. 取1ml刚配的TB溶液打散菌体沉淀，再加入15m

20、l TB（1/3体积的起始培养液），冰浴10-15min，4 4,000rpm/min离心10min。6. 弃上清，沉淀重悬于4ml TB（1/12.5体积的起始培养液），冰浴10min。7. 加入280l DMSO，缓缓滴入并轻轻摇晃，使其充分混合均匀，冰浴10min。8. 将菌液分装于EP管中，-80或液氮冻存。9. 取两管感受态细胞分别加入1l无菌ddH2O（阴性对照）和1l纯质粒（阳性对照）进行转化（见后），以检测感受态的质量。阴性对照平板上应该无菌落生长，阳性对照平板上菌落数目的多少显示感受态效率的高低。SOB的配制：蛋白胨 20g酵母提取物 5gNaCl 0.58gKCl 0.18

21、6g100Mg+溶液 10ml溶解并加水定容至1L，12120min高压蒸汽灭菌100Mg+溶液： MgCl26H2OMgSO47H2O溶解并加水定容至100ml，12120min高压蒸汽灭菌TB溶液的配制：如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载! 1M KCl 5ml0.55M MnCl2 2ml0.5M CaCl2 0.6ml0.1M K-Pipes(pH 6.7) 2mlddH2O 10.4mlTotal 20ml注：上述溶液均需高压蒸汽灭菌处理0.1M K-Pipes(pH=6.7)的配制： 称取3.02g Pipes粉末溶于80ml dd H2O中，此时粉末不能完全溶解，用10N

22、KOH或KOH固体调节PH值，只有当PH接近6.7时粉末才能完全溶解，此时当小心少量地加入KOH直至达到所需PH值。转 化1. 取100l感受态细胞于冰浴上融化。2. 加入1l纯质粒或连接产物，轻轻吹打混匀，冰浴30 min。3. 将菌液放入42水浴中热激90秒，立即放入冰浴中2 min。4. 加入0.9ml SOC，于37恒温摇床上200rpm1hr温育。5. 将菌液4000rpm/min离心3min，留200l上清将菌体打散，均匀涂布于含适当抗生素的琼脂平板表面，平板于37倒置培养过夜。i. 注：新倒的平板可于37培养箱中预先放置数小时至过夜干燥。ii. 当转化的是TA克隆连接产物时可在菌

23、液中加入8l 1M IPTG和40l 20mg/ml X-gal以进行蓝白斑筛选。重组子的筛选和鉴定重组子可通过酶切进行鉴定，也可以利用扩增引物通过PCR进行鉴定，阳性重组子能切出所需要的片段或得到相应片段的PCR产物。1. 用牙签挑取平板上的菌落接种于2ml含适当抗生素的LB培养基中，37摇床培养过夜。2. 次日取菌液0.2-0.5ml，13,000rpm3min离心，弃上清，加入20l ddH2O和20l 酚/氯仿，震荡混匀，13,000rpm5min离心。3. 取上清进行琼脂糖电泳，加入载体质粒DNA作为阴性对照，根据质粒大小初步筛选重组子，重组子的泳动速度应该慢于载体质粒。4. 用碱法

24、小量制备可能是重组子的质粒DNA。5. 选取适当的酶，对重组子进行酶切分析，酶切体积均为10l体系。酶切样品进行琼脂糖电泳鉴定是否有所需片段。6. 酶切分析正确的重组子分成两份，一份进行测序反应，另外一份保种。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!7. 若用PCR法鉴定，则在第2步时每个样本取0.5-1.0l 菌液为模板进行PCR反应，每管反应体系最低可少至10l，PCR产物电泳，能得到所需条带的样本进一步提取质粒酶切鉴定或送样品测序。真核细胞的转染该操作以Invitrogen公司的脂质体转染试剂LipofectAMINE为例，其它转染试剂可参照各自的使用说明书进行。1. 在6孔板中接种1

25、-3105细胞/孔，加入2ml完全培养基，置CO2孵箱中37培养过夜。2. 待细胞长到50-80%单层时，在无菌离心管中配制如下溶液：i. 溶液A：将1-2g待转染的超纯DNA稀释到100l无血清培养基中ii. 溶液B：将2-25l LipofectAMINE稀释到100l无血清培养基中3. 混合溶液A和B，轻轻混匀，室温放置15-45min。4. 用2ml无血清培养基轻轻洗涤细胞，加入0.8ml无血清培养基/孔，将脂质体复合物滴加到孔中，轻轻摇晃混匀，置CO2孵箱中37孵育2-24hr。5. 用完全培养基替换转染液，继续培养。6. 24-72hr后检测蛋白质的表达或传代并加入选择性抗生素以筛

26、选稳定表达株。转染细胞的稳定筛选1确定抗生素作用的最佳浓度：不同的细胞株对各种抗生素有不同的敏感性，因此在筛选前要做预试验，确定抗生素对所选择细胞的最低作用浓度。1) 提前24小时在96孔板或24孔板中接种细胞8孔，接种量以第二天长成25%单层为宜，置CO2孵箱中37培养过夜。2) 将培养液换成含抗生素的培养基，抗生素浓度按梯度递增（0, 50, 100, 200, 400, 600, 800 和1000g/ml）。3) 培养10-14天以绝大部分细胞死亡浓度为准,一般为400-800g/ml,筛选稳定表达克隆时可比该浓度适当提高一个级别维持时使用筛选浓度的一半.2转染按前面的步骤进行。3转染

27、72小时后按1:10的比例将转染细胞在6孔板中传代，换为含预试验中确定的抗生素浓度的选择培养基。在6孔板内可见单个细胞，继续培养可见单个细胞分裂繁殖形成单个抗性集落，此时可用两种方法挑选单克隆。1) 滤纸片法：用消毒的5x5mm滤纸片浸过胰酶,将滤纸片贴在单细胞集落上10-15秒，取出粘附有细胞的滤纸片放于24孔板中继续加压培养。细胞在24孔板中长满后转入25cm如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!2培养瓶中,长满后再转入75cm2培养瓶中培养。2) 有限稀释法：将细胞消化下来后做连续的10倍稀释（10-210-10），将每一稀释度的细胞滴加到96孔板中培养，7-10天后，选择单个克隆生

28、长的孔再一次进行克隆。4. ELISA或Western blot检测单克隆细胞中外源蛋白的表达情况由于不同克隆的表达水平存在差异因此可同时挑选多个克隆选择表达量最高的克隆传代并保种。 重组蛋白质的表达、纯化、复性和定量按Qiagen公司的操作手册进行，具体步骤如下。一、重组蛋白质的诱导表达1. 挑取转化有质粒的单菌落，接种于3ml 选择性LB液体培养基中，37 oC，250 rpm/min振摇培养过夜。2. 次日将培养过夜的菌液500 l再接种于10 ml（1:20）选择性LB液体培养基中，37 oC，250 rpm/min振摇培养至光密度（OD600=0.6）时，取1 ml样本作为诱导前标本

29、，10000g离心1 min收集菌体沉淀，20 oC冻存备用。3. 加入1 mol/L IPTG于菌液中，使IPTG终浓度为1 mM，37 oC，250 rpm/min振摇培养45小时。取1 ml样本作为诱导后标本，同上法收集菌体沉淀，20 oC冻存备用。4. 将诱导前后菌体沉淀用20 40 l PBS（pH= 8.0）重悬，加入等体积的2SDS上样缓冲液，煮沸加热5 min，SDS聚丙烯酰胺凝胶（SDS-PAGE）电泳分离，考马斯亮蓝染色3小时后，脱色观察结果。5. 选取诱导成功的细菌克隆，扩大诱导规模，收集菌体沉淀，于20 oC保存，准备做下一步分析及纯化。二、重组蛋白质的分离纯化重组蛋白

30、质的可溶性鉴定1. 将按上法诱导培养后收集的菌体重悬于裂解液1 (Lysis buffer under native conditions )中，然后在80 oC低温冰箱中放置10 min。2. 冰中解冻。3. 在冰浴上用超声破碎仪破菌6次，每次10 sec，间歇10 sec，电压200-300 V。4. 10000g，4oC，离心20 min，取上清（为溶液A），20 oC保存；另将沉淀用同样裂解液1溶解（为溶液B），同样20 oC保存，供后继分析使用。5. 将上述A、B溶液和诱导前后的细菌进行SDS-PAGE电泳，考马斯亮蓝染色，比较分析重组蛋白质的溶解性。如果诱导表达的蛋白质位于A溶液中

31、，则为可溶性蛋白；如果是在B溶液中，则为非可溶蛋白。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!重组蛋白质为非可溶性蛋白（变性条件下）的分离纯化1. 将菌体沉淀溶于适量裂解液2（Lysis buffer under denaturing conditions）中，室温下搅拌和吹打沉淀，避免泡沫生成。2. 10000g，4 oC，离心30 min，收集上清液。3. 将Ni-NTA Agarose充填柱子，并连接于Pharmarcia低压液相层析系统，用5倍柱体积的裂解液2平衡Ni-NTA Agarose，调节A280值至零线。4. 将适量上清液上样到Ni-NTA Agarose柱子中，并用lysi

32、s buffer冲洗至A280值低于0.01。5. 分别用510倍柱体积的清洗液1 和清洗液2（Wash buffer 1 and 2）清洗柱子，直至A280值低于0.01。6. 用洗脱液（Elution buffer）洗脱重组蛋白质，在A280值监测下，收集出现峰线后含有重组蛋白的所有洗脱液。三、重组蛋白质的复性、冻干和定量纯化后的蛋白用梯度降低的尿素溶液缓慢透析，最终用0.01PBS透析，透析后的蛋白质溶液经冻干成粉状。以牛血清白蛋白(BSA)为标准，采用BIO-RAD公司蛋白质定量试剂(protein assay)比色测定蛋白质的含量。肿瘤细胞体外传代培养及保种一. 细胞复苏与培养将液氮

33、或-80oC保存的肿瘤细胞于37oC 水浴, 快速溶化, 用8.0ml培养基混匀已融化的肿瘤细胞悬液, 于1500转/分, 离心3分钟。弃上清, 再吸取8.0ml培养基质混匀细胞沉淀, 再1500转/分, 离心3分钟, 弃上清, 细胞沉淀用1.0ml培养基混匀, 备用。 另取一个75cm2方瓶, 加入14.0ml培养基质, 将上述制备的含肿瘤细胞悬液(1.0ml)加入此方瓶中, 于37oC，5%CO2孵育箱中培养。若此肿瘤细胞悬浮生长, 大约34 天细胞基质会变黄, 5.0ml细胞悬液可传代一个方瓶培养, 可用34个方瓶培养, 一个方瓶中呈对数生长的肿瘤细胞可达11.5107 个, 根据试验所

34、需, 可决定传代的次数。 若此肿瘤细胞呈贴壁生长, 经过34天, 肿瘤细胞生长至80%95% 单层时, 弃上清, 用0.5mM 的EDTA(难消化的肿瘤细胞用0.25%胰酶1.0ml), 处理肿瘤细胞大约 35分钟, 用倒置显微镜观察，当90% 的肿瘤细胞变圆时, 即可用弯管吹打并将消化的细胞转移到15ml离心管中, 于1500转/分下，离心3分钟, 弃上清, 加少许培养基如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!混匀, 可传代3个75cm2方瓶扩大培养。二. 细胞冻存 将对数生长的肿瘤细胞用1个75cm2 方瓶按上述方法收集, 于1500转/分 离心3分钟,弃上清, 用保种液(含10% DM

35、SO的小牛血清)3.0ml混匀, 分别加入到23只保种管中, 写上肿瘤细胞名称, 时间, 保种者姓名, 放-80o C 保存, 次日将它们转移到液氮中保存(注: -80o C下可保存细胞半年至一年, 液氮可保存细胞510年, 甚至更长的时间)。以上所有物品均需经过高温灭菌( 121oC, 30分钟)，培养基质则经过过滤(0.22uM)除菌, 所有操作均必须遵守无菌操作技术, 避免细菌、真菌、病原体、衣原体等污染。肿瘤动物模型的建立将对数生长的肿瘤细胞收集, 用无血清基质10.0ml, 于1500转/分, 离心3min, 连续洗3次, 最后用无血清基质混匀, 用血球计数器计算肿瘤细胞数量(平均5

36、个中方格的细胞计数104 即是肿瘤数/毫升)。 计算完肿瘤细胞总数, 再将肿瘤细胞密度调至4106 个/ml, 每只小鼠腋下接种50ul(即2105个肿瘤细胞), 2周左右可扪及肿瘤小节结。一般选取68周的小鼠，不同的肿瘤细胞接种的数量和动物不一样, 比如LL/2, B16, Hepa 可接种C57和BALB/C 小鼠, NS-1, EL-4, C26, Meth A可接种BALB/C 小鼠, H22接种昆明鼠。从肿瘤接种后可扪及小结节开始, 每3天用游标卡尺量肿瘤纵横大小(单位: mm), 至少连续一个月时间。注意要设计不同的实验组和对照组, 每组动物数一般为510只, 一般接种肿瘤68周后

37、，小鼠的肿瘤可生长至直径为1520mm (即小鼠会濒临死亡)时, 可眼球取血，分离血清并保存血清, 处死小鼠, 取肿瘤组织照相, 取部分肿瘤组织作冰冻组织切片(或-80 保存), 作相应的免疫组织化学染色, 取部分肿瘤组织用3%中性的甲醛固定, 石腊包埋, 作常规HE染色.小鼠尾静脉注射方法在靠近实验台边缘处, 用大培养皿扣住小鼠, 左手抓住小鼠尾巴, 用酒精棉球擦尾巴, 可见到两侧静脉; 注射前应确认针管内无气泡, 注射时由尾尖开始, 顺向刺入。失败后再逐渐移向根部重刺, 若准确刺入静脉内, 推进时无阻力, 一般可注入0.10.5ml。肿瘤蛋白疫苗预防性动物实验如果您需要使用本文档，请点击下

38、载按钮下载! 一般肿瘤蛋白疫苗首次免疫剂量10ug/只小鼠, 与相应佐剂混匀, 在背部皮下注射, 第2次免疫间隔2周, 同样加佐剂在皮下注射； 第3次免疫间隔2周, 同样加佐剂在皮下注射；第3次免疫后2周, 用ELISA检测其血清效价，当效价达到要求时；在接种肿瘤细胞前3天,于腹腔或尾静脉加强注射20ug /只。人脐静脉内皮细胞（HUVEC）培养1. 将15-20cm长的新生儿脐带放入无菌的PBS溶液中储存。（注：4下最多贮存24小时，室温下不超过6小时，否则废弃）2. 用一个钝头的针头扎入脐带静脉管中，用无菌的PBS溶液冲洗3-5次，将污血冲洗干净为止。3. 用手术钳夹紧脐带下端，加入15m

39、l 的胶原酶（1mg/ml）室温下消化15-20分钟，并不时上下摇动脐带。4. 消化完后，将下端手术钳松开，消化液流入一个50 ml无菌离心管中，用无菌的PBS溶液冲洗脐带2-3次。5. 将收集液离心（2000转/分）3分钟。6. 倒去上清，加入10ml M199培养基（加入10U/ml的bFGF），用弯管吹散细胞，将所有液体转入一个用明胶包被好的培养瓶中，37培养。（注：每个培养瓶中加入3-4ml无菌的1%的明胶溶液，摇匀使得明胶溶液完全铺满瓶底，放入37孵育，最少2小时，用前将明胶溶液倒了即可，明胶包被有利于细胞贴壁。）7. 培养24小时后，倒掉培养基，并用无菌的PBS溶液清洗2-3次，洗

40、掉红细胞和死细胞，加入10 ml新鲜的 M199培养基。8. 以后每2天换一次培养基（每次换掉2/3的培养基）。9. 一般培养5-7天，细胞可长满至80-90%单层，这时可以传代。10. 倒掉培养基，用无菌的PBS溶液清洗2-3次，加入2-3ml消化液（0.25%胰酶+0.1%EDTA）消化细胞，在显微镜下观察，一旦细胞变圆，即加入2-3倍的有血清的DMEM培养基终止反应。11. 用弯管将细胞吹打下来，并将所消化的细胞转移到一个50 ml无菌离心管中，2000转/分，离心3分钟。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!倒掉上清,加入10ml新鲜培基,一般一瓶细胞可传代3-4瓶.以后照此传代培

41、养.12. 一般传代2-3代（培养了20天左右）用于做各种实验效果最好。实验动物免疫方案1、抗原: 蛋白质、多肽、细胞器、细胞、组织等。2、免疫方式：皮下注射、腹腔注射、静脉注射、肌肉注射等。3、不同动物免疫所需抗原量（以蛋白免疫为例）18-20kDa 18-20kDa动物 抗原量 最佳抗原量 抗原量 最佳抗原量兔子 20-200 100 50-400 200小鼠 2-40 15 4-60 40大鼠 10-50 30 20-150 50绵羊 100-1000 200 200-1000 400母鸡 20-200 100 50-400 200单位：微克4、免疫方案（以免疫兔子为例）：天数 0 14

42、 28 38 56 66 87注射 x x x x采血 2ml 2ml 2+20ml 2+50-70ml5、注意： 第一次免疫用完全佐剂与免疫原混合，以后加强免疫用不完全佐剂与免疫原混合，采取多点，时间间隔式免疫法。 如果用细胞免疫兔子，那么每次免疫所需细胞量为2-3 x 107 cells。 在连续免疫完三次后，需要少量取血进行ELISA检测，检测所免疫动物的抗体滴度，一般滴度能达到1:10,000-50,000。在处死所免疫的动物前一周应加强一次免疫。 如果用小鼠免疫，可以尾静脉小量采血（大约50l），最后取眼球大量采血（大约500-1000l）；如果用兔子免疫，可以耳缘静脉小量取血(大约

43、2mL)，最后心脏大量取血(50-100mL) 按血清制备的标准方法将血清分离，并且分装成小份，储藏在-80oC。血清制备1. 取血后，37oC下，让血液凝固1到2小时（不加抗凝剂）；2. 4oC冰箱过夜（让血块固缩）；如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!3. 当血清自然析出后， 4oC，3000转/分，离心10分钟，分离血清，弃去不溶物；4. 将血清移至一干净试管，并分装成小份，储藏在-80oC。ELISA一、包被抗原1. 用50mM的碳酸盐包被缓冲液（pH 9.6）溶解抗原，使抗原浓度为10-20 g/ml，加100 l/孔到96孔酶标板，4 oC放置过夜。2. 第二天弃去包被液后，

44、用PBST洗涤3次，每孔加入150 l 1 BSA 37 oC封闭1小时。3. PBST洗涤3次后，每孔加入100 l不同倍比稀释度的血清，并加入对照样品，37 oC孵育2小时。4. PBST洗涤5次后，加入100l稀释后的HRP标记的二抗，37 oC孵育1小时。5. PBST洗涤5次后，显色剂显色20 min后，酶标仪上读取A405吸收值。二、包被细胞1. 在96孔培养板上接种细胞数为1 x 104 cells/well，37过夜培养。2. 第二天用PBS洗涤培养板2-3次。3. 加入125 l/well 10% Formalin（1:10稀释）, 室温下固定15 min。4. 用ddH2O

45、洗涤培养板3次，并晾干，储藏在2-8oC备用。5. 用PBST洗涤3次，每孔加入150 l 1 BSA 37 oC封闭1小时。6. PBST洗涤3次后，每孔加入100 l不同倍比稀释度的血清，并加入对照样品，37 oC孵育2小时。7. PBST洗涤5次后，加入100 l稀释后的HRP标记的二抗,37 oC孵育1小时。8. PBST洗涤5次后，显色剂显色20 min后，酶标仪上读取A405吸收值。l 50mM的碳酸盐包被缓冲液：0.05mol/L pH9.6碳酸缓冲液,4，保存,Na2CO3 0.15克, NaHCO3 0.293克,蒸馏水稀释至100 ml。l ABTS作为底物进行显色反应(1

46、0ml)： 0.2M Na2HPO4 2.4ml 0.1M 柠檬酸2.6ml ddH2O 5ml如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载! ABTS 5mg H2O2(30%) 4 ul（用前加入）注 意： 一般做倍比稀释进行检测，需要有相应的对照血清。 不同的显色系统对应不同的光吸收值。血清学筛选克隆新抗原/新基因一、E.coli/ phage 裂解液预吸附血清1. 将E.coli /phage lysate以1:10-20稀释在TBST溶液中。2. 将4张82mm的nitrocellulose membranes（NC）浸入稀释后的E.coli/ phage lysate中，室温下水平摇动

47、30分钟，取出NC并使膜沥干。3. 用50ml TBST溶液洗膜3次，每次10分钟。4. 用滤纸轻轻吸去膜上的液体。5. 将膜放入50ml封闭液中，室温下水平摇动最少30分钟。6. 将膜从封闭液中取出，用50ml TBST溶液洗膜3次，每次10分钟。7. 将血清按1:5稀释在TBST溶液中，将一张膜放入溶液中，37下轻轻水平摇动10分钟。8. 从血清稀释液中取出膜并丢弃,加入另外一张新膜,37下轻水平摇10分钟.9. 重复步骤8，直至所有4张膜都处理完。10. 除去最后一张膜，收集血清（primary antibody），分装成小份储存于-80冰箱中待用。注意： 该步处理过程是为了去除血清中能

48、与细菌和噬菌体裂解蛋白进行免疫反应的抗体，这样可以减少假阳性率； 一抗不能反复冻融，化冻后不要再次冰冻，可放于4作短暂保存； 可以是病人血清，也可以是免疫血清，如果是病人血清，则需要至少10个病人血清进行混合；二、噬菌体筛选1. 准备NZY agar plates（至少用前24小时倒好），用前在37培养箱中烘烤1-2小时以去除水滴。2. 将过夜培养的XL1-blue MRF细菌2000转/分，离心10分钟，将细菌溶解在10mM MgSO4中，调整细菌浓度为OD如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!600=0.5。3. 融化NZY top，并将NZY top放在50水浴中。4. 将适量的XL

49、1-blue MRF细菌溶液与一定稀释度的phage文库混合，37下共同作用15分钟。 直径90mm平板：200l XL1-blue 细菌+适量的phage文库 直径150mm平板：600l XL1-blue 细菌+适量的phag文库（噬菌斑数量一般保持在3000pfu/90mm; 12000pfu/150mm）5. 将步骤4中的混合液与NZY top溶液混合（200l混合液+3-4mlNZY top溶液；600l混合液+8-10 ml NZY top溶液），倒入到NZY agar plates中，室温下放10分钟左右，然后倒置放于37下培养。6. 当噬菌斑刚好可看到时（大约5-8小时），从培

50、养箱中拿出平板。7. 将NC放入10mM IPTG溶液中完全浸湿，在空中使膜沥干，并做好3个不对称的标记。8. 将IPTG处理好的NC贴在平板上，不留气泡，然后倒置放于37下培养。9. 过夜培养后，第二天早上取出平板，用镊子将膜轻轻掀起，注意不要将培养基粘在膜上。10. 将膜放于50ml TBST溶液中，水平脱色摇床上震荡洗膜3次，每次10分钟。11. 将膜放入50ml封闭液中，水平摇动，封闭4-6小时。12. 在封闭液中加入适当滴度的一抗，水平摇动处理过夜。13. 将膜放于50ml TBST溶液中，洗膜3次，每次10分钟。14. 在封闭液中加入适当滴度的二抗（各个公司的二抗使用滴度不同），室

51、温水平摇动1-2小时。15. 将膜放于50ml TBST溶液中，洗膜3次，每次10分钟，最后用50ml TBS溶液洗膜15-20分钟，取出膜空气中沥干。16. 将膜放入BCIP-NBT显色液中避光显色，水平摇动直到阳性斑点可见为止。17. 从显色液中取出膜放在TBS溶液中，空气中使膜干燥。18. 根据所做的标记,将膜与平板对齐,将平板上对应的阳性克隆区域的培养基挖出放入500l SM buffer中,并加入25 ml chloroform,4贮存（最多可贮6月）。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!19. 第一轮筛选得到阳性克隆需要进行第二轮筛选以去除假阳性并获得阳性单克隆噬菌体。过程如

52、第一轮筛选，只不过用直径90mm平板；具体过程见步骤4，这时所加入的噬菌体溶液是第一轮筛选得到的噬菌体上清（见步骤18），在用前要滴定好噬菌体的滴度，噬菌斑的数量以可区分出单个克隆，同时密度不能太稀为标准（一般100-200 pfu/90mm）。20. 按第一轮相似的过程进行实验，最后显色，确定真正的阳性克隆，并将阳性单克隆所在的培养基挖出放入500l SM buffer中，并加入25 ml chloroform，4贮存（最多可贮存6月）。注意： 封闭液一般可用：5%的脱脂牛奶或1%的BSA溶解在TBST溶液中。 第一轮筛选用150mm的平板；第二轮筛选用 90mm的平板，一般需要筛选至少1

53、x 106 pfu。 认真做好三个不对称的标记，特别在第二轮挑选阳性克隆时要仔细将膜与平板吻合好，不能挑错。三、单克隆剪切1. 取第二轮筛选得到的阳性克隆贮存液上清。2. 将过夜培养的XL1-blue MRF细菌2000转/分离心10分钟，将细菌溶解在10mM MgSO4中，调整细菌溶度到OD600=1.0。3. 在一个EP管中加入：200l XL1-blue MRF细菌+250ul phage stock（步骤1）+1 ul ExAssist helper phage。4. 将以上三种样品混合，37下共同保温15分钟。5. 将样品混合物加入到3 ml LB培养基中，37震荡培养3-4小时。6

54、. 将试管放于65-70水浴20分钟，3000转/分，离心15分钟。7. 将上清转入新的离心管中，已发生剪切的phage particles在上清中（上清可在4下储存1-2月）。8. 将100ul phage 上清+200ul SOLR cells（OD600=1.0）混合，37保温15分钟。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!取步骤8中溶液5-10 ul涂于LB-amp agar plates（amp=50ug/ml），过夜培养。9. 第二天细菌长出，随机挑取单克隆接种到LB-amp培养基中培养过夜。10. 过夜培养细菌分为三部分：（1）提取质粒做双酶切，鉴定外源基因的大小；（2）送样

55、品进行DNA测序（3）加入30-40%的甘油进行保种，分装成小份储存于-80备用。附录：1、SM buffer (1L):(5.8 g NaCl+2.0 g magnesium sulfate+50 ml 1M Tris (pH=7,5)+0.1 g gelatin)2、AP-buffer:(100 mM Tris HCI (pH 9.5); 100 mM NaCl; 5 mM MgCl2)3、10xTBS（1L）：（0.1 M Tris-HCl (pH 8.0)；1.5 M NaCl）4、LB Broth（1L）：（10 g NaCl+10 g of tryptone+5 g of yeas

56、t extract）ELISPOT1. PBS溶解抗原为30 g/ml，加100 l/孔于PVDF膜铺底的96孔灭菌板过夜；2. 第二天吸去包被液后，加5FCS的PRMI 1640培养基100 l封闭1小时，37 oC；3. 准备脾细胞悬液（用氯化铵去除红细胞，制备成单个脾淋巴细胞悬液）；4. 从1 106/孔开始，按1:3的稀释度开始逐孔稀释做不同浓度梯度，并做3个复孔，37 oC静置培养5小时；5. PBS洗35次，生物素化的抗鼠IgG二抗孵育30 min；6. PBS洗35次，链亲和素标记的碱性磷酸酶孵育30 min；7. PBS洗35次，用底物BCIP/NBT显色，显微镜下观察显色反应

57、，显色后及时终止反应；8. 计数每孔中的斑点数目，计算每106个脾细胞中抗体分泌细胞数量。藻酸盐包裹实验1. 将藻酸钠溶于无菌生理盐水，终浓度为1.5%；2. 收集培养的肿瘤细胞，用无血清的培养基洗涤1次，将细胞沉淀重悬于1.5%藻酸钠溶液中；如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!3. 将上述肿瘤细胞悬浮液用1 ml加样枪缓慢滴入磁力搅拌的250 mM CaCl2溶液中，形成乳白色的藻酸盐小珠。继续静置于250 mM CaCl2中30 min即可使用。以上操作步骤均在无菌条件下进行；4. 将第4次免疫后7天的小鼠用苯巴比妥钠0.1ml (按100 mg/kg计) 腹腔注射麻醉，小鼠麻醉后置

58、于解剖台上，切开背部皮肤，皮下植入4粒藻酸盐包裹颗粒，缝合皮肤，外敷手术胶膜；5. 天以后，小鼠经尾静脉注入100 l (按100 mg/kg计) FITC标记的葡聚糖(FITC-Dextran)；6. 20 min后处死动物，取出藻酸盐颗粒，常温下加入1 ml的生理盐水，剪碎研磨颗粒，再加入1 ml的生理盐水,混匀标本，放置1小时，1500 rpm离心5 min。取上清液用荧光酶标仪测定；7. 用不同浓度的FITC-Dextran制备标准曲线。重组腺病毒构建，扩增及纯化基本技术操作（细菌内同源重组AdEasy System）如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!一 目的基因的克隆（以ps

59、huttle-CMV质粒为例）1. 选择适当酶切位点，进行酶切连接，将目的片段插入pshuttl-CMV质粒多克隆位点。如果您需要使用本文档，请点击下载按钮下载!2. 重组质粒鉴定： 酶切鉴定或测序。3. 重组质粒扩增，纯化并准备适量含目的基因的穿梭质粒。4. 用PmeI单酶切线性化重组穿梭质粒，电泳鉴定质粒完全被切开。5. 胶回收线性化质粒，以备共转化使用。二 共转化1 大肠杆菌BJ5183电转感受态制备 从新鲜琼脂板上挑取单个BJ5183细菌，接种于LB培养基中，37振摇过夜。 接种25ml过夜培养物于500ml LB培养基，37振摇，至OD600 达到0.4。 迅速将培养物置于冰浴中30min，至充分冷却。 将菌液转移至预冷的离心管中，4下以2500r/min离心15 min，弃培养液，回收细胞。 以10ml预冷的10%甘油洗涤沉淀，低温离心，共两次。 加约1ml（适量）预冷的10%甘油重悬沉淀，稀释悬液100倍，测量OD600，至稀释浓度为2-31010个细胞/ ml (1.0 OD600约2.51010个细胞/ml)。分装，-80或液氮保存待用。2 病毒骨架质粒转化大肠杆菌，扩增，纯化。3 将1-5l (约1g) 线性化的穿梭质粒及1l（约100ng/l）病毒骨架质粒（如pAdEasy-1）加入至含约40l BJ5183