药学毕业论文中药信息学研究进展

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1、 中药信息学研究进展【摘要】 本文对现阶段中药信息学的内容与特点进行了分析。总结了国内外近几年有突破性的中药信息学科研成果,简要介绍了随机森林、自组织映射、分子对接以及构建种质资源进化树等数据挖掘技术在中药信息学中的应用。阐述了结合现代信息技术的中药信息学对中药现代化发展的推动作用。通过实例指出了中药信息资源建设与维护中涉及到民间药物、植物化学、植物分类学等亟待解决的若干问题,同时论述了对中药信息学进行资源拓展的必要性和国际化的发展道路。 【关键词】 中药信息学；中药数据库；数据挖掘；虚拟筛选；国际植物命名法规；异物同名；同物异名 Abstract： Some outstanding prog

2、resses of relevant research are summarized, whilst the tasks and features of TCM informatics are discussed. The applications of random forest, self-organizing map, molecular docking and phylogenetic tree built with DNA polymorphism data etc. in TCM informatics are introduced. Some typical issues in

3、the construction and maintenance of TCM database, involving ethnomedicine, phytochemistry and plant taxonomy etc., are also discussed with abundant instances. TCM informatics integrating modern IT techniques motivates the development of TCM. The expansion of sources of TCM informatics and its intern

4、ationalization is the fastrack of development. Key words：TCM informatics；TCM database；data mining；virtual screening；International Code of Botanical Nomenclature；synonym；homonym为推进中药现代化的发展,科技部、国家计委、国家经贸委、卫生部、国家药品监督管理局、知识产权局、国家中医药管理局、中国科学院在2002年11月制定了中国第一部中药现代化发展的纲领性文件中药现代化发展纲要(2002年至2010年)。此纲要明确提出了一系

5、列中药现代化发展的重点任务,其中包括建立中药数据库和种质资源库,收集中药品种、产地、药效等相关的数据；同时要求加强多学科交叉配合,深入进行中药药效物质基础、作用机理、方剂配伍规律等研究,积极开展中药基因组学、蛋白质组学等的研究。要求重视中医药基础理论的研究与创新,特别是与中药现代化发展密切相关的理论研究,如证候理论、组方理论、药性理论,探索其科学内涵,为中药现代化提供发展源泉1。经过5年的实践,科技部、卫生部、国家中医药管理局、国家食品药品监督管理局等16个部门在2007年3月又联合发布了中医药创新发展规划纲要(20062020年),确定了“继承,创新,现代化,国际化”作为中医药创新发展的基本

6、任务。新纲要明确定义了中医药泛指中华民族传统医药,包括中医药和民族医药。首次提出了在借鉴现代医药和其他国家传统医药经验的基础上,争取使中医药标准规范成为国际传统医药标准规范的战略目标,并且强调中医药基础数据库和国际化信息库的建设,为适应中医药现代化和国际化发展需求建立创新体系,提高科技支撑能力2。 在这样的政策背景下,中药信息学研究取得了飞速的发展。中药信息学是以计算机为主要工具,首先对蕴藏着大量中药学、化学、药理学和生物医学信息的文献资料进行分析、归类和整编。这包括将中药的原植物、化学成分、药理作用和传统中医药经验理论中的药材性味、方剂配伍、适应症和药效等信息进行数字化处理,再整合大量随机的

7、生物实验和色谱、光谱数据,然后根据研究课题的需要采用适当的数据挖掘方法分析这些数据,从而迅速提取隐含的有价值信息并挖掘出有逻辑性和规律性的知识。这是新的历史条件下中药信息学(TCM informatics)的主要研究内容,也是现代中医药研究的重要组成部分。1 中药信息学发展的新阶段 中药是一个高度复杂的化学物质体系,其复杂性不仅表现在组成方剂的化学成分的复杂性,也体现在方剂与人体相互关系的复杂性。中药通过多途径、多靶点、整体调节的机制发挥药效作用,因此具有系统性特点。长期以来,中药药效物质基础和作用机制研究未能获得根本性突破的重要原因之一是缺乏对中药高度复杂性及系统性进行研究的手段,故如何揭示

8、并系统阐明中药化学物质组成与药效间的复杂关系,是当今中药信息学所面对的严峻挑战。 早期建立的中药数据库大多属于功能相对简单的信息查询系统,即通过对疾病、药理作用、中药方剂等数据的互相关联对中药信息进行管理。当用户输入关键字后系统显示出相关的中药复方、功能主治、组成成分等信息,同时能按相关度和功效权重进行量化排序。这样的系统设计实现了中医药信息的存储与共享3。实际上,近几年中药信息学研究已经从知识共享阶段来到了知识发现(Knowledge Discovery in Database)阶段4,而这个提升过程又是由数据挖掘技术(Data Mining)5的应用来实现的。在国家重点基础研究发展计划(9

9、73)和国家高技术研究发展计划(863)项目资金的支持下,新建的药学数据库在虚拟筛选和数据分析结果的可视化处理方面有了长足的发展6-7。新的中药学数据库与这些先进的技术平台相结合的数据发掘研究,不仅实现了传统中药学的现代化发展,也使中药继续成为国际天然药学研究与新药开发的热点。 数据挖掘本身是一门跨学科的技术。事实上,统计学、数据库技术、机器学习、模式识别、人工智能和可视化等技术都在数据挖掘中起着作用8。因此,很难定义这些学科和数据挖掘间的界限。这些技术在各自的学科领域内有大量的专著可供参考,此处不再赘述,笔者仅针对数据挖掘技术在中药信息学中的应用作一些介绍。先进分析模型的应用提高了对中医理论

10、、药理作用、植物化学、生物实验数据等不同领域的信息进行多维分析的效率,有助于研究人员准确地进行中药研究选题,从而有效地避免低水平的重复性研究。目前,最常用的数据挖掘方法有：决策树、神经网络、粗糙集、模糊集和遗传算法等9。每一种算法都有各自的特点和应用领域,不可能完成所有不同类型的数据挖掘任务。所以,在实际应用中常常采用多种算法相结合对数据进行分析。2 中药信息学研究的新技术、新成果2.1 中药生物活性的虚拟筛选 随机森林模型(random forest)是决策树(decision trees)的集成,当作为预测模型使用时它是一种计算条件概率的描述方法。对于处理和组织大量文献数据具有较强的文本分

11、类性能10。自组织映射(self-organizing map)是一种类似大脑思维的人工神经网络模型,它通过“无监督学习”将高维度的数据进行处理后再以低维(通常是二维)视图表达分析结果,而且映射图上保留原输入样本空间的拓扑性质。于是,在它输出的语义映射图上性质相似的样本是彼此靠近的,反之则位置相对较远。它的突出优点在于适合任何类型的数据,并能够算出数据样本之间的配对间距,特别是那些非矢量数据。例如,符号序列和有机化学分子结构片段序列等11。 利用以上算法的特性,Thomas Ehrman等人在英国的Kings College London新建了一个收录240味常用中药的中药信息数据库,并针对这

12、些药材中已知的8 411个化合物通过随机森林模型构建中药学特征档案。所构建的28个随机森林模型各自包含500棵决策树,它们描述了这些化合物在“清热”、“补气”、“止血”等28个功能与主治分类中的附属关系。再使用自组织映射模型将化合物根据中药学特征档案划归入生物碱、多酚、单萜、二萜等10大植物化学分类中,同时采用Ward聚类法生成自组织映射彩色图谱。由此清晰地将10大类天然成分在中药功能与主治分类中的分布直观地表现出来。例如：甾体类生物碱主要在催吐和治痰热的分区中显示阳性信号,原小檗碱(protoberberine)类生物碱在治湿热分区中显示出强相关性,在该分类项中的中药通常用来治疗黄疸、痢疾和

13、皮肤病12。由Peter Hylands教授领导的位于伦敦的CNMR天然药物研究中心还利用此中药数据库进行了基于小分子结构相似性的虚拟筛选(Virtual Screening)。采用随机森林模型对具有相同生物活性的小分子进行分析,其中针对HIV-1病毒的剪接酶、蛋白酶和反转录酶3个靶标蛋白的虚拟筛选结果预测多味中药具有对HIV-1病毒的多靶点抑制活性。例如,富含单宁酸类成分的山茱萸、石榴、丁香、地榆以及富含黄酮类化合物的银杏、黄芩、桑叶等13。 基于分子对接(molecular docking)的虚拟筛选是针对重要疾病的特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系quantitative str

14、ucture-activity relationship (QSAR)模型,从现有的小分子数据库中(包括天然药物成分、半合成以及全合成化合物)搜寻可与靶标生物大分子结合或符合QSAR模型的化合物进行计算机虚拟筛选研究。其目的是快速地从多达上百万个分子中,发现有潜在生物活性的化合物。用计算机进行的虚拟筛选大大减少了生物实验筛选的化合物数量,既缩短研究周期,又节约研究经费。虚拟筛选方法主要分为基于配体小分子的虚拟筛选(ligand-based virtual screening, LBVS)和基于受体生物大分子结构的虚拟筛选(structure-based virtual screening,SB

15、VS)。在这个领域应用较多的程序有DOCK、FlexX、GOLD、Glide、ICM、FRED 和AutoDock等14。事实证明,虚拟筛选的阳性率(5%30%)远远高于传统高通量实验筛选的阳性率(0.01%0.1%)7。上海中医药大学与上海药物研究所合作,采用基于分子对接的虚拟筛选技术在ACD(Available Chemicals Directory)化合物库中发现了天然产物金丝桃苷是潜在的感冒229E抗原型冠状病毒3CL蛋白酶的新型抑制剂15。2.2 中药材种质资源研究现状 国家自然科技资源平台项目“药用植物种质资源标准化整理、整合及共享试点”于2008年4月正式在北京启动,该项目的前期

16、工程“中国药用植物种质资源信息共享系统数据库”经过3年的发展已经初见成效,收集到野生霍山石斛、宽叶型铁皮石斛、黄果西洋参、野生人参等极为珍稀的濒危种质资源。其中野生霍山石斛在国际市场上价格可达到每千克1万美元16。 现代分子生物学研究发现,中药材(不含矿物药)所依赖的生物资源“物种”的多样性是其基因多态性的结果,而基因多态性检测可在分子水平上进行,它比在形态、组织和化学水平上的检测更能代表其变异类型的遗传标记。由于DNA分子标记直接分析的是生物的基因型而非表现型,所以鉴别结果不受环境因素、样品形态(原生药、粉状或片状)和材料来源的影响,建立在PCR技术基础上的DNA指纹图谱法可为中药品种鉴别提

17、供更加准确可靠的手段17。目前,在药用植物种质资源鉴定、分类、亲缘关系和遗传多样性评价等方面应用较多的DNA分子标记法有RAPD(随机扩增多态DNA)、RFLP(限制性片断长度多态性)、ISSR(简单重复序列区间)、SRAP(序列相关扩增多态性)等18,其中RAPD分子标记技术具有简便、高效、灵敏度高、需要模板DNA量少以及容易实现基因型测定的自动化等特点19。尤其是该技术可以在不知道待测物种特异DNA序列的情况下检测DNA的多态性(DNA polymorphism),由于目前绝大多动、植物中药材DNA序列尚不清楚,因此,在植物资源品种研究方面,RAPD标记相对其它分子标记用于构建基因组指纹图

18、谱和种系发生谱的使用率较高。不同产地植物样品的基因组指纹图谱结果通常应用聚类分析算法来构建进化树或种系发生谱(phylogenetic tree),它通过分支层次或拓扑图形反映出享有共同祖先的一群生物体的系统分类歧异点。这个技术有助于从基因进化的角度挖掘出生物体基因序列与其功能的关系。例如,中国中医科学院中药研究所王瑷琦等人采用RAPD方法对我国二级保护中药杜仲的16个群体、260个个体进行了遗传多样性分析,由Neis遗传一致度和除权成组配对法(UPGMA)得到的聚类图清晰地将来自北京、陕西、河南、湖北、四川和贵州的16个群体分为四大类。该实验结果验证了长期形态学和胚胎学研究的结论,表明杜仲种

19、内存在显著的遗传分化,在形式上表现为不同树皮类型、不同有效成分含量等20。3 中药信息的更新与维护 数据库是需要不断更新与扩充的,对有价值的中药信息不断地收集和整理是保持数据库的有效性、权威性和完整性的必要维护工作。我国中药学巨著本草纲目是李时珍在参考了神农本草经、南朝齐梁时期的本草经集注、唐代的新修本草、宋代的开宝本草和嘉佑本草等历代医药书籍800余部之后写成的。他还坚持深入民间调查,不耻向药农、游医、樵夫、农民、渔民等一切内行人请教,因此本草纲目不仅收录前人了解的1 518种药物,还新增了374种。他为纠正古代本草记载中存在的“品种既烦,名称多杂”、“舛谬差讹,遗漏不可枚数”之弊作出了伟大

20、贡献。近几年,作为传统中药的一个重要分支少数民族药物的研究成果正逐渐增多。由于少数民族医药中蕴藏着不少有开发价值的药物,从有民间临床基础的少数民族药物中开发新型药物已成为当前行之有效的新药开发途径。例如,我国藏医药的开发研究已经取得了丰硕的成果。至2003年全国已有14种藏药进入国家药典,有41种藏药材、94种藏成药被列入卫生部首批部颁标准,还有12种藏药被列为国家中药保护品种,13种藏药被列为新药品种21。因此,广泛地收集和整理民间草药知识对丰富与完善我国的中药信息数据库具有重大意义。 在地方药学专著和植物志中还有大量关于民间药物的信息值得深入发掘。比如鸢尾科(Iridaceae)鸢尾属植物

21、鸢尾(Iris tectorum Maxim.)是作为新增品种“川射干”收载于2005年版中华人民共和国药典。在陕西、四川、广东等地民间用它治疗咽喉肿痛、肠道寄生虫、癥瘕积聚、风湿痛等症,它的提取物富含黄酮类、糖苷类以及鸢尾醛型三萜类化合物22。最新的研究成果表明,从鸢尾根中提取分离出的新三萜类化合物鸢尾醛A和B(iritectol A和B)具有显著的体外诱导人肺癌细胞(COR-L23)凋亡的作用23。实际上,我国民间使用的鸢尾科药材种类非常丰富,除了射干属射干Belamcanda chinensis (L.)DC.、番红花属番红花(Crocus sativus L.)等常用中药,在中国中药资

22、源志要中收载的仅鸢尾属(Iris)药用植物就达到30种。因此,中药研究人员有必要与各地区少数民族药学专家保持广泛的联系,对有明确记载的少数民族常用中药进行调查与收集。对于文献记载不详或易混肴的药材甚至应当走访民间“赤脚”医生进行实地考察。这样做不仅有助于及时补充与完善中药学信息,也有利于纠正某些具有毒副作用的药材在民间的误用,甚至可能发现民间对某些有毒中药材进行去毒的特殊炮制方法。例如,天南星科植物半夏Pinellia ternate (P.tuberifera)是有毒植物,始载于神农本草经,列为下品而且没有记载炮制方法。中华人民共和国药典2005版除了介绍生半夏以外只提到了清半夏、姜半夏和法

23、半夏3种炮制方法。实际上,经过民间广泛使用和历代不断的发展,目前能够查到的半夏炮制方法就有70多种24。 我国对民族医药有保密制度。开发人员在数据库内容的使用权限上应设置不同的等级,从而达到保护民族医药知识产权的目的。例如：初级用户只能对药典里和期刊上发表的有限信息进行检索；中级用户为国家重点科研院所,可以使用所有数据库资源并进行虚拟筛选等高级分析工作；最高级用户为数据库的构建、管理和维护机构,如科技部、国家食品药品监督管理局、知识产权局、国家中医药管理局、中国科学院等单位能够使用和升级整个数据库系统。用户的帐户管理可以采用绑定IP或动态密码技术。4 中药信息学资源的拓展 中医中药是中华民族在

24、长期实践中积累和发展起来的伟大文化遗产,也是人类利用天然产物祛病强身的典范。它的长期传承和广泛应用不仅由于它是集体智慧的结晶,也是通过人们对它不断总结、扩充与完善而实现的。因此,我们目前所进行的中药信息学研究也不能拘泥自己过去的传统文化,而应当谦虚谨慎地收集和学习其他民族的传统医学和现代天然药物的研究成果,本着“拿来主义”的原则兼收并蓄地发展中药学。 日本研究人员在这方面做的工作很多。中药在日本称为“汉方药”,是在秦汉时期由中国传入日本,与中医学属于同根同源。不过,现代日本汉方已经形成了独自的体系。理论上以伤寒论为框架并且高度简化,重视古方方证。日本已经建立的中医药信息系统和数据库主要分为两大

25、类。一类是以文献为导向的多数据库信息系统；另一类是专家辅助诊断系统,主要有两个临床应用中医软件包：“超级张仲景”和“双方集解”,以及在此基础上建立的中医索引数据库。除此以外,他们还把中国、日本、韩国发表的一些中医文献编成联合目录25。为适应社会日益增长的中医药市场需求,日本文部省从2006年起要求中医学概论作为日本医生临床考试内容之一,并规定从2008年开始纳入日本医生资格考试的试题范围26。 与日本的“汉方药”相似,韩国、泰国、越南和印度等国的传统医药与中药有着不同程度的亲缘关系。这正是由于长期以来民间的相互学习和交流形成的,可谓“他山之石,可以攻玉”。爵床科植物穿心莲 Andrograph

26、is paniculata (Burm.f.)Nees是常用中药,有个别名为“印度草”27。它原产于印度、斯里兰卡、巴基斯坦、缅甸、印度尼西亚、泰国、越南等国。在印度用作苦补健胃药,载于1954年印度药典。我国于20世纪50年代在广东、福建南部民间有引种栽培,用于治疗多种感染性疾病及毒蛇咬伤,成为华南地区民间草药。多年来,我国各地对穿心莲的栽培、化学成分、药理及临床方面进行了深入的研究,并且正式将它收载于1985年版的中华人民共和国药典(一部)中。经过多年的不断发展,我国已开发了穿心莲的多种制剂,目前临床上普遍应用的就有穿琥宁注射液、莲必治注射液、穿心莲片、清火栀麦胶囊等。实际上,印度的传统医

27、药历史悠久,早在公元前6 000年印度人就开始使用传统药物。在印度次大陆广泛传播的阿育吠陀医学(Ayurveda)也可译为草药治疗法,它是印度传统医学的研究重点。印度最早的医学专著阿育吠陀经Charka Samhita出版于大约公元前500年,以植物为主记载了600种药物。发展至今印度用于保健和医疗的传统植物达到7 500余种28。由此可见,与中药同源的传统印度药物的信息也应当属于中药信息学的研究对象。 从以上事实不难看出,中药信息学的国际化拓展是不可避免的发展趋势。随着中国综合国力的提高,药学、化学和计算机等多项科学技术领域的发展已经步入世界前列。近几年,我国研究人员的中药研究成果也越来越多

28、地发表于欧洲国家和美国主办的民族药学、植物化学、生物医学、农业与食品化学、光谱与色谱技术等专业领域的英文期刊。中医中药作为传统医学的典范,它的学术价值和地位正逐渐被国际社会普遍接受。为保障中国人研究制定的传统医药标准规范在国际上占有权威地位,我们有必要适当拓展中药信息学的资源,实现“海纳百川,有容乃大”。5 中药信息维护时需要注意的问题 我们在中药学信息资源的建设过程中除了将中医药相关的资料数字化,研究人员还应当注意相关学科领域的研究与发展,尽量使中药学数据库的内容与相关学科的知识做到同步更新。通过对它的内容进行及时的维护来保证它的完整性、权威性、实效性。 首先,药材原植物名称的误用或不一致仍

29、然广泛存在。最近30年出版的如中华人民共和国药典和中药大辞典等已经统一了大部分较常用药材的中文命名并且列出多个曾用名(中文异名)。然而,我国科技期刊中涉及物种拉丁学名的表述往往差错率很高29。从另一方面讲,国际上对某些植物的系统分类和命名也经历着改革。通常植物的拉丁学名采用林奈创立的双名制,但少数具有亚种、变种(或杂种)的植物会有三字名(栽培植物有专门的命名法规)。对于不符合命名法规的名称,由于历史上惯用已久,经国际植物学会议讨论通过可以作为保留名使用。例如：某些科名的拉丁词尾不是-aceae却仍然被广泛使用,如豆科Leguminosae(现用名Fabaceae)；十字花科Cruciferae

30、 (Brassicaceae)；菊科Compositae (Asteraceae)等。自1866年巴黎(第一次)国际植物学会议开始,每45年要对“国际植物命名法规”(International Code of Botanical Nomenclature)进行一次修改与补充30。它规定了一个植物只能有一个(双名制的)拉丁名。若对同一种植物有两个或两个以上学名发表时,只有最早的符合命名法规的属、种名才是合法名称,其他名称为异名(synonym)。于是,一些科属植物的拉丁学名在不同时代发表的文献中往往不一致。这对于不了解植物分类学的读者很容易感到迷惑。因此,对于一些存在多个异名的药材原植物,应当引

31、用最新版国际植物命名法规认可的拉丁名作为正名。温中降逆中药丁香的原植物拉丁名的沿革就是这类问题的突出代表。在植物分类和命名系统研究的发展过程中,桃金娘科(Myrtaceae)植物丁香的正确拉丁名自18世纪中叶至21世纪的200多年里长期存在着争议。经调查,植物学家们曾经基于不同的植物分类系统对丁香发表了7个拉丁名：Caryophyllus aromaticus Linn.、Eugenia caryophyllata Thunb.、Myrtus caryophullus Sprengel、Eugenia aromatica (Linn.) Baillon、Jambosa caryophyllus

32、 (Sprengel) Niedenzu、Syzygium aromaticum (Linn.) Merrill et Perry、Eugenia caryophyllus (Sprengel) Bullock et Harrison31,根据2006版国际植物命名法规,我们应当使用 Syzygium aromaticum 作为正名。值得注意的是,2005年版中华人民共和国药典(一部)和中药大辞典32中的相关词条仍然把异名Eugenia caryophyllata Thunb.作为丁香的拉丁正名。 其次,详尽而丰富的原植物信息有助于调查不同国家地区、不同时代的民间用药,实现优质、道地中药材资源

33、的开发与可持续发展。因此,中药学信息数据库中也应当收载药源植物的拉丁曾用名或异名,以便用户追溯早期的(甚至是用不同语言撰写的)文献资料。例如,消肿解毒中药三白草(Saururus chinensis Baill.)可查到的异名有4个：Saururopsis chinensis Turcz.、Saururus cernuus Thunb.、Saururus loureiroi Decne.、Spathium chinense Lour.。然而,在常用中草药专著现代中药学大辞典33、新编中药志34、中药现代研究荟萃35、2005年版中华人民共和国药典(一部)的词条中均未收载三白草的拉丁异名。稍后出

34、版的由南京中医药大学编著的中药大辞典32也仅仅收载了一个异名Spathium chinense Lour.。 类似的问题还体现在药材成分描述的确凿性上。一些中文文献和数据库仅仅列出中药化学成分的中文名或译名,有的写出相应的英文名却没有CAS代码和分子结构图。毕竟化合物中也有异物同名和同物异名的现象,特别是有些异构体和早期发现的含多个手性碳的化合物,它们的类似物较多而且往往命名含糊,分子结构图是最直观的表示方法。例如：从Alpinia calcarata Roscoe(山姜属,距花山姜)中先后分离出的两个二萜类化合物1和2都被命名为calcaratarin D36-37。而化合物3在历史上却有多

35、个命名,包括：7-methylaromadendrin38、7-Methyl-aromadenin39、(2R,3R)-7-methoxy-3,5,4-trihydroxyflavanone40和3,5- dihydroxy-2-(4-hydroxy-phenyl)-7-methoxy-chroman-4-one41其实指的是同一个7-甲基香橙素(CAS代码为35815-06-6和37971-69-0),只不过被先后从Eupatorium capillifolium41 (泽兰属植物)、Artemisia dracunculus42(龙蒿)、Inula viscosa41(黏迪里菊,现用名Di

36、ttrichia viscosa)等近10种不同的植物中分离出来。由于Beilstein和Combined Chemical Dictionary等大型化学数据库所记录的化合物全有结构图和对应的CAS代码,这就为文献调查工作提供了便利。科研人员不必担心由于文献中的同物异名或同名异物问题造成的遗漏或误导。采用国际上统一的CAS代码作为化学成分的标准ID也使用户可以针对同一成分进行多库检索。这是我们开发和升级中药信息数据库时值得借鉴的。【参考文献】 1 中药现代化发展纲要(2002年至2010年)J.中药研究与信息,2002, 4(11)：79.2 中华人民共和国卫生部.关于印发中医药创新发展规划

37、纲要(20062020年)的通知EB/OL. 2007-03-22.3 吕 磊,田 龙,沈 俊,等.中药数据库的智能查询和筛选系统介绍J.中国临床药理学与治疗学,2004,(4)：477480.4 周忠眉.数据挖掘在方剂配伍规律研究应用的探讨J.漳州师范学院学报(自然科学版),2003,16(4)：3135.5 Fayyad UM, Piatetsky-Shapiro G, Smyth P. From data mining to knowledge discovery in databasesJ. AI magazine,1996,17(3)：3754.6 朱维良,蒋华良,陈凯先,等.生物大

38、分子体系量子化学计算方法新进展J.化学进展,1999,11(4)：367375.7 李洪林,沈建华,罗小民,等.虚拟筛选与新药发现J.生命科学,2005, 17(2)：125131.8 David Hand, Heikki Mannila, Padhraic Smyth.数据挖掘原理M.北京：机械工业出版社,2003.3.9 林淑玲.浅析数据挖掘技术J.科技信息,2008,(1)：329331.10 张华伟,王明文,甘丽新.基于随机森林的文本分类模型研究J.山东大学学报(理学版),2006,41(3)：139143.11 Kohonen T, Somervuo P. How to make l

39、arge self-organizing maps for nonvectorial dataJ. Neural Networks,2002,15(8/9)：945952.12 Ehrman TM, Barlow DJ, Hylands PJ. Phytochemical informatics of traditional Chinese medicine and therapeutic relevanceJ. Journal of Chemical Information and Modeling,2007,47(6)：23162334.13 Ehrman TM, Barlow DJ, H

40、ylands PJ. Phytochemical databases of Chinese herbal constituents and bioactive plant compounds with known target specificitiesJ. Journal of Chemical Information and Modeling, 2007,47(2)：254263.14 叶德举,罗小民,沈建华,等.先导化合物的发现整合计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试方法J.化学进展,2007,19(12)：19391946.15 贾 琦,李 剑,陈莉莉,等.感冒229E病毒3CL蛋白酶抑

41、制剂金丝桃苷衍生物的合成及其构效关系研究J.中国药物化学杂志,2007,17(5)：288294.16 秦 秋.国家自然科技资源平台项目“药用植物种质资源标准化整理、整合及共享试点”取得新进展EB/OL. kexueyanjiu/gongzuodongtai/075606543.html,2008-04-15.17 曹 晖,刘玉萍.分子标记技术在中药品种鉴别中的应用J.中国药学杂志,1998,33(5)：269273.18 Budak H, Shearman RC, Parmaksiz I, et al. Comparative analysis of seeded and vegetativ

42、e biotype buffalograsses based on phylogenetic relationship using ISSRs, SSRs, RAPDs, and SRAPsJ. Theoretical and Applied Genetics,2004,109(2)：280288.19 Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ, et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markersJ. Nucleic Acids Research,1

43、990,18(22)：65316535.20 王瑷琦,黄璐琦,邵爱娟,等.孑遗植物杜仲的遗传多样性RAPD分析和保护策略研究J.中国中药杂志,2006,31(19)：15831586.21 刘 岩.中药数据库藏药库介绍A.中国中医药信息研究会第二届理事大会暨学术交流会议论文汇编C.北京：中国中医药信息研究会,2003.141143.22 Fang R, Houghton PJ, Luo C, et al. Isolation and structure determination of triterpenes from Iris tectorumJ. Phytochemistry, 2007,

44、68(9)：12421247.23 Fang R, Houghton PJ, Hylands PJ. Cytotoxic effects of compounds from Iris tectorum on human cancer cell linesJ. Journal of Ethnopharmacology,2008,118(2)：257263.24 袁劲松,王奇成.半夏炮制方法及其功效特点J.湖南中医杂志, 1994,10(5)：8284.25 叶春峰.日本的中医药信息系统和数据库J.中国中医药信息杂志,1998,5(2)：5960.26 仝选甫.从日本中医药发展现状探讨未来国际间发

45、展与合作领域J.中医药管理杂志,2006,14(1)：5153.27 黎光南.云南中药志(第一卷)M.昆明：云南科技出版社,1990.417419.28 唐小山.传统药物与国际市场M.北京：人民卫生出版社,2003.329332.29 周莉花,吴伟根,章晓光.科技期刊中物种拉丁学名及植物品种名规范新述J.编辑学报,2005,11(5)：336337.30 钟云芳,宋希强.异物同名异名同物我国花卉命名有点乱J.中国花卉园艺,2003,(14)：2829.31 Bullock AA, Harrison SG. Nomenclatural Notes：IV the correct name for

46、the cloveJ. Kew Bulletin,1958,13(1)：52.32 赵国平,戴 慎,陈仁寿.中药大辞典M.第2版.上海：上海科学技术出版社,2006.1416.33 宋立人,洪 恂,丁绪亮,等.现代中药学大辞典M.北京：人民卫生出版社,2001.76.34 肖培根.新编中药志(第三卷)M.北京：化学工业出版社,2002.14.35 熊辅信,寸树芬.中药现代研究荟萃M.昆明：云南科技出版社, 2002.28.36 Kong Ling-yi, Qin Min-jian, Masatake Niwa. Diterpenoids from the rhizomes of Alpinia

47、 calcarataJ. Journal of Natural Products, 2000,63：939942.37 Kong Ling-yi, Qin Min-jian, Masatake Niwa. New Cytotoxic Bis-labdanic Diterpenoids from Alpinia calcarataJ. Planta Medica,2002,68：813817.38 Zhang Xin-feng, Tran Manh Hung, Phuong Thien Thuong, et al. Anti-inflammatory activity of flavonoids

48、 from Populus davidianaJ. Archives of Pharmacal Research,2006,29(12)：11021108.39 Gaffield W. Circular dichroism, optical rotatory dispersion and absolute configuration of flavanones, 3-hydroxyflavanones and their glycosidesdetermination of aglycone chirality in flavanone glycosidesJ. Tetrahedron,197

49、0,26(17)：4093,40944103.40 Herz W, Gibaja S, Bhat SV, et al. Dihydroflavonols and other flavonoids of Eupatorium speciesJ. Phytochemistry,1972,11：28592863.41 Victoriano H, Cannen RM, Salvador M, et al. Effects of naturally occurring dihydroflavonols from Inula viscosa on inflammation and enzymes invo

50、lved in the arachidonic acid metabolismJ. Life Sciences,2007,81(6)：480488.42 Balza F, Towers GH N. Dihydroflavonols of Artemisia dracunculusJ. Phytochemistry,1984,23(10)：23332337. 班主任工作总结与反思班主任工作总结与反思班主任工作总结与反思 （中国大学网 .com）鲁迅先生曾经说过“教育根植于爱”，一位著名的外国教育家更是一针见血地指出“没有了爱就没有教育”说法，班主任必须懂得“欲致鱼者先通水，欲致鸟者先树木“的道理

51、；同时班主任是班级管理工作的直接参与者，是学生在学习生活、心理健康、人生态度和价值观念的引导者，是帮助学校开展各项工作的协调者，所以，在实际的工作中班主任这一角色至关重要，这也决定了班主任工作的千头万绪，班主任必须要有为才有位，班主任工作总结与反思。在过去一个学期的班主任班级管理工作中，我主要从下面几方面来着手： 一、工作篇 （一）、在班级管理上： 建设一个和谐上进的班级，需要全班学生的共同参与，其中，班干部的选拔尤为重要。俗话说：火车跑得快，全靠车头带。班干部正式这种角色的最好演绎，因此，建设一支高素质的班级领导核心也尤为重要。因此在班干部的培养上，我主要采取以下措施： 1、军训期间，多与学

52、生交流，了解学生的兴趣爱好。在与新生的日常交往中，分析和了解他们的性格特征，对他们的沟通能力、办事效率等各个方面作出一个整体的评价，对积极认真、埋头肯干、热情奔放并具有一定组织能力、威信度高的学生给予充分的重视，通过确立班级负责人的形式，把他们锻炼为首届的班委成员。在坚持民主推选与自荐的原则之下，挑选出一批积极上进，具有班级管理能力的班干队伍； 2、在开展班级管理工作时候，对班干部，班主任要采取“授人以鱼不如授人以渔”的方法。在实际的操作中，要理清“具体的指导和放手工作”的关系，在班级管理和班委成员共同分析和讨论班上的具体情况下，鼓励他们发挥创造性，放手在他们独立开展工作，把为同学们服务的理念

53、植入他们的工作中。从取的效果来看，一支团结的班干队伍，在协助班主任开展日常的工作，促进良好的班风建设方面，其作用是很大的。同时，对班干部进行责任心的教育，班干队伍要树立起表率的先锋带头作用教育等问题上，也是紧抓不放。 （二）、在学风建设上： 一个优秀的班集体，在学风建设上，也必须具有学习氛围浓厚，在成绩上有你追我赶的学习劲头，因此在学风建设上，主要从以下方面来加强： 1、积极配合学校，在班集体上大力开展信心教育活动，根据本班的具体实际，制定班级信心誓词，充分用课堂、班会和与学生谈心的时间，向学生进行信心教育的渗透，对学生进行赏识教育，多给学生鼓舞，多给学生自信，多给学生支持； 2、与各学科老师

54、沟通联系和交流，了解学生的学习成绩，分析学生的各科存在的问题；加强对学生进行法上的指导，进行有针对性的辅导， 3、发动学生成立各科学习兴趣小组，实行互助式的学习。 （三）、在心理辅导上： 一个健康的学生，除了在生理上的成熟结合健康外，心理素质的好坏也同样重要。对于有心理问题障碍的学生，心理辅导尤为需要。高中一年级，在面对一个全新的学习、生活环境，容易产生不适应的反抗心理，缺乏自信心、也回产生忧郁、甚至自卑，所以根据学生成长的过程，在心理辅导上主要从以下方面着手： 1、深入学生宿舍，多与学生交流，了解学生近期在学习、生活、心理上存在的问题；抓好生活习惯,培养学生自理能力、自立能力和高贵的修养，工

55、作总结班主任工作总结与反思。在三个月内，全面掌握学生的性格特点和个性，并争取与他们每一位学生都谈过心； 2、加强与心理学老师的沟通，及时发现问题学生，以防范于未然； 3、在家校方面，多与学生家长沟通，全面了解学生的成长经历； 4、开展形式多样的主题班会，教育学生学会感恩、惜时、养成良好的习惯和生活作风。 二、成绩与问题篇 以上就是我在前一个阶段在教学管理工作的一些做法。在上述做法的指导下，高一（8）班在班风建设和学风氛围上，都表现出一种积极上进的苗头： 学风建设上：在信心教育的影响下，我们班上的学生改变了自卑的学习心理，信心宣誓精神饱满、热情高涨；在两次段考里面，学生所取得的进步也是比较明显的

56、，如何劲坡、李晓梅两位同学，在两次段考里面都取得90名以下的进步；在这两次段考中，共有64人次取得了不同程度的进步；数学、语文、生物、历史等科目的总体平均分有了进一步的提高；在课堂自习和晚修上，绝大部分学生能够做到勤于学问，告别三闲，有一股“静、净、竞”的学习氛围。 班级管理上：班干队伍素质加强，责任心意识浓厚，班级体荣誉感强，团结作风好。特别是班长文启彬，陈佩琪等，他们在班级管理意识上十分负责，班上的黎远康、焦天志、陈志浩、黄燕秋等同学都到级组参加学生的管理工作；学生在军训期间、心理剧表演上，显示出团结意识，在学习上的互助意识强，如梁钻珊帮助学生莫文敬，使得他在第二次段考中前进了400多名，

57、进入级组600名；在为患疾学生捐款时，我们班的爱心意识强，捐款数额为高中部班级前列。 在宿舍管理：D601和D602宿舍取得了星级宿舍，在宿舍学生基本形成了一种兄弟姐妹的和谐。学生独立生活和自主解决的问题有了很大的进步，如朱婉婷、周永浩在宿舍内务，在老师的教育和同学的帮助下，有了很大的改善等。 虽然在班级管理上，取得一些成绩，但是仍然还有很多不足：如学生自主学习的气氛还不足；优秀班没有突破；学生在惜时教育上缺乏，迟到现象会时有发生，目标意识也不强等问题依然存在；在管理方面，还欠缺更加科学、民主；学生的知识能力层次不一，落后面大，在处理问题时还有一些急躁，对于学生的部分心理，还不能更好的掌握，关

58、心、爱护学生还不能够全面到位等等。 三、反思篇 正所谓付出不一定有收获，但不付出就一定没有收获。尽管在这一阶段制定了详细的工作计划，但是在具体的班级管理过程中，在吸取班主任对班级管理的经验和教训上，也有一些方法和管理的漏洞有待改善和加强，甚至是值得反思的。 （一）、班主任班级管理工作有待加强。 作为一个新班主任，在班级管理工作上，由于缺乏经验，在实际的管理过程中出现了各种不太适合新时期班主任对班级管理的一些方法和原则，因此班主任的管理工作在以下方面，是需要进一步完善： 1、班主任批评的艺术性。 2、管理工作的跟踪、反馈的及时性。 3、班级管理精致化水平有待加强。对宿舍管理上出现的问题就是上述原

59、因所导致； 4、学生心理辅导的持久性。还没有真正做到与他们每一位学生都谈过心或者建立学生心理档案，做好个案的详细记录等等，这些都是在班级管理工作中的漏洞和不足。 （二）、班主任工作的反思 1、管理上的原则性 2、管理过程中的民主性 3、注重班主任的工作和心得交流。著名的作曲家肖伯纳曾经说过“假如你手中有一只苹果，我的手中也有一只苹果，大家彼此交换，你我的手头上依然只有一个苹果；但是倘若你有一种思想，我有一种思想，大家彼此交换这种思想，那么每个人就有两种思想”。因此班主任队伍要从实现管理的优化，通过班主任工作心得的交流是必要的，这样可以做到举一反三，触类旁通，在解决同一问题的时候，集思广益，寻找

60、问题的最好的解决方法和途径。 四、方向篇 为了更好提高自己的业务水平和班级管理艺术，进一步完善自我，在以后的工作过程中，我认为有以下几点是我应该要努力的方向。 1、树立正确的教育教学理念，平等对待每一位学生。在班主任工作当中，始终坚持养成教育、惜时教育、信心教育、感恩教育为主题的系列培养学生的做法；同时多向有经验的教师请教教学上的问题和班主任管理工作具体操作流程，向优秀班级学习管理经验。 2、加强本学科的知识水平，扩大视野，在具体的教学过程中，努力做好“读好一本书、写好一笔字、说好一口话”。加强对中学生心理知识的学习力度，提高分析学生学习心理，人际交往心理等方面的能力。 3、向学生学习。做一个

61、老师是要有耐心的，班级管理工作也要需要持久的付出，在班主任工作黔驴技穷的时候，学生的所提出的民主化管理的方法，是非常值得借鉴的，如果班主任工作能够吸取和采纳部分有建设性的建议，学生与班主任的距离将进一步拉近，学生敢于也乐于和班主任接近。 学高为师，德高为范，作为一名班主任，在日常行为应该以身作则，言传身教，这样学生才能亲其师，信其道，这也是新时期班主任的工作要求。在过去一个阶段的班主任工作中，由于管理知识水平的缺乏，经验生疏，在具体处理学生问题上有些不恰当的做法，因此在以后的工作实践中还需要不断探索和完善。短暂的从教经历让我真正体会到了为人师之苦，为人师之累，为人师之难，为人师之乐，它也让我对

62、教师这一行业有了更新的认识和体会。班主任教学工作总结班主任教学工作总结班主任教学工作总结杨会娟光阴似箭，转眼之间，一个学期已接近尾声，班主任教学工作总结。班里的孩子懂事了很多，在一点一滴地成长起来了。我作为他们的老师，内心感到很欣慰。现将一学期工作总结如下：班级管理方面一、抓住工作中的细节，切切实实地关爱孩子二年级的学生，虽然自理能力比一年级的孩子稍微好一点，但是对于一些细节，有些孩子还是容易忽略。需要教师给他们讲讲该怎样做，需要注意些什么，需要把生活中的一点一滴都落到实处，让学生养成良好的习惯。为了让孩子搞好个人卫生，每天我让上下铺的学生互相监督对方，看看是不是打香皂洗脸、洗脚，两天换一次袜

63、子。对于个别孩子自理能力差，我告诉他们方法。例如，穿衣服时，先穿上衣，再穿下衣，脱衣服时，先脱下衣，再脱上衣。每次换衣服时，给她们讲需要注意的问题，如果不知道穿什么衣服，告诉老师，老师帮助他。天气变冷时，对于孩子的穿衣情况，除了看一看，还用手摸一摸，提醒没有拉上拉链的孩子。除了洗刷穿衣，还随时关注孩子的身体情况。在量体温后，发现孩子有异常，就打电话通知家长，或者带着去校医室看病。每天早中晚饭之后，总是提醒孩子吃药。每节下课提醒他们喝水，泡上板蓝根。每天做着这些平凡而又琐碎的工作，因为我们的工作对象是天真纯洁的孩子，他们需要我们的呵护，需要我们给予他们更多的爱。当然，由于付出，也得到了回报，通过和家长交谈，家长感到老师对孩子的关爱。二、加强学生的思想品德教育作为班主任，要对学生进行思想品德教育，是他们的身心得到全面健康的教育。对于二年级的孩子来说，正是各方面接受教育的最佳时机。除了学习，我想更为重要的是教会他们认识世界，明辨是非，学习怎样做人。针对班