RefViz软件使用说明

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1、精品文档，仅供学习与交流，如有侵权请联系网站删除前几天在园子里看到关于RefViz的介绍后很感兴趣，随即下载安装试用；用几天后，发现这是一个很有趣的软件，可以更好的帮助我们管理参考文献，并且发现文献之间的关联性；以下将我对一些主要功能的使用体会，与DXYers分享一下：一、 建立RefViz数据库（Create View）RefViz可以实现与Endnote和RM的无缝连接，即我们可以将手头的Endnote数据库和RM数据库直接导入。RefViz的PDF Help中介绍了通过下载多种数据库文件后建库的方法，不再赘述，这里介绍一下与参考文献管理软件之间嵌入的方法：在RM或Endnote的安装目录

2、下，均有一个文件Configure DataViz.exe，运行此文件后，按照Wizard的提示，找到RefViz安装目录下的RefViz.exe文件，然后按照提示就可建立链接。（Fig1）打开RM，可以看到工具栏中已经出现RefViz的链接工具（Fig2），点击该工具栏，RefViz会开始自动建立相关数据库（注意此时新建的数据库自动保存在X:RefVizdatasets文件夹中）；此外，可以通过导出RM或Endnote数据库为RIS格式的文本文档，然后在RefViz中导入（Fig3）Figure 3二、 工作视窗简介A为文献关联信息区，显示文献按照主题词（最初建库时，这些主题词是由RefVi

3、z根据在文献数据库中某词的出现位置及频率自动生成的）的分类情况（在Galaxy视图中），以及主题词之间组和后的关联性（在Matrix视图中）；B为关键词显示区：b1为一级关键词区，显示与文章关联性最强Keywords（最初建库时，也是由RefViz自动生成的，这些关键词和Galaxy视图中的关键词完全相同，是文献分类的主要依据）b2为次级关键词区，与一级关键词协助进行文献分类；b3为描述性关键词，意义不是很大。C为文献基本信息区（已经把Advisor视图关闭）Figure 4三、各视窗功能介绍：在Galaxy视窗下，将鼠标放于某一类文献下，可以出现如图（Fig5）所示基本信息：该图显示的是，第

4、11类文献，总数为82条，Top Keywords 为 plaque, PTCA ,atherectomy;Figure 5点击此类文献，则C区和B区的信息随之变化（Fig6）Figure 6此时，进入Matrix视窗，虽然关键词的排序以及关联性强弱没有发生变化，但是在第11类文献中出现的一级关键词均被着重显示为红色（Fig7）。B区的Search功能比较简单，不再赘述。Figure 7上一页12345下一页 下面详细介绍一下Matrix视窗的功能：如图（Fig8），在valve和endocarditis的交汇点，出现文献的相关信息：相关性0.586，文献计数18条。（此相关性是如何计算出的，

5、很神奇啊？！心内膜炎的确和心脏瓣膜之间有重要的联系；我的个人理解，该相关性的计算依据，可能是统计各词的出现频率，然后计算出的两个关键词同时在决定文献属性的某一个特定部位（如文章题目）出现的概率；的确，通过这种关联，可以确立文献之间的内在联系）下面，我们改变关键词的排列方式（由字母顺序排列改为相似性排列），如图（Fig9），可以发现横轴的关键词以其内在的相似性进行排列：ace (血管紧张素转化酶) acei （血管紧张素转化酶抑制剂） mi （心肌梗死）captopril （一种转化酶抑制剂）enalapril（另一种转化酶抑制剂），这几个具有内在相关性的词，竟然都出现在一起！（电脑也会成为一个

6、心血管专家！）。这种排列，无疑可以为用户提供重要的信息，可以揭示文献的研究热点和研究趋势（当然应该具备一定的专业判断能力）；比起单纯的文献检索系统，RefViz在这一点上实在是聪明。其它及类排列方式的组和，大家可以试一试，通过上面的介绍，可以触类旁通。Figure 8Figure 9上一页12345下一页 下面详细介绍一下Matrix视窗的功能：如图（Fig8），在valve和endocarditis的交汇点，出现文献的相关信息：相关性0.586，文献计数18条。（此相关性是如何计算出的，很神奇啊？！心内膜炎的确和心脏瓣膜之间有重要的联系；我的个人理解，该相关性的计算依据，可能是统计各词的出现

7、频率，然后计算出的两个关键词同时在决定文献属性的某一个特定部位（如文章题目）出现的概率；的确，通过这种关联，可以确立文献之间的内在联系）下面，我们改变关键词的排列方式（由字母顺序排列改为相似性排列），如图（Fig9），可以发现横轴的关键词以其内在的相似性进行排列：ace (血管紧张素转化酶) acei （血管紧张素转化酶抑制剂） mi （心肌梗死）captopril （一种转化酶抑制剂）enalapril（另一种转化酶抑制剂），这几个具有内在相关性的词，竟然都出现在一起！（电脑也会成为一个心血管专家！）。这种排列，无疑可以为用户提供重要的信息，可以揭示文献的研究热点和研究趋势（当然应该具备一定

8、的专业判断能力）；比起单纯的文献检索系统，RefViz在这一点上实在是聪明。其它及类排列方式的组和，大家可以试一试，通过上面的介绍，可以触类旁通。Figure 8Figure 9四、关键词工具（Keywords Tool）关键词工具可以对三个级别的关键词进行级别更改，最终通过Reprocess功能，改变初始文献的分类状态。首先选中全部文献（Fig10）比如，我认为ef（射血分数的缩写）这个词不足以作为分类依据，或者认为这个词对研究的意义不大，可以通过demote键将它降格为二级、乃至描述性关键词（Fig11）；同理，我认为restenosis,这个词很重要，可以对其升级（Fig12）。通过这种

9、修改，可以进一步按照自己的喜好或者专业需要限定和细分文献。按下Reprocess，文献分类就此改变（略）。Figure 10Figure 11Figure 12Figure 13上一页12345下一页 上一页12345下一页 五、同义词定义工具 （Thesaurus Tools）通过定义同义词，可以使检索更为完全和简洁，更省去许多重复的分类。（在这一点上，RM似乎比Endnote更为专业。）Fig13，在Term输入你想在现有词库中寻找的关键词；Headword中，是一系列同义词中，自定义的最常用的一个；Preview中，是RefViz通过检索文献信息，自动定义的同义词库，实际上均为一系列拼写

10、相近的词（比如单复数的区别），有一定的意义，但是我感觉它的作用也只是能够区别单复数，其专业意义并不大；更多的词还需要我们自己定义（工作量实际上是很大的；这是RefViz的一个不成熟之处；我觉得在未来的版本中，应该有一个针对不同专业的内建标准同义词库和标准全称缩写对照词库）。下面具体演示一下：输入mi ;搜索后发现现有词库没有该词（Fig14），点击确定后，mi自动出现在Headword中，点击添加同义词（Add synonym），在新出现的对话框中添加myocardial infarction；这时又出现一个候选区（这个区域的词库量很大，基本上是所有的关键词；但是，但是很遗憾，连这么简单的词组

11、都没有，其实这个词的出现频率相当的高，只是该词库均为单个的词，我们可以见到myocardial-infarction-induced （Fig15） 但是就是没有myocardial infarction!）；点击OK，点击Save Entry（也可以把myocardial infarction 调整为Headword）；这时，新定义的同义词会出现在词库中。（Fig16）点击Reprocess，就会对全部文献的分类进行重排。Figure 14Figure 15Figure 16六、其它功能包括定义子文献数据库、文献的导出等，比较简单，这里不再赘述。七、总体评价RefViz是一个人性化的软件，有

12、很多值得借鉴的探索性尝试；而且对文献的管理上升到“自动准专业化”的水平；尤其是对于第一次接触一个陌生课题（比如研究生撰写开题报告时；老板突发奇想，让我们做一些“开创性的工作”时），可以使用户全面的、省时省力的掌握该学科的研究热点和热点之间的相关性以及研究的趋势。这一项功能，是普通检索工具无法完成的。但是，我认为，当我们已经具有稳定的研究方向时，它的这种优势就显示不出来了。此外，一些细节的功能需要进一步完善，比如同义词的定义。需要强调的是，RefViz对硬件的要求比较高，比如，我的电脑配置是Celeron 2.4, 512M, 8M缓存的硬盘，在同时打开WM player时，进行数据库重排，竟会出现音乐停顿的现象。所以，电脑硬件相对较落后的战友，恐怕就尝不到这份大餐了。 【精品文档】第 16 页