NMDS分析过程

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PCORD5：Nonmetric Multidimensional scaling (NMDS)以微量热指标数据为例1. 数据输入格式其中，Number指的是土样个数；Species指测定指标；Excel文件格式为.xls(因为PCORD5只识别这个格式)。2. 安装并打开PCORD5软件软件界面：导入数据：FileImport MatrixMain Matrix我们文件类型是Excel所以就选择Excel Spreadsheet选项，点击OK。选择所需要的文件。3. 数据分析Ordination菜单栏NMS/NMDS选项。Autopilot：三种模式，根据需要选择模式。Distance Measure：根据数据选择合适的方法常用的是Sorensen（Bray-Curtis）、Relative Sorensen、Relative Euclidean不用修改点击OK。4. 结果输出5. 作图（1）（2）二维图结果（3）Statisticscorrelations with Main Matrix，点击OK。（4）StatisticsPercent of Variance In Distance Matrix。点击OK。Origin8作散点图：由于PCORD5做出来的图不好修改，所以将数据拷贝出来用Origin8来做图。