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1、生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度SDS-PAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度鉴定菠萝蛋白酶的纯度生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度一、实验目的一、实验目的1、学习和掌握电泳（SDS-PAGE）的基本原理及电泳技术。2、熟练配制SDS-PAGE相关各种试剂。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度二、实验原理二、实验原理 电泳电泳: :带电粒子在电场中向与其自身带相反电荷的电极移动，这种现象称为电泳。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度影响电泳的主要因素影响电泳的主要因素 （1）颗粒性质颗粒性质：一般说来，颗粒带净电荷量越大，或其直径越小
2、，或其形状越接近球形，在电场中的泳动速度就快。反之，则越慢。（2）电场强度电场强度：电场强度越高，带电颗粒的泳动速度越快。反之，则越慢。（3）pH值值（4）离子强度离子强度：溶液的离子强度一般在0.020.2mol/kg之间电泳较合适。（5）溶液粘度溶液粘度（6）电渗电渗（7）焦耳热焦耳热（8）筛孔筛孔生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度 聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持物的一种电泳。 这种凝胶是由丙烯酰胺单体(简称 Acr)和交联剂 N，N-甲叉双丙烯酰胺(简称Bis)，在催化剂的作用下聚合而成的。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的
3、纯度 聚丙烯酰胺凝胶聚合的体系有两种聚丙烯酰胺凝胶聚合的体系有两种，即化学聚合和光聚合。 化学聚合化学聚合的引发剂是过硫酸铵(NH4)2S2O3(简称Ap)，催化剂是N，N，N，N-四甲基乙二胺(TEMED)。在催化剂TEMED的作用下，由过硫酸铵(Ap)形成氧的自由基，后者又使单体形成自由基，从而引起聚合作用。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度 聚丙烯酰胺凝胶的质量主要由凝胶浓度和交联度决定。聚丙烯酰胺凝胶的质量主要由凝胶浓度和交联度决定。 每每100mL凝胶溶液中含有的单体凝胶溶液中含有的单体(Acr)和交联剂和交联剂(Bis)总总克数称为凝胶浓度，用克数称为凝胶浓度，用
4、T表示。表示。 凝胶溶液中，交联剂凝胶溶液中，交联剂(Bis)占单体占单体(Acr)和交联剂和交联剂(Bis)总总量的百分数称为交联度，用量的百分数称为交联度，用C表示。表示。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度 不连续的聚丙烯酰胺凝胶电泳不连续的聚丙烯酰胺凝胶电泳，带电颗粒在电场中的泳动有电荷效应电荷效应、分子筛效应还具有浓缩效应。(l) (l) 浓缩效应浓缩效应(2)(2)电荷效应电荷效应(3)(3)分子筛效应分子筛效应生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度Gel5%10%15%29294545666697972002002929454566669797200
5、2002929454566669797200200生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度实验试剂配制实验试剂配制 30%凝胶贮液：凝胶贮液：取30g丙烯酰胺（Acr）、0.8g甲叉双丙烯酰胺(Bis), （先用约50ml蒸馏水溶解，如溶解不了,可加热3050溶解,再用量筒定容至100ml，然后过滤，后置于棕色瓶,4下保存备用）。聚丙烯酰胺具有神经毒性，操作时要戴手套聚丙烯酰胺具有神经毒性，操作时要戴手套(2) (2) 10%过硫酸铵过硫酸铵(AP)(AP)溶液：溶液：取2g过硫酸铵溶解后，用20ml dH2O溶解，现配现用。(3) (3) 1 mol/L HCl 500ml：取浓
6、HCl 42 ml，加蒸馏水至500 ml(在通风橱中操作)。(4) 分离胶缓冲溶液（分离胶缓冲溶液（1.5mol/L Tris-HCl缓冲液，缓冲液，pH8.8）:取18.15g Tris溶解后，加1mol/L HCl溶液约48ml，调pH至8.8, 定容至100ml。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度(5) 浓缩胶缓冲液浓缩胶缓冲液(0.5mol/L Tris-HCl缓冲液缓冲液,pH6.8): 取6g Tris溶解后，加1mol/L HCl溶液40ml，调pH至6.8，定容至100ml 。(6) 10%SDS(十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠)溶液溶液: 取5g SDS加水
7、定容至50ml。（加热溶解）(7) 2电极缓冲液电极缓冲液(0.1%SDS0.05mol/L Tris0.384mol/L甘氨酸缓冲液，甘氨酸缓冲液，pH8.3):取6gTris，28.8g甘氨酸和1g SDS加水溶解后，定容至000ml（配好的溶液pH8.3）(12个组可配2升,使用时再稀释2倍)。 生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度(8) 样品溶解液：样品溶解液：取SDS g，-巯基乙醇 ml，甘油10ml，溴酚蓝0.1g，0.5mol/L pH6.8 TrisHCl缓冲液 (浓缩胶缓冲液)10ml，加蒸馏水25ml，(最后的总体积为50 ml),装于棕色瓶。(9)染色液
8、（染色液（0.1%考马斯亮蓝考马斯亮蓝-45%甲醇甲醇-10%冰乙酸溶冰乙酸溶液）：液）：1g考马斯亮蓝R250，加入450 ml 甲醇、100ml冰乙酸，用水定容至1000 ml。(12个组可配2000 ml)(10)脱色液脱色液高甲醇高甲醇1000ml：甲醇：甲醇 454ml，冰醋酸，冰醋酸75ml，dH2O 471 ml低甲醇低甲醇1000ml ：甲醇：甲醇 50ml，冰醋酸，冰醋酸75ml，dH2O 875 ml生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度七实验步骤七实验步骤1.清洗并吹干玻璃板。2.在塑料胶条的两面涂少量凡士林（注意不能涂多，以防弄脏玻璃板）。3.把玻璃板放入
9、电泳槽中。4.用小烧杯加6ml蒸馏水，2ml 30%凝胶储液，20 ul TEMED，100ul 10过硫酸铵，混匀，迅速倒入封口槽处(一定要快！一定要快！)，静置约10min直到凝固。聚丙烯酰胺具有神经毒性，操作时要戴手套聚丙烯酰胺具有神经毒性，操作时要戴手套5.加dH2O于两层玻璃之间，检查玻璃底是否漏水；如果漏水，要重装。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度6.按下表用小烧杯配12%分离胶，混匀，灌胶，高度离梳子约11.5cm，然后覆盖一层水，凝胶时间为1530min，胶与水分层，倾倒去水。12%分离胶5%浓缩胶 30%凝胶贮液4000l810 l上层胶缓冲液pH6.81
10、250 l下层胶缓冲液pH8.82500lTEMED（四甲基乙二胺)30 l20 l10%SDS100l50ldH2O3270l2820lAP（过硫酸氨）100l50 l生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度7.凝好胶，垂直拔掉梳子（不要左右摇梳子）。8.上槽加入电泳缓冲液（电极缓冲液稀释2倍），液面需没过低玻璃板；下槽电泳缓冲液没过玻璃板封胶处1cm。9.用1.5ml ep管取100l粗酶样品与100l样品溶解液混合均匀，与蛋白质分子量标准一起置于沸水浴5min）。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度10.微量注射器按下表2点样，隔孔点样，注意不要交叉污染（每点
11、一个样都要清洗微量注射器）。表2 点样方式孔1234567891011加样粗酶标准蛋白过柱1过柱2过柱3体积L304030353535 *微量注射器不可过低,以防刺破胶体；也不可过高, 样品下沉时易发生扩散，溢出加样孔生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度11.上槽接负极，下槽接正极。12.恒电流电泳：浓缩胶，1012 mA，待溴酚蓝迁移到浓缩胶与分离胶的界面调整电流至20mA。13.待溴酚蓝迁移到距分离胶底部0.51cm处，结束电泳。14.染色（2030min），回收染色液。15.脱色：高甲醇6080ml，25min；高甲醇4060ml 20min；低甲醇80100ml完全脱净
12、剥胶时要小心剥胶时要小心, ,保持胶完好无损保持胶完好无损, ,染色要充分染色要充分生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度16.拍照并画电泳图谱，计算标准蛋白、待测样品的相对迁移率（蛋白相对迁移率蛋白迁移距离/指示剂迁移距离）。17.用低分子量标准蛋白质所作的标准曲线，求待测样品亚基的相对分子量。18.以标准蛋白质电泳的相对迁移率为横坐标(X)，标准蛋白质分子量的对数为纵坐标(Y)，绘标准蛋白质的标准曲线，再根据样品相对迁移率在曲线上求出其蛋白质的分子量。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度蛋白名称 迁移距离 相对迁移率（Y） 蛋白分子量(D) 蛋白分子量对数(X
13、) 兔磷酸化酶B 牛血清白蛋白 牛碳酸酐酶 牛蛋白酶抑制剂 鸡蛋清溶菌酶 过柱的菠萝蛋白酶 指示剂 -生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度低分子量标准蛋白质的组分：低分子量标准蛋白质的组分：1) 兔磷酸化酶B 分子量 97,4002) 牛血清白蛋白 分子量66,2003) 兔肌动蛋白 分子量43,0004) 牛碳酸酐酶 分子量31,0005) 牛蛋白酶抑制剂 分子量20,1006) 鸡蛋清溶菌酶 分子量14,400生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度八实验注意事项八实验注意事项1.缓冲液的pH值、浓度要准确配置；2.AP新鲜配置。3.SDS在低温下析出，使用前水
14、浴加热使之溶解。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度九实验结果分析九实验结果分析 1. 各实验组分析讨论实验结果，再由老师进行归纳总结。2. 做好电泳图谱的绘制及数据记录。3. 学生对该实验有哪些体会。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度 4. 思考题：（1）电泳时，上下电泳槽产生的气体是什么？用过一次的电极缓冲液是否可以混合后再用？为什么？（2）样品上样前为什么要沸水浴加热35分钟？（3）SDS-PAGE是否需在低温下进行？为什么？（4）做好本实验关键是什么？（5）如果电泳图谱模糊，有些电泳带不出现或拖尾，试分析原因。生物化学研究技术3SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶的纯度
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