真核基因转录的启动子

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1、 启动子是基因的一个组成部分,控制基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。启动子就像“开关”,决定基因的活动。既然基因是成序列的核苷酸,那么启动子也应由核苷酸组成。启动子本身并不控制基因活动,而是通过与称为转录因子的这种蛋白质结合而控制基因活动的。转录因子就像一面“旗子”,指挥着酶(RNA聚合酶RNA polymerases) 的活动。这种酶指导着RNA合成。真核生物启动子有三类,分别由RNA聚合酶、和进行转录。只控制只控制rRNA前体基因的转录,转录产物经切割前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟和加工后生成各种成熟rRNA。 类别类别启动子由启动子由两部分保守序列组成:两部分保

2、守序列组成:1.核心启动子(core promoter):位于转录起点附近,从-45至+20;2. 上游控制元件(upstream control element,UCE):位于-180至-107;RNA聚合酶聚合酶对其转录对其转录需要需要2种种因子参与因子参与:1.UBF1:一条M为97000的多肽链,结合在上述两部分的富含GC区2.SL1:一个四聚体蛋白,含有1个TBP,即TATA结合蛋白(TATA-binding protein,TBP);3个不同的转录辅助因子TAF在SL1因子介导下RNA聚合酶结合在转录起点上并开始转录。类别类别启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控启动子涉及众多编码

3、蛋白质的基因表达的控制。制。 该类启动子包含该类启动子包含4类控制元件:类控制元件:1. 基本启动子(基本启动子(basalpromoter):): 序列为中心在-25至-30左右的7bp保守区,TATAAAA/T,称为TATA框或Goldberg-Hogness框。与RNA聚合酶的定位有关,DNA双链在此解开并决定转录的起点位置。失去TATA框,转录将在许多位点上开始。2. 起始子(起始子(initiator):): 转录起点位置处的一保守序列,共有序列为:PyPyANT(A)PyPy Py为嘧啶碱(C或T),N为任意碱基,A为转录的起点。DNA在此解开并起始转录。3. 上游上游元件(元件(

4、upstream factor): 普遍存在的上游元件有CAAT框、GC框和八聚体(octamer) 框等。CAAT框的共有序列是GCCAATCT,GC框的共有序列为GGGCGG和CCGCCC,八聚体框含有8bp,共有序列为ATGCAAAT; 4. 应答应答元件(元件(response element): 诱导调节产生的转录激活因子与靶基因上的应答元件结合。 如热休克效应元件 HSE 的共有序列是 CNNGAANNTCCNNG,可被热休克因子HSF识别和作用;血清效应元件SRE的共有序列CCATATTAGG,可被血清效应因子SRF识别和作用。1.通用因子(通用因子(general factor

5、):):作用于基本启动子上的辅助因子称为通用(转录)因子(GTF), 或基本转录因子(basal transcription),为任何细胞类别启动子起始转录所必需,以TF来表示,其中按发现先后次序用英文字母定名,如TFA、TFD、TFH。 2.上游因子(上游因子(upstream factor)或转录辅助因子)或转录辅助因子(transcription ancillary factor):):是指识别上 游元件的转录因子。 3. 可诱导因子(可诱导因子(inducible factor):):在真核生物中,与细胞类型和发育阶段相关的基因表达, 主要通过转录因子的重新合成来进行调节的,是长期的过

6、程。对外界刺激的快速反应则主要通过转录激活物(transcription activator)的可诱导调节。这些诱导的转录激活因子与靶基因上所谓应答元件相结合。类别启动子为RNA聚合酶所识别,他涉及一些小分子RNA的转录。 RNA聚合酶的启动子有3种类型结构:类型类型1基因内启动子:基因内启动子: 如5S rRNA基因的启动子,位于转录起点下游,即在基因内部,是 下游启动子,有两个框架序列,被3种辅助因子所识别。5S rRNA基因的启动子包括框架A(box A)、中间元件(intermediate element)和框架C(box C)3个元件组成。TFA结合在框架A上,然后促使TFC结合,后

7、者结合导致TFB结合到转录起点附近,并引导RNA聚合酶结合在起点上。TFB使RNA聚合酶正确定位,起“定位因子”(positioning factor)作用。 类型类型2基因内启动子基因内启动子: 如tRNA基因的启动子,有两个控制元件,分别为框架A和框架B。 TFC结合框架B,其结合区域包括框架A和框架B,然后导致TFB结合到转录起点附近,并引导RNA聚合酶结合在起点上。 上游上游启动子启动子: 如snRNA基因的启动子,位于转录起点上游。有3个上游元件:OCT(八 聚体基序 octamer motif)、PSE(邻近序列元件 proximal sequence element)、TATA元件。在RNA聚合酶的上游启动子中,只有靠近起点存在TATA元件,就能起始转录。然而PSE和OCT元件的存在将会增加转录效率。谢谢!

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