遗传性肿瘤科室会v课件

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1、单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,1,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,#,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,#,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,1,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,1,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,1,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四

2、级,第五级,1,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,1,二代测序助力,遗传性肿瘤精准,医学,胡 元,华大基因肿瘤,产品部,Cancer is a genetic disease that is,cancer is caused by certain changes togenesthat control the way our cells function,especially how they grow and,divide.?NCI-The Genetics of Cancer?,癌症是一种基因病,除遗传性肿瘤,所有恶性肿瘤癌症的发生都是体细

3、胞基因突变导致的。,在人的一生中,肿瘤细胞是通过一系列进行性的改变而逐渐变成恶性的。,人类基因研究史,肿瘤也会遗传吗?,各类肿瘤中遗传性肿瘤的占比,AACR cancer progress report 2021,肿瘤的治疗效果与发现时期有关,癌症防控:早发现 早诊断 早治疗,Ref,:,WHO world cancer report,世界卫生组织WHO-,“抗击癌症 重在预防!,1/3,的,癌症可以,预防,1/3,的,癌症可以,根治,1/3,的,经过治疗可以长期,生存,检测肿瘤易感基因,找出可以预防的肿瘤,疫苗宫颈癌疫苗,乙肝疫苗,生物制剂胸腺肽、卡介菌多糖,自检,血清学CEA、CA199,

4、影像学X片、B超、CT,内窥镜胃肠镜,病理诊断,手术,放疗,化疗,靶向治疗,血清学CEA、CA199,影像学X片、B超、CT,内窥镜胃肠镜,传统方法,遗传性肿瘤,基因检测,基因科技,根据肿瘤基因变异,及免疫组库情况,,进行病情监测并,及时调整治疗方案,无创,肿瘤早早,筛,基于基因,突变的精准,检测及个体,化,用药方案,1,预防,4,监测,2,早诊,3,诊疗,基因,科技助力肿瘤精,准预防,1,预防,4,监测,2,早诊,3,诊疗,临床基因检测的方法,聚合酶链式反响(PCR:qPCR,dPCR,ARMS,),荧光原位杂交技术(FISH),一代测序Sanger sequencing,二代测序Next-

5、generation sequencing,如果将人生比作一本自传,那么,不同的基因检测方法,,就像不,同的检索方,式,以此探索生命的密码。,位,点检,测是在,目录,中检索,某个,关键词,基因芯,片是在,全书,中检索,某个,关键词,二,代测序是在,全书,中检索,所有,关键词,临床基因检测方法的差异,肿瘤有,遗传性,和,散发性,之分,美国癌症学会 Brozek I et al.J Appl Genet 2021;50(4):379384,第一次打击,是胚系突变,所有体细胞均成为杂合,BRCA,第二次打击,是肿瘤细胞的突变导致细胞失去杂合性,所有体细胞均为野生型,仅病灶处肿瘤细胞突变,家族性肿瘤,

6、与生俱来胚系突变 VS 与时俱进体细胞突变,由于遗传性原因导致的染色体和基因异常,特别是常染色体及其上的基因,而使患某些肿瘤的时机大大增加,病理学上称之为遗传性肿瘤综合征,家族性,/,遗传性肿瘤人群特征,仅用于初步判断人群是否具有家族性,/,遗传性肿瘤的特征,。,各种遗传性肿瘤高危筛查人群的判断需综合临床表现和权威指南的标准进行,。,遗传性乳腺癌卵巢癌综合,征,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌相关基因在,乳腺癌,人群中的检出,情况,由于遗传性原因导致的染色体和基因异常,特别是常染色体及其上的基因,而使患某些肿瘤的时机大大增加,病理学上称之为遗传性肿瘤综合征。,Nils et al.Dtsch Arzt

7、ebl 2021;105(41):70614,遗传风险评估:,基因检测,遗传易感基因与乳腺癌,/,卵巢癌发病风险,乳腺癌,44,%-78%,卵巢癌,18,%-54,%,Balmaa J,et al.Ann Oncol 2011;22(suppl.6);,v131-vi34,乳腺癌,(,31%-56,%),卵巢癌,(,2%-19,%),BRCA1,突变,BRCA2,突变,BRCA1,BRCA 2,BRCA1定位于17q21,约100 kb,含有24个外显子,其中第1、4号外显子不编码氨基酸,另外22个转录出7.6 kb mRNA,最终可编码含1863个氨基酸的蛋白质。而第11号外显子较大,长3.

8、4 kb。已报道其突变位点多于1785个,BRCA2定位在13q12-13,有27个外显子,仅编码区就有11.4K。其中11号外显子几乎含编码序列的一半,完整的BRCA2编码3418个氨基酸的蛋白质。已报道其突变位点多于2021个,参考数据库:,BRCA1/2,基因没,有热点突变,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌,CA Cancer J Clin 2021;64:52-62.,遗传性乳腺癌发病年龄较散发性乳腺癌发病年龄低,随着时间的开展,乳腺癌的死亡率逐渐下降,50岁以上的人群,因为乳腺癌筛查技术的完善有效降低浸润性乳腺癌发病率,50岁以下人群发病率无明显变化,死亡率下降缓慢,乳腺癌筛查有效降低浸润性

9、乳腺癌发病率,,基,因检,测是否可以降低遗传性乳腺癌发病率,?,测位点还是测基因外显子?,BRCA1基因共5592bp,外显子+内含子共81189 bp,其中2600+位点的变异可导致乳腺癌/卵巢癌风险上升,。,Research Themes of HKU Department of Surgery,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌基因检测,检测基因,检测周期,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌(,21,个基因),BRCA1,、,BRCA2,、,CHEK2,、,PALB2,、,BRIP1,、,TP53,、,PTEN,、,STK11,、,CDH1,、,ATM,、,BARD1,、,MLH1,、,MRE11A,、,M

10、SH2,、,MSH6,、,MUTYH,、,NBN,、,PMS1,、,PMS2,、,RAD50,、,RAD51C,20,天,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌(,2,个基因),BRCA1,、,BRCA2,20,天,检测优势,科学 可检测遗传性结直肠癌的,14,个易感基因,结合亚洲人群遗传数据库及华大本地,12000,例样本数据库,综合评估肿瘤风险,精准 标准化的实验操作工序和数据分析流程,直击突变基因,准确率达,99.9%,全面 目标基因外显子区域捕获测序,全面覆盖,查找突变基因,便捷 仅需提供,5mL,外周血或,2mL,唾液即可完成检测,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌基因检测,检测基因,检测周期,遗传性乳腺癌

11、,/,卵巢癌(,21,个基因),BRCA1,、,BRCA2,、,CHEK2,、,PALB2,、,BRIP1,、,TP53,、,PTEN,、,STK11,、,CDH1,、,ATM,、,BARD1,、,MLH1,、,MRE11A,、,MSH2,、,MSH6,、,MUTYH,、,NBN,、,PMS1,、,PMS2,、,RAD50,、,RAD51C,20,天,遗传性乳腺癌,/,卵巢癌(,2,个基因),BRCA1,、,BRCA2,20,天,检测优势,科学 可检测遗传性结直肠癌的,14,个易感基因,结合亚洲人群遗传数据库及华大本地,12000,例样本数据库,综合评估肿瘤风险,精准 标准化的实验操作工序和数

12、据分析流程,直击突变基因,准确率达,99.9%,全面 目标基因外显子区域捕获测序,全面覆盖,查找突变基因,便捷 仅需提供,5mL,外周血或,2mL,唾液即可完成检测,遗传性,结直肠癌,Kenneth,W Kinzler1,et al,Cell,1996,.,遗传性结直肠癌相关综合征,遗传症,致病基因,遗传特点,一生的,患癌几率,%,遗传性非息肉病性结直肠癌,(Lynch Syndrome/HNPCC),mismatch repair(MMR),相关基因生殖系突变:,MSH2,MLH1,MSH6,PMS2,常染色体显性遗传,结肠癌,50-80,家族性腺瘤性息肉病,(FAP),APC,基因生殖系突

13、变,常染色体显性遗传,结肠癌,100,MUTYH,相关性息肉病,(MAP),MUTYH,生殖系双等位基因突变,常染色体隐性遗传,结肠癌,80,错构瘤息肉综合征,(Hamartomatous polyposis syndromes),幼年性息肉病综合征,(Juvenile polyposis syndrome),SMAD4,or,BMPR1A,基因生殖系突变,常染色体显性遗传,结肠癌,39,Peutz-Jeghers,综合征,STK11,基因生殖系突变,常染色体显性遗传,结肠癌,39,遗,传性结直肠癌基因检测,检测基因,检测周期,遗传性结直肠癌,APC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3

14、,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A,20,天,检测优势,科学 可检测遗传性结直肠癌的,14,个易感基因,结合亚洲人群遗传数据库及华大本地,12000,例样本数据库,综合评估肿瘤风险,精准 标准化的实验操作工序和数据分析流程,直击突变基因,准确率达,99.9%,全面 目标基因外显子区域捕获测序,全面覆盖,查找突变基因,便捷 仅需提供,5mL,外周血或,2mL,唾液即可完成检测,APC,基因突变的致病风险,癌症类型,年龄(岁),患癌风险,普通人群风险,小肠癌,到,80,岁,4%-12%,0.2%,结直肠癌,AFAP:,到,80,岁,

15、70%,3.4%,FAP:,到,21,岁,7%,99%,3.4%,其他硬纤维瘤,到,80,岁,10%-30%,0.04%,胃癌,到,80,岁,风险升高,0.6%,甲状腺癌,到,80,岁,1%-2%,1%,胰腺癌,到,80,岁,风险升高,1%,肝母细胞瘤,到,5,岁,1.6%,0.001%,中枢神经系统癌,到,80,岁,1%,0.5%,APC,基因突变的风险管理,癌症类型,风险管理措施,起始年龄,频率,小肠癌,上消化道内镜检查,考虑,MRI,或者,CT,25-30,岁或根据个体情况,每,4,年一次,结直肠癌,乙状结肠镜或结肠镜检查,10-15,岁,每年一次,考虑药物预防(如非甾体类消炎药),根据

16、个体情况,-,考虑结直肠预防性手术,根据腺瘤的分布和密度情况,-,其他硬纤维瘤,MRI,或者,CT,结肠手术后,1-3,年,每,5-10,年一次,胃癌,上消化道内镜检查,根据个体情况,每,3-5,年一次,甲状腺癌,甲状腺检查或超声,18-19,岁,每年一次,胰腺癌,胰腺癌筛查,MRCP,(磁共振胰胆管造影)和,EUS,(超声内镜),根据个体情况,-,肝母细胞瘤,肝脏触诊,婴儿期,每,3-6,个月一次,中枢神经系统癌,考虑,CT,、,MRI,等检查中枢神经系统,根据个体情况,不定,遗传性肾癌,遗传综合症,致病基因,遗传特点,遗传性乳头状肾癌,(,HPRC,),Met proto-oncogene(MET),常染色体显性,BirtHoggDube,综合征,(,BHD,),Folliculin(FLCN),常染色体显性,遗传性平滑肌瘤,/,肾细胞癌,(,HLRCC,),Fumarate dehydratase(FH),常染色体显性,Von HippelLindau,综合征,(,VHL,),VHL gene(VHL),常染色体显性,遗传性前列腺癌,Johns,LE,et al.,BJU,Int

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