文摘索引型数据库PPT课件

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1、文摘索引 型数据库检索与利用 内容提要 文摘库概述 PubMed 文摘索引型数据库概述 报道和揭示文献的外部特征（题名、著者、出处、卷期、页码、时间、文献类型、语种），同时对文献的内容进行摘要性描述的检索工具。 文摘报道和揭示的一般是单篇文章 生物医学领域中外文摘索引数据库美国全科医学文献数据库(Medline)荷兰医学文摘数据库(Embase)美国生物学文摘数据库(BIOSIS Previews)美国化学文摘数据库(SciFinder)美国科学引文索引数据库（SCI）中国生物医学文献数据库（CBM）中文生物医学期刊文献数据库（CMCC） 文摘索引数据库特点 提供原文的摘要信息 摘要信息包括：

2、题目、作者、刊名，或同论文相关信息 数据量大，文献类型多、信息量大 收录文献回溯年代长 收录文献期刊种类多 出版形式多样 文摘索引数据库使用情况 文 摘 数 据 库 的 作 用1. 可 了 解 和 把 握 某 课 题 领 域 研 究 动 态 和 研 究 现 状2. 找 到 全 文 的 重 要 和 必 要 线 索3. 判 断 自 己 课 题 的 新 颖 性4. 对 不 熟 悉 的 语 种 文 章 ， 看 英 文 摘 要 即 可5. 科 研 评 价 （学位）论文选题、开题、课题查新时文献调研的重要途径 文摘索引数据库掌握要领1.数据库的概况2.数据库的结构3.数据库的检索界面4.数据库的检索技巧与

3、方法 PubMed数据库 主要内容1. 数据库概况2. 数据库检索机制3. 数据库的组成结构4. 检索界面5. 检索方法与技巧 PubMed概况1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)2.类型：Web数据库3.网址：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。6.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。 PubMed数据来源1.ME

4、DLINE：包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。 PubMed检索机制1自动截词转换匹配功能(Automatic Term Mapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH translation table)、期刊刊名表(Journal translation table)、全体

5、作者表(Full author translation table)、作者索引(Author Index)、全体调查者表(Full investigator translation table)、调查者索引(Investigator Index)。如果在以上6个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。2短语检索(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行

6、MeSH词的扩检。 1.逻辑运算符： 逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。Heart attack* 会关闭自动转换匹配检索词，myocardial infarction, myocardial stunning, shock等词 3.双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。4.检索字段标识符：tag，tag为字段名称。 ti，au，ta，so，la，pt。PubMed检索运算符 常用字段组成 标识符 字段名称T

7、I TitleAU AuthorAD AffiliationAB AbstractDP Publication DateEDAT Entrez DateSO Source TA Journal Title AbbreviationMH MeSH TermsPT Publication Type 检索界面 基本检索 高级检索 MeSH Database检索 限定检索 期刊查询(Journals Databases ) 引 文 匹 配 器 (Citation Matcher) 临 床 查 询 (Clinical Queries) 打开搜狗浏览器用户名：jf20120001密码：123456 Pub

8、Med检索方法1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法3.MeSH Database检索：MeSH主题词界面下进行的检索方法 基本检索 基本检索1.关 键 词 、 词 (词 组 )或 短 语 ：2.作 者 ： Smith JS 或 Smithau3.期 刊 刊 名 ： GENE THERAPYTA， JAMATA4.截 词 ： CHEMO*5.复 杂 表 达 式 ： CANCER AND THERAPY6.#1 AND #2 艾滋病的药物治疗 Aids drug therapy Search details检索过程(acquired immunod

9、eficiency syndromeMeSH Terms OR (acquiredAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND syndromeAll Fields) OR acquired immunodeficiency syndromeAll Fields OR aidsAll Fields) (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drug

10、All Fields AND therapyAll Fields) 修改后的检索结果 高级检索 高级检索 MeSH Database检索 输入查找的主题词 Aids drug therapy 主题词注释 树状结构表 款目词 检 索 步 骤 查看检索历史 限定检索1.限 制 检 索 或 条 件 检 索 ： Limits( 1 )日 期 ： D a t e o f p u b l i c a t i o n D P 原 始 文 献 出 版 日 期 ； E n t r e z DateEDAT文献首次录入PubMed日期；MeSH DateMHDA文献被MeSH词条标引日期。 (2)地址：单个词加标

11、识符ad(3)带有摘要文献的检索 ：CANCER AND hasabstract (4)数据库子集的限定：特殊主题的检索 AMERICAN AND history sb 2.限定检索结束后，及时取消限定条件 限定检索 限定检索 点击取消 PubMed几种检索方法的选择l 基本检索l 高级检索l MeSH Database检索 举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献基本检索 1.检索表达式： children asthma drug therapy2.直接输入检索框中，进行检索 检索过程（Search details） (childMeSH Terms OR childAll Fields OR ch

12、ildrenAll Fields) AND (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll Fields) AND (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields)修改检索式： childMeSH Terms AND asthmaMeSH Terms AND drug therapySubheading 举例：儿童

13、哮喘的药物治疗方面文献MeSH Database检索1.确定主题词：child asthma drug therapy(副主题词) 2.查找主题词 举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献高级检索1.确定检索词：child asthma drug therapy2.选择检索字段3.输入检索词 Journals Databases主 题 、 刊 名 全 称 或 缩 写 、 ISSN 单篇文献匹配器 临床咨询 特殊专题咨询 检索结果 显示 保存 打印 显示格式 Summary(简 要 格 式 )Abstract（ 文 摘 格 式 ）MEDLINE 保存格式 1.File(文 件 ) 2.Format（ 格

14、 式 ） 检索策略的存储和调用 使用My NCBI(Cubby) 首先要登记注册 保存检索策略 定期浏览新的检索结果 注册或登录个人帐号 注册后的功能 保 存 、 修 改 、 删除 检 索 式 其它功能 全文链接 相关文献链接 相关数据库的链接 RSS阅读器的使用 全文链接 全文链接 检索练习1.检索有关“禽流感(bird flu)预防控制方面”的文献2.检索微量元素缺乏(trace elements)与皮肤病(skin diseases)关系的文献（限英文综述）3.利巴韦林（ribavirin）治疗SARS方面的综述文献4.眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blind

15、ness)的文献5. 北京大学韩济生教授发表的英文文献6.CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献 1.检索过程和步骤 2021/6/1675 （1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：预防控制禽流感 事物与特征的关系 2021/6/1676 （2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。（3）编制检索策略。 Influenza in Birds / prevention and control （禽流感 / 预防控制） 其中 主题词为： Influenza in Birds（禽流感） 副主题词为： prevent

16、ion and control （预防控制） 2.检索过程和步骤 2021/6/1677 （1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下；皮肤病微量元素缺乏 因果关系 此外，课题还要求只要英文综述文献。综述英文 + 2021/6/1678 （2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。 此外， PUBMED数据库提供有检索结果滤镜（Result Filters），可对检索结果按照不同分面进行显示，其中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。 2021/6/1679 （3）编制检索策略。 Trace Elements / deficiency

17、（痕量元素 / 缺乏） Skin Diseases / etiology （皮肤疾病 / 病因学） 其中 主题词为： Trace Elements 、 Skin Diseases 副主题词为： deficiency 、 etiology PubMed检索小结1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题2.Search Details描述检索过程3.*关闭自动转换匹配功能4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果 谢谢！ 文摘索引数据库特点 提供原文的摘要信息 摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息 数据量大，文献类型多、信息量大 收

18、录文献回溯年代长 收录文献期刊种类多 出版形式多样 PubMed概况1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)2.类型：Web数据库3.网址：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。6.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。 Search details检索过程(acquired immunodeficiency syndrom

19、eMeSH Terms OR (acquiredAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND syndromeAll Fields) OR acquired immunodeficiency syndromeAll Fields OR aidsAll Fields) (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND th

20、erapyAll Fields) 检索过程（Search details） (childMeSH Terms OR childAll Fields OR childrenAll Fields) AND (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll Fields) AND (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fiel

21、ds)修改检索式： childMeSH Terms AND asthmaMeSH Terms AND drug therapySubheading 举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献MeSH Database检索1.确定主题词：child asthma drug therapy(副主题词) 2.查找主题词 举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献高级检索1.确定检索词：child asthma drug therapy2.选择检索字段3.输入检索词 注册后的功能 保 存 、 修 改 、 删除 检 索 式 1.检索过程和步骤 2021/6/1689 （1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：预防控制禽流感 事物与特征的关系