药物设计学

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1、一 选择题1. 以下哪个不是生物信息的特征 DA级联反应B网络结构C多样性D不可逆性2. 体内信号转导的主体是 AA 蛋白质 B 小分子物质 C 多糖 D 脂质3凡是由细胞分泌的,能够调节特定靶细胞生理活动的化学物质都称为细胞间物质,称为第一信使,它属于 DA物理信号B机械力C生物体外信号D化学信号3. 下列哪个不是细胞间化学信号分子的特点 BA特异性B持续性C时间效应各异D复杂性4. 第三信使是下列哪种物质CA 花生四烯酸B 二十碳酸类C DNA结合蛋白D磷脂酰肌醇5. 基于调节第二信使的药物设计不是 AA维生素D受体配体的药物设计B调节CAMP和cGMP信号通路的药物设计C 调节激酶系统的

2、药物设计D调节钙的药物设计6. 下列哪个是基于调节第三信使的药物设计 AA 过氧化物酶体增殖因子活化受体配体的药物设计B 磷酸二酯酶抑制剂活化受体配体的药物设计C 磷酸二酯酶 V 的抑制剂活化受体配体的药物设计D 糖原合成激酶-3 抑制剂活化受体配体的药物设计7。不是对信号转导系统的药物干预的选项是A 影响信号分子的药物B 影响信号接受系统的药物C 影响信号传输系统的药物D 影响细胞内信号转导系统的药物1. 生物体内嘌呤核苷酸的合成除了补救合成外,还有( )A. 从头合成B。中间合成C。最后合成D。中间体合成2. ( )是嘧啶生物合成的重要中间体A. 天冬氨酸B。氨甲酰磷酸C。乳清苷酸D。谷氨

3、酰胺3. 既是核酸生物合成的代谢产物,也是红细胞发育生长的重要因子的 是( )A. 核苷B。磷酸C.戊糖D叶酸4. 氨基嘌呤和甲氨嘌呤是最早用于肿瘤临床治疗的( )还原酶抑制剂A.血清铁蛋白B。黏蛋白C。二氢叶酸D.甲胎蛋白5. ()可以影响IMP、AMP或GMP的形成,从而抑制DNA和RNA 的合成A.次黄嘌呤B.鸟嘌呤C.腺甘酸D。巯嘌呤核苷酸6. 下列哪个不是反义药物与传统药物的区别( )A.特异性较强B。信息量较大C.反义药物以核酸为靶点D副作用可能较多1在目前已知的500多种药物作用靶标中,酶是最重要的一类,约占( )A.25%B。40%C.45% D。50%2。酶的激活作用不包括以

4、下( )A.酶原的激活B.酶的变构激活C。酶的共价修饰激活D。酶的活性位点激活3。( )定量的描述了稳态条件下酶催化反应的动力学参数。A.米式方程B。米歇尔方程C。Hansch 方程D.Whitney方程4。下面哪个不是从动力学角度划分酶抑制剂的( )A。快速结合B。缓慢结合C.快速-紧密结合D。缓慢一紧密结合5。药物的酶抑制剂不具备以下哪种特征( )A.对靶酶的抑制活性B.对靶酶的特异性C。对靶酶的高效性D。良好的药物代谢与动力学性质6以下哪种不是已上市的DDP IV抑制剂()A.西他列汀B。维格列汀C。沙格列汀D.阿格列汀7。腺苷脱氨基酶可以使腺苷脱氨基生成肌苷的反应速度提高( )倍。A.

5、 1013B。101C。1011 D。10128. ( )系统是机体重要的体液调节系统A.肾素-血管紧张素B。胰岛素C.促甲状腺激素D。肾上腺素9. ( )是引起全球艾滋病蔓延的主要病原体A。 HIV1B.HIV2C。HSVD.VZV答案 1O C 2O D 3OA 4OC 5O C 6.D 7.D 8。A 9.A1、肽分子中使原子或原子团结合在一起的力是(B )A.共价键B.非共价键C.非极性键Do极性键2、下列哪个不是肽类药物的缺点(D)A. 易被内源性肽酶快速降解B. 排泄快、作用时间短C. 不能透过血脑屏障D. 可以在低数量级显示出受体亲和力3、下列关于氨肽酶N错误的是(D)A.是一种

6、金属内切蛋白酶B.是一种蛋白水解酶Co表达于肿瘤细胞表面Do其催化化学中心有一个镁离子4、类肽常见的修饰方法不包括(D)A环化修饰B.引入限制性氨基酸C.骨架修饰D.三级结构模拟物5、关于卜分泌酶错误的是(A)A其活性部位有相对亲水性、短厚的特点B. 抑制卜分泌酶是治疗阿尔茨海默病一条非常有前景的途径C. 它是产生卜淀粉样蛋白的关键酶D. 可在P分泌酶底物的肽序列中引入Sta来设计卜分泌酶抑制剂6、类似物设计的常用途径不包括(D)A. 生物电子等排取代.B. 环类似物(合环与开环)C。烃链同系化、环的大小改变及环位置异构体。D。调节药物所处溶剂的PH7、钛二级结构的模拟结构不包括(B )A.a

7、螺旋模拟物Bop螺旋模拟物B.P-转角模拟物D.p折叠模拟物1 药物从给药部位吸收进入血液后,由循环系统转运至体内各脏器组 织(包括靶组织)的过程称为(B)A 药物的转移 B 药物的分布 C 药物的转运 D 药物的吸收2药物排泄的主要途径(D)A 肺和口腔排泄 B 口腔和皮肤排泄 C 皮肤和肾排泄 D 肾排泄和 肝消除3可以有效改善药物水溶性的方法是(A )A增加离子化基团B增加亲脂性C降低亲脂性D增加亲水性4 (B)-般被用来描述化合物的代谢速度和程度,是影响药物的ADMET 性质的主要因素之一.A透膜性B代谢稳定性C代谢清除率D代谢活性5 hERG通道阻滞剂的共性结构特征不包括(D)A 一

8、个碱性氮离子B亲脂性较强C缺乏阴离子基团D 一个酸性离子6化合物的(A)性质是影响其能否成药的关键因素.A ADMET B ADMTE C AMTED D ADEMT7 (A )是药物具有选择性作用的前提。A特异性分布B专一性分布C均匀分布D特定分布1前药设计的目的不包括下列哪项(D)A促进药物吸收B提高药物在作用部位的特异性C遮蔽药物的不适气味D为了降低成本2下列药物属于前药的是(A)A磷苯妥英钠B青霉素C新斯的明D强心苷3青霉素类抗生素海他西林制成前药的目的是( B )A提高药物在作用部位的特异性B提高稳定性延长作用时间C增加水溶性,改善药物吸收或给药途径D为了降低成本4下列药物不属于孪药

9、的是(D)A对乙酰氨基酚一布洛芬B萘普生一对乙酰氨基酚C普齐地洛D奥美拉唑5生物前体药物的活化方法不包括(A)A 硝化活化 B 氧化活化 C 还原活化 D 消除活化6前药设计的原则不包括下列哪项(C )A 共价键连接,在体内经酶解或化学断裂B 前药本身鹦鹉火星或活性低于母药C 载体分子应无毒且具生理活性D 前药在体内能定量转化7哌氨托美丁制成前药的目的是(B )A 提高患者的依从性B 提高药物在作用部位的特异性C 延长作用时间D 促进药物吸收1. 组合库的构建方法之一的平行法不包括以下哪一项(D)A.多针法B。茶叶袋法C.点阵法D。裂分法2. 抗菌化合物等化合物库的建立主要应用以下哪种技术(A

10、)A.平行法B.裂分法C,物理法D基因工程技术3. 点阵法是以(A )为固相载体的合成技术A.纤维素制片B.聚苯乙烯二酯C.聚乙烯小棒D。以上答案均不正确4. 组合库合成技术不包括以下哪一项(A)A.气相合成技术B.固相合成技术C。液相合成技术D。动态组合化学5. 下列哪一项不属于高通量筛选技术(D )A.化合物样品库B.自动物操作系统C。高效率数据处理系统D。固相 合成技术6. 高通量筛选中最常见的筛选方法(AA.均相筛选法B.紫外可见筛选技术C。化学发光筛选技术D.邻近闪 烁筛选技术7. 高通量药物筛选方法的步骤不包括(A)A.计算机虚拟筛选B.初筛和复筛C.深入筛选D。确证筛选1. 一般

11、来说,基于片段分子的设计研究可以分成三个阶段,下列哪项不是( )A 片段筛选B 片段与药靶复合的结构确证C片段链接D基于片段构建新分子2. 片段与靶的结合力一般比较弱,通常为()级A mmolB nmolC |imolD mol3. 下列哪一项不是基于片段分子设计的研究方法( )A 片段库的建立B 片段库的筛选C 片段库的检测D 结构信息的确定4.电喷雾电离质谱是()检测的代表方法A共价吉合C离子结合A 离子共振技术B 磁共振技术C 质谱技术D X射线单晶衍射技术B 非共价结合D 非离子吉合5. ( )技术是研究分子吉构最有效和最精准的方法6. 一般来说,将先导化合物优化至候选药物的过程会伴随

12、着化合物分子量和疏水性的( )A 升高 B 降低 C 不变 D 先升高后降低7. 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)是治疗2型糖尿病的重要 靶点,它有三种亚型,下列哪项不是( )A PPAR B PPAR C PPAR D PPAR8. 下列哪项不是从片段到先导化合物的设计方法( )A片段生长法B片段连接法C片段自组装法D片段拆分法9. ()是治疗老年痴呆的重要靶点A神经氨酸酶抑制剂B乙酰胆碱酯酶抑制剂C尿激酶抑制剂D基质金属蛋白酶抑制剂10. 一般来说,两个 mmol 级活性的片段能够连接或融合为一个( )级的新化合物,这种现象称为“加和效应”A mmolB nmol C pmolD m

13、ol答案 1 C 2 A 3 C 4 B 5 D 6 A 7 B 8 D 9 B 10 C二 填空题1. 理想的药物必须具有高度的 选择性和 特异性。2. 多肽有三种不同形式:无分支开链多肽、分支开链多肽和 环状多肽.3. 蛋白质的三级结构主要是靠 氢键、 盐键 及 疏水键 来维系.4. 青霉素的抗菌作用是由于它能和细菌细胞壁生物合成中的 转肽酶 生成共价键。5. 参与蛋白质生物合成的RNA有三种:mRNA、 tRNA 和 rRNA 。6. 生物靶点可分别以受体、酶、离子通道和核酸 为靶点进行分类.1. 肽和蛋白质是由相同或不同的经酰氨键缩和形成开链或环状 聚合物(氨基酸)2。肽分子相互作用的

14、本质为非共价键作用,包括有-,-, 是由肽键和侧链上特定基团的性质所决定,对维持多肽或蛋白质的结 构和功能起重要的作用。(盐桥键,疏水作用,氢键)3。-产生与甲状腺特异细胞(降钙素或甲状腺激素)4。以内源性生物活性肽为先导物,设计类肽的途径有,一通过改变天 然活性肽的分子结构,-;二设计非肽模拟物。(衍生出活性肽的类 似物或非肽类化合物)5. 在生物活性肽的序列中,引入限制性氨基酸的主要目的是获得柔性 肽分子构像的局部限制 ,尤其是限制-和键的旋转及由共价和 非共价空间相互作用引发的侧链构像变化。(NC和CC(O)6. 类肽设计的重要方法是-.(通过生物等排置换法对肽骨架进行修 饰)1。目前,

15、常用的识别片段技术主要有生物化学检测、表面等离子、(磁共振)(质谱 )x射线单晶衍射。2. 磁共振技术筛选片段的方法一般分为两种:(检测配体的筛选)(检测受体的筛选)3。质谱检测技术分为非公价结合法和共价结合法(。电喷雾电离质谱) 是非共价结合检测的代表方法,(tether技术)是共价结合检测的代 表方法。4. 结晶筛选不仅可以检测片段是否(结合),而且还能精确地检测出结 合在靶蛋白的(具体位置)5. 从片段到先导化合物的设计方法主要分为以下三种:(片段生长)、 (片段链接)片段融合、(片段自组装法).6. 一般来说,两个 mmol 级活性的片段能够连接或融合为一个 umol 级的新化合物,这

16、种现象称为“(加和效应)”。基质金属蛋白酶是(抗 肿瘤药物)作用靶点。乙酰胆碱酯酶抑制剂是治疗(老年痴呆)的重 要靶点1。化学基因组学将化学和生命科学相结合,采用组合化学和高通量 筛选技术,利用小分子化合物作为探针,探究生理和病理的生物学途 径,硏究靶蛋白和基因的结构和功能2. 化学信息学是在化学计量学和计算化学的基础上演化和发展起来 的。3。化学数据库的创建包括化学信息的创建、存储和展示4. 化学基因组学有正向化学基因组学和反向化学基因组学。5。化学基因组学的关键技术是化合物库的建立、高通量筛选和靶点 蛋白的鉴定。6. 化学基因组学的技术有质谱技术、磁共振技术、差热分析法和其 他新技术。1、

17、类药性是( )和( )的总和.药代动力学性质 安全性2、( )、( )和( )是基于理化性质的类药性评价。亲脂性 pKa 水溶性3、( )用于评价化合物通过生物膜的能力,是口服药物生物利用度 高低的决定因素之一. 透膜性4、常用的表示血脑屏障穿透能力的目标参数是( ).血脑分配系数5、用( )替代酯基常常可提高化合物的代谢稳定性。酰胺基6、ADMET 包括吸收、分布、代谢、排泄和( )。 毒性三 名词解释组合化学 :是将一些基于小分子构建模块通过化学或者生物合成 手 段,将他们系统地装配成不同的组合,由此得到大量具有结构多 样性特征的分子,从而建立化学分子库的方法。高通量筛选技术:是指以分子水

18、平和细胞水平的实验方法为 基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行实验过 程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据 ,以计算机对实验数据 操作进行分析处理,同一时间对数千万样品检测,并以相应的数据库 支持整体运转的体系。化学信息学:是一门应用信息学方法来解决化学问题的学科,研究 的范围是化合物的性质和转化. 生 物信息学:是应用数学,信息学,统计学和计算机科学的方 法研究 生物学的问题。基于片段的药物设计:将随机筛选和基于结构的药物设计有机结 合的药物发现新方法1. 组合化学是将一些基本小分子构建模块通过(化学合成)或(生物合 成)的手段,将它们系统地装配成不同组合,由此得到大量

19、具有结构 多样性特征的分子,从而建立化学分子库的方法。2. 组合库的构建方法通常分为(平行法)和(裂分法)3. 组合库合成技术既可以采用固相也可以采用液相,研究者更追求哪 一项( 液相合成技术)4. (组合化学)的运用加快了制备大量化合物的速度,提高了发现新 药的成功概率5. 与传统化学技术相比,动态组合化学增加了(靶标模板)方法6. 组合化学的目的是通过(生物活性筛选)发现新的先导化合物或者 对先导化合物进行优化7. (高通量筛选)是对已有化合物进行体外随机筛选的一种方法一、信号:是指传递信息的载体,有许多小分子和大分子化学物质, 也有物理因素(生物电、温度等)。二、信号转导:是指经过不同的

20、信号分子转换,将信息传递到下游或 效应部位.三、第一信使:由细胞分泌的,能够调节特定靶细胞生理活动的化学 物质。四、第三信使:负责细胞核内、夕卜信息传递的物质,又称为DNA结合 蛋白。五、核受体:是位于细胞核内或与相应配体结合后由胞浆转到细胞核 内的一大类结构类似的蛋白质构成的一个超家族。P 物质内皮素逆向翻转异构体逆转修饰金属蛋白酶 答案:(1)存在于人,哺乳动物和禽类的大脑和肠道中的十一肽(2)产生于内皮细胞的由二硫键形成的环状二十一肽(3)将酰胺键中的羰基和亚氨基互换,以得到肽的类似物(4)在肽键逆转的同时,常伴随着氨基酸构型的转变,由L变 为D构型,这样生成的类肽。(5)一大类活性中心

21、中含有金属离子的蛋白酶的总称 核酸:生物体内遗传信息储存与传递的一个重要载体. 叶酸:核酸生物合成的代谢物,也是红细胞发育生长的重要因子。 病毒:目前我们认识的最小的病原微生物,大小在10250nm之间。RNA 干扰:生物界普遍存在的一种抵御外来基因和病毒感染的进化 保守机制.PNA:类以酰胺键连接骨架替代核酸中核糖与磷酸二酯键骨架构成 的核酸类似物。1 (信号传导)是指经过不同的信号分子转换,将信息传递到效应部 位.2 生物信息的特征分别是(级联反应),(网络结构),(多样性),(可 逆性)。3 (细胞分泌化学信号)是细胞间通讯的最主要途径。4 凡是由细胞分泌的,能够调节特定靶细胞生理活动化

22、学物质都称为 细胞间信息物质,称为 (第一信使).5 (钙拮抗剂(或钙通道阻滞剂)能抑制跨膜钙内流及细胞内的钙释 放.6 (核受体)是位于细胞核内或与相应配体结合后由胞浆转到细胞核 内的一大类结构类似的蛋白质构成的一个超家族.第四章 基于酶促反应原理的药物设计变构效应:体内一些代谢物可以与某些酶分子活性位点以外的某部位 可逆结合,使酶发生变构并改变其催化活性,称为变构效应。 合理酶抑制剂设计:是将有关酶催化机制和结构的相关知识用于指导 药物的设计与发现。前列腺素:是一类在细胞内含量很低,但具有很强生理活性的不饱和、脂肪酸类化合物。肾素-血管紧张素系统:是机体重要的体液调节系统。问答题一.什么是

23、核酸的从头合成与补救合成?它们在药物设计中的意义何 在?答:生物体内嘌呤核苷酸的合成有两种途径。其一是从头合成途径, 即利用磷酸核糖、氨基酸、及二氧化碳等简单物质,在一系列酶的作 用下合成嘌呤核苷酸其二是补救合成途径,即利用体内游离的嘌呤或 嘌呤核苷在酶的作用下合成嘌呤核苷酸。另外川密啶核苷酸的合成也 分为从头合成与补救合成,其从头合成与嘌呤核苷酸的从头合成类 似,放射性核素示踪表明,嘧啶环上各原子也是来源于生物体内的简 单物质;其补救合成与嘌呤核苷酸的补救合成也类似,磷酸化酶能催 化各种嘧啶与核糖1-磷酸或2-脱氧核糖1磷酸生成核苷的反应。它们在药物设计中的意义:1票呤核苷酸的从头合成过程通

24、过“反馈 抑制进行精确的控制,这种交叉调控作用对维持ATP与GTP的浓 度具有重要的意义;2。嘌呤核苷酸的补救合成途径一方面与从头合 成相比节省能量和氨基酸消耗;另一方面体内某些组织如脑、骨髓由 于相关酶的缺乏,不能从头合成嘌呤核苷酸,他们只能利用游离的嘌 呤或嘌呤核苷合成嘌呤核苷酸,所以补救合成途径对于这些组织器官 来说具有重要的意义.某些癌细胞或病毒感染细胞核苷酸的需求比正 常细胞大,补救合成是主要来源,因此补救合成也是设计化疗药物的一 个关键性环节;3。而嘧啶的补救合成途径可以运用于区别正常细胞和 病毒感染细胞,设计抑制病毒感染的药物。二基于糖环修饰的核苷类抗病毒药物具有什么结构特征?它

25、们的主 要作用机制是什么?答:糖环修饰最常见的方式是针对脱氧核糖的3羟基在DNA链的延 伸过程中的作用而进行的。通过对3羟基进行非羟基化取代、脱氧 修饰或L-构型修饰后,这些核苷类似物将被细胞激酶逐步磷酸化而 生成三磷酸衍生物。其作用机制是:核苷类似物发挥抗病毒活性的一 个途径是由于这些三磷酸衍生物是DNA聚合酶底物dNTP的竞争性 抑制剂,他们通过与DNA聚合酶结合并连接到DNA链上,由于其3- 羟基的缺失,不能再继续进行53的链的延长,因而使病毒DNA的复 制被终止。三。对天然结构的反义核酸进行化学修饰的意义何在?化学修饰途径 主要有哪些?答:磷酸二酯键组成的天然的寡核苜酸易受体内各种酶的

26、降解,同时 也难于透过细胞膜,因此对天然的寡核苜酸进行化学修饰是提高寡核 苜酸药物的生物利用度所必需的。反义核酸的修饰方法可归纳为:1磷酸二酯键的修饰2核糖环的修 饰;3。碱基的修饰;4.缀合物的修饰;5.将磷酸二酯键和糖环骨架用 肽键取代形成肽核酸。四.反义核酸在进行化学修饰时要进行哪些方面的考虑?答:1与靶RNA的亲和能力2对碱基错配的识别能力,应不与错 配序列结合;3。对核酸酶的稳定性,应能拮抗外切酶和内切酶的水解;4。对RNaseH的激活能力与RNA形成杂合体后有能成为酶的底物 与不能成为底物之分;5.化学稳定性,应能在pH7o 4的生理条件下 稳定存在;6.脂溶性,应与细胞膜或细胞组

27、织具有高亲和性;7。应具 有足够高的血药浓度;&与蛋白质的结合,非反义作用通常与此相 关,与血浆蛋白结合后往往能提高体内稳定性;9。合成成本,应能在 合理的成本范围内进行大规模合成。1 药物在体内的作用过程?答:(1) 吸收 (2) 分布 (3) 代谢 (4) 排泄2 组合化学的概念是什么?其合成新化合物总数的决定因素有哪些? 答: 组合化学是将一些基本分子构建模块通过化学或生物合成的手 段,将他们系统的装配成不同的组合,由此得到大量具有结构多样性 特征的分子,从而建立化学分子库的方法。其合成新化合物的总数取决于两个因素 (1) 每一步反应中应用化合 物的种数 (2) 反应的步数3 根据化合物

28、库的来源不同,可以将发现先导化合物的方法分为哪 些?答: (1) 大范围 多品种的随机筛选发现先导化合物(2) 通过主题库的筛选发现先导化合物(3) 基于已有知识进行定向筛选发现先导化合物(4) 运用虚拟合成和虚拟筛选发现先导化合物4 基于片段分子设计的研究方法是什么,它有什么优点?答:研究方法: (1) 片段库的建立(2) 片段库的筛选(3) 结构信息的筛选(4) 基于片段构建新分子优点:(1) 可以探索更为广阔的化学空间(2) 命中率高(3) 发现新药的可行性高药物设计简答题注意事项:1. 软药设计的基本原则是什么? 答:整个分子是先导物的生物电子等排体,结构极相似 易代谢的部分能被酶水解

29、,但分子骨架是稳定的 易代谢部分的代谢 是药物失活的主要或唯一途径 通过易代谢部分的代谢附近的立体和电性因素,控制可预测的代谢速 率代谢产物无毒,低毒或没有明显的生物活性 代谢过程不产生高度 反应活性的中间体软类似物的设计从季胺盐型表面活性剂开始的 一 些阳离子表面活性剂对微生物有效,但毒性大。2. 生物大分子结构方面的特征和共性是什么 ?其功能方面的特征和 共性有哪些? 答:结构方面:1具有多种单体的共聚物。包括蛋白质多肽链的一级 结构、DNA和RNA多聚核苷酸链的一级结构、多糖。2具有多层次 结构。包括蛋白质的三维空间结构、DNA和RNA的三维空间结构。 3生物高分子结构的可变性。包括一级结构的改变、高级结构的改变、 结构可变性的限度。功能方面:1、作用的专一性。生物大分子在机体内行使各种各样的功 能,参加各种反应,它们所行使的功能和参加的反应都有高度专一性。2、作用的配合和协调.生物大分子中的亚基之间或同一个分子中不同 区域间都相互联系 ,生物体内的成千上万的生物大分子更是相互配 合,彼此统一。3。经典的生物电子等排体包括那些?答:一价原子和基团 二价原子和基团 三价原子和基团 四取代 的原子 环系等价体4 药物的受体相互作用的动力学说有哪几种? 答:占领学说 诱导契合学说 变构学说 速率学说 大分子微扰学说 二态模型的占领活化学说

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