分子生物学检验

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1、第二章 临床分子生物学检查标志物1 分子生物标志物:指可以反映机体生理,病理状态的核酸、蛋白质、代谢产物等生物分子,是生物标志物的一种类型。. 中心法则:指遗传信息从DA传递给RNA,再从N传递给蛋白质,即完毕遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完毕DNA的复制过程。这是所有有细胞构造的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RN自我复制(如烟草花叶病毒等)和在某些病毒中能以NA为模板逆转录成DA的过程(某些致癌病毒)是对中心法则的补充。3 基因组:是一种细胞或一种生物体的整套遗传物质,涉及基因和非编码A。4. 原核生物基因组特性:1)原核生物基因组较小:大小一般在10617碱基

2、对之间;)原核生物的类核构造:原核生物基因组D位于细胞中央的核区,没有核膜将其与细胞质隔开在蛋白质的协助下,以一定的形式盘曲,折叠包装起来,形成类核;3)原核生物的操纵子构造:原核生物的构造基因大多数按功能有关性成簇地串联排列于染色体上。构造基因同其上游的调控区以及下游的转录终结信号,共同构成了一种基因体现单位,即操纵子构造;4)原核生物的构造基因:原核生物的构造基因中无内含子成分,多数是单拷贝基因,基因与基因之间有反复序列存在;)具有编码同工酶的基因:此类基因体现产物的功能相似,但基因构造不完全相似;)具有可移动DNA序列:可移动的DNA序列通过不同的转移方式发生基因重组,变化生物体的遗传性

3、状,使生物体更适应环境的变化;5 质粒:指细菌细胞染色体以外,能独立复制并稳定遗传的共价闭合环状分子;.人类基因组涉及细胞核内的核基因组(19bp)和细胞质内的线粒体基因组(65bp),人类基因组中存在大量的非编码序列和反复序列;7. 小卫星DNA:由0100bp构成的反复单位反复几十到几百甚至几千次,形成的15bp的短DNA,又称可变数目串联反复;. 微卫星DNA:核心序列为16bp,可以反复上百次,又称短串联反复;9. 多基因家族:指由某一祖先基因通过反复和变异所产生的一组基因,在多基因家族中,某些成员并不产生有功能的基因产物,这些基因称为假基因;10. 多态性:当某种变异相对常用,在群体

4、中的频率高于时,则称为多态性,频率低于%的变异称为突变;(错义突变,无义突变,N加工突变);11.多态性类型:限制性片段长度多态性;小卫星和微卫星多态性;单核苷酸多态性(重要指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的NA序列多态性);拷贝数多态性(指基因组中较大的片段(00p2b)发生了拷贝数的变化);12 DNA甲基化: ()定义:指生物体在N甲基转移酶的催化下,以S腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将甲基转移到特定的碱基上的过程; (2)作用位点:腺嘌呤的N6,胞嘌呤的N4,鸟嘌呤的N,胞嘧啶的C5; (3)作用机理:3. 微小RNA:是一类内源性的具有调控功能的非编码N,其大小长约202个核苷酸,

5、在细胞内重要发挥基因转录后水平调控作用;1. 长链非编码NA:长度不小于200bp的非编码RNA;第四章:核酸杂交技术1. 融解温度(Tm):DN的变性会在一种很狭窄的温度范畴内发生,这一温度范畴的中点被称为融解温度;T值的大小取决于核酸分子的-C含量。GC碱基含量越高,m值越高;2. 变性:在一定条件下,双螺旋之间氢键断裂,双螺旋解开,DA分子成为单链,形成无规则线团的过程;3. 复性:变性NA只要消除变性条件,具有碱基互补区域的单链又可以重新结合形成双链的过程;4. ouhrn印迹杂交:过程:1)将待测定核酸分子通过一定的措施转移并结合到一定的固相支持物(硝酸纤维素膜或尼龙膜)上,即印迹;

6、2)固定于膜上的核酸同位素标记的探针在一定的温度和离子强度下退火,即分子杂交过程;原理:运用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的D片段,将胶上的NA变性并在原位将单链N片段转移至尼龙膜或其她固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相相应构造的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反映显色,从而检测特定NA分子的含量;特点:特异性和敏捷度高;5 Northrn杂交靶核酸是NA,uthern杂交靶核酸是DNA;第五章:核酸扩增技术1. 聚合酶链反映技术(PCR):由美国Cetus公司K.Mulli博士于1983年建立,它是一种能在试管内模仿细胞内核酸复制过程,也就是能在体外特异地扩增一段特定核酸

7、序列的技术;2 CR的基本原理:根据DNA半保存复制的机理和体外DNA分子于不同温度下可变性,复性的性质,通过人为控制体外合成系统的温度,通过变性、退火、延伸三个环节扩增目的NA片段;. CR的基本过程: )变性:将被复制的DN片段在高于其熔点温度(Tm)的条件下(9495)加热,使DNA双螺旋构造的氢键断裂而解螺旋,形成两条单链分子作为扩增反映的模板,以便与引物结合; 2)退火:将反映体系的温度减少至引物的熔点温度如下(Tm ),以便使引物能与模板DNA序列互补结合,形成杂交链; 3)延伸:将反映体系的温度升至72,此时反映体希按照模板链的序列以碱基互补配对的原则依次把NP加至引物的3端,在

8、TDA聚合酶的存在下,杂交链不断延伸,直至形成新的NA双链;4.当温度升至其熔点温度(T)时荧光量急剧下降而形成熔点曲线,其波峰所在温度即代表被检DNA分子的m值。T值的大小取决于NA分子的长度和其序列中G/C碱基含量;第六章:核酸实时定量检测技术. 实时荧光定量PCR技术:指在PC反映体系中加入荧光基团,运用荧光信号累积实时监测整个CR反映过程,最后通过有关数据分析措施对目的基因进行定量分析的技术;.扩增曲线:指在实时荧光PCR扩增过程中,对整个R反映扩增过程进行了实时的检测和持续地分析扩增有关的荧光信号,随着反映时间的进行,检测到的荧光信号的变化可以绘制成一条以循环数为横坐标,以PCR反映

9、过程中实时荧光强度为纵坐标所做的曲线;3. 荧光阈值:指在实时荧光定量PCR扩增曲线上人为设定的一种值,它可以设定在指数扩增阶段的任意位置上;4. 循环数:PC扩增过程中扩增产物的荧光信号达到设定的荧光阈值所通过的循环次数;5. 扩增效率:指C反映一种循环后的产物增长量与这个循环的模板量的比值,其值在01之间;6. . 第七章:核酸序列分析1. 双脱氧链终结法测序原理:ddNTP比一般的dTP在3位置缺少一种羟基,可以通过其5三磷酸基因掺入到正在增长的NA链中,但由于缺少3-OH,不能同后续的dNTP形成3,5-磷酸二酯键。因此,正在增长的DNA链不在延伸,使这条链的延伸终结于这个异常的核苷酸

10、处;.人类基因组测序的环节:第八章:蛋白质组学技术1. 蛋白质组:涉及一种细胞或一种组织或一种机体的基因所体现的所有蛋白质;2 蛋白质组学:以蛋白质为研究对象,从整体水平揭示细胞内动态变化的蛋白质构成、构造、体现水平和修饰状态,研究蛋白质间,蛋白质与生物大分子之间的互相作用,揭示蛋白质的功能与生命活动的规律;3 双向凝胶电泳:第历来电泳是根据蛋白质的等电点不同,通过等电聚焦将带不同净电荷的蛋白质在梯度介质中外加电场作用形成分离的蛋白质区带。第历来等电聚焦完毕后,将凝胶包埋在SPAGE凝胶板上端,根据蛋白质分子量的不同,在垂直或水平方向进行SDSPAGE,即第二次分离;4 双向凝胶电泳用于拟定差

11、别,质谱法用于鉴别构造;第十三章:单基因遗传病的分子生物学检查1. 单基因遗传病分类:常染色体遗传,连锁遗传,连锁遗传;2. 在分析基因构造的变化时,一般用DA作为检测材料;在检测转录水平异常时在,将RNA作为检测材料;当基因较大时,突变区不甚明了时,也可直接从cA水平开始进行筛检;3. 镰刀细胞贫血的分子机制:患者由于珠蛋白基因中第位密码子存在单个碱基的突变,由本来的GAG变为G,成果使珠蛋白链的第6位氨基酸残基由本来的谷氨酸变为缬氨酸,红细胞发生镰状;4. 珠蛋白生成障碍性贫血的分子机制:第十五章:线粒体病的分子生物学检查:1 母系遗传:在一种家系中,有缺陷的遗传性状通过母系成员从亲代持续

12、稳定传递到子代的现象,即妈妈可以将有缺陷的遗传性状传递给子代,男性子代个体不再继续传递,而女性子代个体可继续将此有缺陷的遗传性状往下一代传递;2 遗传早发:指越是严重的线粒体功能异常,其个体发病的年龄也将越早;3 遗传瓶颈:线粒体在卵母细胞成熟时数目会浮现锐减的现象;4 线粒体基因体现系统及特点:第十六章:肿瘤的分子生物学检查1. 原癌基因:指人类或其她动物细胞固有的一类基因,能诱导细胞正常转化并使之获得新生物特性的基因总称;2. 原癌基因激活机制:1)插入激活,2)基因重排/染色体易位;3)基因点突变/移码突变;4)基因扩增;)基因转录变化;3. 抑癌基因:是一类可编码对肿瘤形成起阻抑作用蛋白质的基因,正常状况下负责控制细胞的生长和增殖;4. 肿瘤基因体现遗传学异常的分子机制:1)基因组印记丢失;2)DNA甲基化;)组蛋白修饰与染色质重塑;

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