蛋白质组学思考题

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一、简述根据MS/MS进行蛋白质鉴定（注意不是多肽）的过程。答：这种仅通过二级质谱图来鉴定多肽的方法又称为De novo Sequencing。PSM(Peptide-Spectral Match)肽谱匹配二、根据下图说明，在从多肽推断蛋白的时候是如何应用奥卡姆剃刀法则的，如 何评价应用该法则获得的蛋白质鉴定结果？A BA BMoaindistfnguishable proteinsB: subset proteinepeptides口 eptidos3u_aod32peptidesbpeptides12341234_MAB_distinct proteinsdifferent fable proteinspeptidesdpeptides答：如果你有两个理论，它们都能解释观测到的事实，那么你应该使用简单的那个， 直到发现有直接的证据支持更为复杂的那个理论。找到最少的一组蛋白，包含鉴定到 的全部多肽序列。拥有更多高可信度多肽的蛋白的可信度最高；选择至少有两个肽的 蛋白，或者保留单肽鉴定的蛋白，但要求这个肽具有极高的可信度；可用反相数据库 方法估计Protein FDR，也可用其它基于概率的方法，Protein FDR通常大于peptide FDR。