药物设计与CADD中常用的指标和范围
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1、-WORD 格式-可编辑-专业资料-完整版学习资料分享-表 3 药代虚拟筛选的指标和范围 指标 内容 范围 CNS 预测中枢活性,-2(非活性),+2(活性)-2 +2 QPlogHERG 预测阻断 HERG K+通道的 IC50 的对数值 -5 QPPCaco 肠吸收模型,预测在 Caco-2 细胞的穿透能力(nm/sec)500 非常好 QPlogBB 预测脑血分配系数的对数值 3.0 1.2 QPPMDCK 预测对 MDCK 的穿透能力(nm/sec)500 非常好 QPlogKp 预测对皮肤的穿透能力 log Kp 8.0 1.0#metab 可能存在的代谢反应数 1-8 QPlogK
2、hsa 预测与人血浆白蛋白的结合常数的对数-0.5-1.5 Human Oral Absorption 预测人的吸收程度,1、2、3 分别代表低、中、高 Percent Human Oral Absorption 定量预测人吸收的程度 0 100%80%高吸收,25%低吸收 i)药学性质的虚拟筛选 药学性质在早期筛选中最关注的是稳定性、溶解性,透膜性通常归在药代性质中,稳定性的化合物本身分解或参与反应的综合表现,是化学反应活泼程度的反映,溶解性和透膜性是决定制剂的重要性质。药学虚拟筛选主要采用Schrodinger QikProp 3.2和方法和指标,也是比较成熟的计算工具。具体指标和范围如下
3、表4:表 4 药学性质虚拟筛选的指标和范围 指标 内容 反映性质 范围 QPlogPC16 预测化合物在正十六烷和气相中的分配系数 脂溶性和挥发性 4.0-18.0 QPlogPoct 预测化合物在辛醇和气相中的分配系数 脂溶性和挥发性 8.0-35.0 QPlogPw 预测化合物在水和气相中的分配系数 水溶性和挥发性 4.0-45.0 QPlogPo/w 预测化合物在辛醇和水中的分配系数 油水分配系数-2.0-6.5 QPlogS 预测饱和水溶液中化合物的溶解度(mol/L)对数 溶解度-6.5-0.5-WORD 格式-可编辑-专业资料-完整版学习资料分享-CIQPlogS 预测饱和水溶液中
4、化合物的溶解度(mol/L)对数(构象不依赖的算法)溶解度-6.5-0.5#rtvFG 具有反应性的功能团数量 稳定性 0-2 IP(ev)PM3 计算的离子化势 稳定性 7.9-10.5 EA(eV)PM3 计算的电子亲和势 稳定性-0.9-1.7 ii)虚拟筛选的综合初筛指标 为了减少无效的筛选,人们一直在总结简单的方法对分子进行早期初筛,著名的“Lipinski 五规则”就是一个综合初筛指标:mol_MW 500,QPlogPo/w -5.7,QP PCaco 22 nm/s,#Primary Metabolites 7,超过这个规则口服可能性极低。表 5 Schrodinger QikProp 3.2还总结了范围更精确的指标:指标 内容 范围 mol_MW 分子量 130.0-725.0 dipole 分子偶极 1.0-12.5 SASA 溶剂可及面积 300.0-1000.0 FOSA 疏水性溶剂可及面积 0.0-750.0 FISA 亲水性溶剂可及面积 7.0-330.0 donorHB 氢键供体数 0.0-6.0 accptHB 氢键受体数 2.0-20.0 QPlogPo/w 油水分配系数-2.0-6.5
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