甘油菌活化和质粒提取

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1、一、甘油菌活化1. LB 培养基制备:胰蛋白胨 10g酵母提取物 5gNaCl10g加去离子水至800mL搅拌,使溶质完全溶解,用5mol/LNaOH (约0.2ml) 调节PH至7.4,加入去离子水至1000ml,高压蒸汽灭菌20min。灭菌后注意密封,4C能存放1个月。含琼脂的LB培养基:上述液体培养基高压灭菌前加入15g/L (铺制平板用)或7g/L (配制顶层琼 脂糖用)琼脂糖,高压灭菌 20min。2. 倒平板2.1 超净台,接种环,灭菌培养皿,酒精灯等紫外灭菌 30min。2.2培养基高压后放在60C水浴锅中保温。溶液尚未冷却时,即应取出培养 基,并轻轻转动以使溶解的琼脂或琼脂糖能

2、均匀分布于整个培养基溶液中。小心 培养基过热,旋动液体产生暴沸。2.3冷却至50C,在超净台中加入抗生素等不耐热的物质(现用现加),为 避免产生气泡,混匀培养基时应采用旋动的方式,然后直接从烧瓶中倾出培养基 铺制平板。2.4 从冰箱中取出甘油菌冻存管放在冰上,不要等到融化(反复冻溶不利于 长期保存),直接用(枪头)接种环在冻存管内的冰碴上蘸一下,然后马上涂平 板即可。37 C培养12-16h。第二天挑单克隆大量培养。3. 大量培养3.1冷藏的液态培养基重新高温高压湿热灭菌,待冷却至50C左右加入抗生 素。3.2在无菌操作台中将菌落挑至已加抗生素的液态培养基中(2-5mL),37C, 200rp

3、m 培养 8h。3.3按1:500至1:1000的比例,用加抗生素的液态LB培养基稀释3.2所得 菌液。(25-50uL菌液+25mL液态含抗生素LB培养基)。37C, 200rpm培养12-16 小时。使密度达到3-4 10人9/mL。 OD600在0.5左右。(在可见分光光度计600nm处测菌液的光密度值,OD600 在 0.5 左右时可判断细胞处于对数生长期,活力最佳。)二、质粒提取1. 准备工作1.1 RNaseA 用前瞬离。一小瓶 RNaseA 加到 1 瓶 buffer P1 中,使终浓度为 100ug/mL。 Optional:按 1:1000 的比例,在 bufferPl 中加

4、入 LyseBlue。1.2检查buffer P2是否有沉淀(SDS,低温环境),如果有沉淀,将P2放置 37C条件下,以使沉淀溶解。1.3 4C预冷 bufferP3。2. 质粒提取2.1上述菌液,6000 g, 4C离心15min,收集沉淀。若不马上进行实验,沉淀可-20 C保存2.2用QIAGEN质粒提取试剂盒中的4mL buffer P1重悬。 为使裂解充分,容器要足够大,使充分混匀 确保 buffer P1 中已加入 RNaseA 如果 bufferP1 中 加了 LyseBlue, 重悬菌液之前, 应将混合液 (bufferP1+LyseBlue)用力混匀 涡旋或上下颠倒混匀,使重

5、悬菌液无团块2.3加入4mL buffer P2,颠倒混匀4-6次,室温(15-25C)静置反应5min。千万不可用振荡器混匀,会使DNA链断裂 静置时间不要超过 5min Buffer P2用后立即密封,以防空气中的CO2使其酸化 此时裂解菌液应是粘稠的如果buffer P1中加入了 LyseBlue,那么加入buffer P2并混匀后,应出现 均匀的蓝色,如果出现局部无色或棕色团块,应继续颠倒混匀2.4加入4mL预冷bufferP3,立即用力颠倒混匀4-6次,冰上静置15min。 注意低温操作(预冷,冰上静置),目的是促沉淀加入bufferP3后,出现白色蓬松状沉淀,沉淀为基因组DNA,蛋

6、白质, 细胞碎片,KDS。此时,裂解液粘稠度应降低如果buffer P1中加入了 LyseBlue,沉淀过滤后,溶液应该是无色的,表明 SDS 已经充分沉淀2.5离心前混匀,三20000xg, 4C离心30min。快速吸取上清(含质粒)。2.6上清20000xg, 4C离心15min。吸取上清。 Optional:取240uL上清,做凝胶电泳分析,以判断培养和分离是否合理2.7 平衡 QIAGENtip-100,向 QIAGENtip-100 中加入 4mL bufferQBT,重力 作用自然流下。2.8将2.6中的上清加入2.7平衡过的QIAGENtip-100中。提前平衡QIAGENtip

7、-100,使得上清尽快加入,如果间隔时间太久,(蛋 白沉淀变混浊)应再次离心以免堵塞 QIAGENtip-100 Optional:取 240uL流出的液体,做凝胶电泳分析,质粒DNA与QIAGEN 树脂的结合效率2.9 用 bufferQC 洗 QIAGENtip-100,一次 10mL,洗 2 次。 第一遍去除质粒提取试剂中的大部分杂质,如果菌液体积大或菌体产生 大量碳水化合物时第二遍清洗则必要的 Optional:2.10用5mLbufferQF洗脱DNA,用 15mL管收集洗脱液。 不可用聚碳酸酯离心管(不耐乙醇)如果重组质粒大于45-50kb,65C预热bufferQF可洗脱效率 Optional:洗脱下来的DNA可4C暂存,但不建议过夜2.11加3.5mL (0.7倍洗脱液体积)室温异丙醇沉淀质粒DNA,混匀,三 15000xg,4C离心30min,或者5000xg,4C离心60min。小心弃去液体。 室温异丙醇:减少盐沉淀 4C离心:防止样品过热2.12 用 2mL 室温 70%乙醇洗涤,15000xg, 4C离心 10min,或者 5000xg, 4C离心60min,小心弃去液体,室温晾干,用合适的缓冲液溶解(如TE buffer pH8.0,或 10mM TrisCl, pH8.5)。

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