Western blot实验流程

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1、Western blot一.仪器及器皿:棕色广口瓶5个(50ml),灭菌,烧杯3个灭菌,EP管,枪及枪头,分光光度计,超声破碎机,冷冻离心机,灭菌0。9%生理盐水,冰,灭菌水(1000ml),两套灭菌器械.二。药品配制:1。TBS10(Tris Buffered Saline):2。42 g Tris base 8g NaCl100ml H2O, 用HCl调pH 7.6 ,4C保存。(配TBST用)TBST=TBS+0。05Tween2TBS :0.303 g Tris base 0。4383g NaCl (150mM) 0。05gSDS用HCl调pH至8。0(配裂解液用),50ml约用2.1

2、mlHCl.30.5M TrisHCl(pH6。8),50ml,:3gTrisbase加灭菌水约30ml,用6N盐酸缓缓调pH至6.8(约用1ml),定容至50ml,4保存。(若调小了,用5.6%NaHCO3调回) 。1.5M TrisHCl(pH8。8),50ml,9。08gTrisbase加灭菌水约40ml,用6N盐酸缓缓调pH至8.8(约用2ml),定容至50ml,4保存。45Running buffer pH8。3,500ml:Tris-base 7。5g, Glycine(甘氨酸) 36g,SDS 2.5g加灭菌水至500ml, 4保存,用时若有沉淀析出可提前拿出置37,不用调pH值

3、,用时按1:5稀释,即60ml的5Running buffer加入240ml水。530%acrylamide(丙稀酰胺贮液):8.76g acrylamide, 0。24g N, N-methylenebisacrylamide(亚甲基双丙烯酰胺),加少许 灭菌H2O搅匀,最后定容至30 ml 。用0.45 m的过滤器过滤后4C避光保存610SDS:5gSDS+50 ml H2O,(难溶,需较长时间),常温保存。7.10APS (ammonium persulfate,过硫酸铵(粉剂也保存在4C):100mg APS +1ml H2O,EP管中即可,4C保存1周,-20C保存1个月,时间长了胶

4、难凝.8。 0.1% bromophenol blue dye溴酚蓝10ml溴酚蓝10mg加ddH2O至10ml,搅匀溶解,过滤除去未溶颗粒。9。 2Sample buffer(1:1)避光保存 10%SDS (1g/10ml) 400l 0.5M Tris(pH6.8) (0。6055g/10ml) 250l 100% Glycerol(甘油,丙三醇) 200l 2-mercaptoethanol(巯基乙醇) 100l 0.1 bromophenol blue (10mg/10ml) 80l总计1030l 避光4C保存。4Sample buffer(1:1)避光保存:10. 胶Stain S

5、olution(蛋白染液):100mgCoomassie Brilliant Blue G 250(考马斯亮蓝)溶于50ml95%的乙醇,加入100ml 85的H3PO4,及50mlddH2O, 4C保存于棕色瓶中。Coomassie Brilliant Blue R 250(考马斯亮蓝-R250): R250 0.5g 甲醇 225ml 定容至500ml 冰醋酸 50ml11. 胶Destain Solution(脱色液)for Coomassie Brilliant Blue:acetic acid(冰乙酸) 100mlmethanol(甲醇) 100ml加水至1000ml 。若转完膜后染

6、色则不用10及11,改用12和13。12。NC膜染色液:0。1氨基黑染液:氨基黑 0。2gmethanol(甲醇) 90ml冰醋酸 20ml加水至200ml。13NC膜脱色液:methanol(甲醇) 180ml冰醋酸 4ml加水至200ml。14配转膜液(transfer buffer): Tris 6。06g Glycine 28.8g Methanol (甲醇) 400ml DDH2O to 2000ml,混匀后不用调pH值, 4保存。(提前将前两种配成800ml,为2transfer buffer转膜时取400ml加入400mlH2O,另加200 ml Methanol (甲醇)即可)

7、。注:所用水最好为灭菌的去离子水便于长期保存。15。Tris-Gly 电泳缓冲液(5X)Tris 15.1gGly 72。0gSDS 5。0g去离子水定容至1L,室温保存三 实验步骤。(一)提取蛋白并测蛋白浓度:1开离心机,4 C ;2。 配裂解液: 1mlTBS(pH至8。0)加入10lNP40,1lPepstatin(1g/ml), 胃蛋白酶抑制剂A,溶于DMSO(二甲基亚枫),-20C保存1lLeupeptin(1g/ml), 亮抑蛋白酶肽,溶于ddH2O,-20C保存1lAprotinin(1g/ml),抑蛋白酶肽,溶于ddH2O,20C保存。5lPMSF(100g/ml),pheny

8、l methylsulfonyl fluoride ,苯甲基磺酰氟,溶于异丙醇(isopropanol),20C保存。3拿冰置于冰盒内,裂解液配好后即放于冰水上;4用1戊巴比妥钠麻醉后取材,最好小于100mg,用冷TBS或冷生理盐水冲洗后(做蛋白最好灌流,做RNA要用70%酒喷毛,若不即用可在液氮中冷冻30min后,-70C保存),加入裂解液(100mg/ml),放于冰上,剪碎组织;剩余裂解液仍放于冰上,以备稀释样品用;5超声破碎,小烧杯内有冰,EP管置于冰水上,稳定并降温,410s,560W,间隔10S,超至无块状即可;6离心4 C,12000g,20min离心机转动时打至time档性能稳定

9、7。蛋白定量:配标准蛋白,成倍数(根据药盒说明,有线性关系的浓度分别为0,0.15,0。3,0。6,0.9g/l ,因此0。3g/l 的标准蛋白各取0.5,1,2,3l,并加入1ml染液;震荡混匀,测标品吸光值595nm,再由低浓度向高浓度测。做标准曲线,准备蛋白定量使用。9取超声破碎好的上清放于新EP管中,放于冰水上,取1l加19l ddH2O稀释20倍,从中再取1l加入1ml染液,室温后5min,测吸光值,应在混匀后30min之内测完。10对标品用Excel做图,输入吸光值及对应浓度(包括空白),做散点图,完成图后添加趋势线,截距为0,公式及R2(相关系数)均选,得到相应公式(Y= BX)

10、,再计算浓度即可,结果应20(稀释倍数)。加样时每个孔应有50g,用50/浓度即为加样量l。样品即用可放于冰上,否则分装后放于-80。补:7-10步测定蛋白浓度,也可以用买的蛋白定量试剂盒补2:若样品为细胞样品时:(在冰上进行)(不用蛋白定量的操作)1、 六孔板长满后,用PBS洗3遍,用裂解液和2X buffer1:1混匀的液体加入每孔100ul左右裂解。然后用刮刀刮下来,没刮一个孔要在三次水中洗一下刮刀。2、 煮30min,95.-20保存。用的时候拿出来化,离心取上清。(需要蛋白定量的操作)1、 裂解用液为: 裂解液:抑制剂 = 1:1。收完蛋白后先离心,1000r/min,离心8min。

11、吸出上清,弃掉沉淀.2、 96孔板,水 + 标准品(BSA,2mg/ml)总共20ul 蛋白(4ul) + 水(16ul) 20ul 0 19ul 1 18ul 2 16 4 14 6 12 8 10 10所有孔(即每孔)加100ul显色剂(BCATM:BCA) = 1:50混合),注意避光3、37孵育40min4、王黎明的程序里有BCA的程序测定(最后的配平用液也是裂解液:抑制剂=1:1)5、定量的同时,同体积的蛋白和2Xbuffer一起煮30min,95。20保存。蛋白分子量范围分离胶凝胶浓度(%)5000002-5(二)电泳(SDSpolyacrylamide gel electroph

12、oresis)1 检查电泳所需的各种试剂和器械,并从4拿出药品;2 清洗电泳所用的玻璃板(平时浸泡于洗洁精液中),擦酒精(70%),晾干或60-70烤干;3 装置电泳玻璃板(长板在内短板在外)并固定(卡住);4 配胶:之前先用水检查是否漏胶,两片玻璃要对齐,以免漏胶。 1.5mm玻璃板用7ml,1mm的玻璃板用5ml分离胶浓缩胶68%7.5%101245% (2ml)5%(5ml)ddH2O2.62。32。42ml1.576ml1.68ml1。2ml1。4ml3。5ml30%Acrylamide(4避光)11。31。25ml1.36ml2ml0.27ml0。33ml0。825ml1.5M Tr

13、isHCl(pH8。8)1。31。31.25ml1。00ml1。25ml-0.5 M TrisHCl(pH6。8)-0。5ml0.25ml0.625ml10%SDS505050l40l50l20l20ul50ul10%APS(后加)505050l40l25l20l 20ul50ulTEMED(后加)432.5l2.0l2。5l2l2ul5ulToTal5ml5ml5ml4ml2mlAPS(先加) 和TEMED要最后用时再加,混匀,每边用枪从板左上角加入4ml,枪头内胶不要全推出,即再吸再加入,防止出气泡,加胶比5cm的刻度线稍高,用去离子水或乙醇滑行方式加满覆盖压住胶(因为只在一角加入会使胶面

14、不平),使凝固(水封下出现折光面),约0.5-1h,除去水层,用水冲洗2次,并用滤纸吸干残留的水分;等约30min。加入浓缩胶,每边加满,立即插上梳子(平整面朝内,先一端插入,缓慢斜放至另一端插入)注意不要有气泡,可用70%酒精排出;等30min左右。加完浓缩胶立刻开始准备样品,并打开水浴锅,100;胶凝后(可见齿边缘与胶有空隙)垂直拔出梳子,两边同时用力;先用去离子水冲洗加样孔,再用Running buffer冲洗;5准备样品,每孔使用总蛋白量50微克,计算使用的样本量,根据loading buffer的浓度,加样量为10l,即样本量(50/浓度)用裂解液补充总体积至5l再加入5l Samp

15、le buffer (2),另有marker 和一个Sample buffer(1),上样时加在一侧(防止跑歪),也可不用.(先加水,再加5l Sample buffer,最后加蛋白),加完后离心再100水浴5min后放于冰上,准备上样. 两边两道buffer,左边一道marker。6放好电泳槽,将制好的胶板反过来(短面在内,如果跑单面胶,则放置好胶板后,另一面放塑料板,字面向内,夹紧),外加旧缓冲液Running buffer,两板之间加入稀释5倍的新缓冲液Running buffer(约用150ml,即35ml5+140ml水)。上样.浓缩胶时80V,30min,分离胶时120V,45mi

16、n(等条带齐了就可以换电压了)。(若在冰盒中电泳,时间可稍延长,但是浓缩胶一定要跑完才可以变电压再跑分离胶)。(三)电泳转膜(冰上进行)1溴酚兰快达底部即可停止电泳;2(切下Marker及样品1、 2、3的胶,用Coomassie Brilliant Blut G(考马斯亮蓝)染色约30min(摇床)后用Destain脱色液脱色2h,并于凝胶成像中观察)此步可省,可在转完膜后,将膜剪下再用氨基黑染色(或者丽春红染色);3。配转膜液1000ml:取400ml 2transfer buffer加入400mlH2O,另加200 ml Methanol (甲醇)即可;再加入1ml10SDS利于转膜;或

17、者10X转膜液:甲醇:双蒸水=1:2:7.4。 PVDF 膜预处理:用甲醇浸泡1minddH2O 3个5min转膜液浸泡15minNC膜(nitrocellulose membrane,硝酸纤维素膜)(8。55.5cm)直接用转膜液浸泡10min切4张8.85.8cm滤纸(Whatman 3mm层析纸),与海绵垫均用转膜液浸泡10min;切除浓缩胶(记清方向及要剪下染全蛋白的膜长度,并用铅笔标记于NC膜上),将胶于转膜液中浸泡10min;5 摆放顺序夹子黑色面+海绵(聚乙烯板)+2滤纸+凝胶(剪左角)+NC膜(不分正反面)+2滤纸+海绵+夹子白色面(三明治),注意每放一层用玻璃棒赶一次气泡,并

18、要始终保持湿润,否则胶易碎;将三明治固定在转膜槽内,且夹子黑色面对转膜槽黑色面;一定要赶净气泡,否则会产生高背景或影响蛋白转移。6 PVDF膜要在甲醇中浸没1-2min,然后在缓冲液中浸没5min再用。膜总是对着红色的那端。6。转膜250mA,1.5h;电泳仪调至恒流(mA);注意:三明治放于电泳盒内,并于盒底部放一磁力转子,三明治和盒壁间放置一冰盒进行转膜;放于有冰块的小盆内,放于磁力搅拌器上,中速; 7。拿出PVDF膜,并剪去一角做标记;(可以在转膜前就剪角)8。将Marker及样品剪下用氨基黑(丽春红)染色10min,再用脱色液脱色至背景干净为止(摇床,加盖),放于凝胶成像中用可见光观察

19、。(四)与抗体结合:1将250mlTBS (25mlTBS10+225ml灭菌的去离子水)+125l Tween20配置成含0.05%T的TBST,洗膜,5min/次,3次;注:洗时转速较快,但奶粉封闭及一抗、二抗要用最慢或稍快的速度,否则结合不上;2。TBST配置5%的脱脂奶粉封闭液10ml,室温摇床封闭11.5h;封闭后用TBST洗15min+5min+5min3。加入一抗,先摇床轻摇动20min,然后放置4过夜。4。 TBST洗膜15min+5min+5min;5.加入1:5000二抗,室温摇动孵育1h;6. TBST洗膜15min+5min+5min+5min;7化学发光.8。 将PVDF膜保存在4,备用。9用较多的TBST再次洗膜,10min+10min;10.5%脱脂奶粉室温封闭1h.可再进行免组。

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