PCR的相对定量的数据处理
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1、相对定量的数据处理 管家基因校准(Normaliza tion Gene)-得出每个细胞中的目的基因-目标基因vs.管家基因对照样品校准(Calibra tor Sample)-得出相对于某个样品的基因表达量,IX sample.-处理的vs.未处理的,6hr vs. 0 hr,病理vs.正常.目标基因r !Lz2Sample 如 外理后管家基因 18SCalibrator处理前相对标准曲线法计算示例IL-2 pg 总RNA18SPg 总 RNANormalizedIL-2表达CalibratedIL-2表达OHr103252?1522 0x10-2I2 Hr232045,1235.1x102
2、2.5524 Hr40480J760.25L降低4倍)相对定量: CT法依据:平均相对含量 = 2 -平均 CT好处:不做标准曲线 C = C Unknown C Calibrator二TTT%与AA Ct的关系T平均相对含量二2 -平均 c%与AACT的关系Rn = RB+N0(l+E)-Rs当 E=1OO%=1 时:CT= Rb + N X 2Cl RgN0x2CT = (RCT-RB)/Rs = b No = b/26=bx2-5N01/N02 = 2-c-c =2-ACt平均相对含量T c法计算示例TIL-2平均CtIBS平均臼NormalizedIL-2表达込Ct)CalibratedIL-2 表达(AACt)变化倍数2皿s0 Hr24.512.6119012 Hr23.212.510 7-1.22.324 IHr25 411.613.31.90.27r降低4倍)注意:如果反应效率不高,则差别被高估。-当CT= -1.2vmn 2.3 施m淳VEHO卩 2.2 施m淳VEH05 1.6施肚淳相刈信号强度
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