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1、分子标记辅助选择复习资料（GAU）第一章1. DNA变性：在高温或某些化学试剂作用下双链DNA分子的两条互补的单链会 相互分开的过程。2. DNA复性：当变性的外界条件消除后，互补的单链DNA又可恢复双螺旋结构 的过程。3. 基因组：是指一种生物或个体细胞所具有的一套完整的基因及其调控序列。4显,性标记：是指F1的多态性片段与其亲本之一完全相同。如RAPD, AFLP等。 5.共显性标记：是指双亲的两个以上分子量不同的多态性片段均在 F1 中表现， 如 RFLP, SSR,SCAR, ISSR, CAPs。6琼脂糖凝胶电泳：分离，纯化和鉴定长度为0.250Kb的DNA片段。应用于 RAPD,R
2、FLP,ISSR,SCAR 等。7聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）：分离，纯化和鉴定长度为5500bp的DNA 长度。非变性PAGE应用于SSR等 变性PAGE应用于AFLP等8纯化后DNA浓度的确定：0D260 / 0D280=1.80D260 / 0D280V1.80D260 / 0D2801.8OD260 / OD280=2.0OD260/ OD280RILBC1DH。 二图谱的完善1. 遗传图谱饱和度：单位长度染色体上已定位的标记数或标记在染色体上的密度。 连锁框架图：标记平均间隔W20cM主基因定位：标记平均间隔 10-20cMQTL定位：标记平均间隔vlOcM基因克隆：标记平均间隔v
3、lcM三比较基因作图1. 概念：利用一种物种的分子标记对另一物种进行遗传或物理作图。2. 同线性：定位在一个物种的染色体上的两个或多个标记又被定位于另一物种的 同源染色体区域上，但这些标记间的相对顺序可变化。3. 共线性：定位在一个物种的染色体上的两个或多个标记又被定位于另一物种的 同源染色体区域上，但这些标记间的相对顺序是保守的。四基因定位1基因定位（Mapping of genes）：是指通过遗传作图的方法，确定基因于遗传标 记之间的关系。2. NIL （近等基因分析法）分析法1）概念：一组遗传背景相同或相近，只在个别染色体区段上存在差异的株系称 为近等基因系（N ILs）。2）原理：利用
4、NIL寻找质量性状分子标记的基本策略是比较NIL及其轮回亲本 之间的标记基因型，当 NIL 与供体亲本具有不同的标记基因型时，则该标记就 有可能与目的基因连锁。3. BSA （群体分离分析法）分析1）概念：是从近等基因系分析法演化而来的，它克服了许多作物没有或难以创建相应的NIL的限制，在自交和异交物种中均有广泛的应用前景。2）原理：在作图群体中，依据目标性状表型的相对差异（如抗病与感病，可育 与不育等），将个体或株系分成两组，分别将两组中的个体或株系的 DNA 等量 混合，形成相对的DNA池（Pool）。第五章1分子标记辅助选择：借助分子标记对目标性状的基因型进行选择，从而达到提 高育种效率
5、的目的，称为分子标记辅助选择（Marker-assisted selection,MAS）2标记辅助选择1）前景选择：标记辅助选择的主要方面是对目标基因的选择，有人称之为前景 选择。2）背景选择：对基因组中其他部分（即遗传背景）的选择称为背景选择。3）基因聚合（gene pyremiding）：将分散在不同品种中的有用基因聚合到同一个 基因组中。4）基因转移（gene transfer）或基因渗入（gene transgression）:是指将供体亲本（一 般为地方品种，特异种质或育种中间材料等）中的有用基因（即目标基因）转移 或渗入到受体亲本（一般为优良品种或杂交品种亲本）的遗传背景中，从而
6、达到 改良受体亲本个别性状的目的。5）连锁累赘：在回过程中，目的基因与其附近的非目的基因存在连锁，一起导入受体，导致改良的品种与预期的目标不一致，这种现象称连锁累赘。 3.分子标记辅助选择的优越性1）克服性状表现型鉴定的困难2）允许早期选择3）控制单一性状的多个（等位）基因的利用4）允许同时选择多个性状5）可进行性状非破坏性评价和选择6）从育种进程考虑，可加快育种进程，提高育种杂交率4. 分子标记技术在作物育种中的应用1）用于作物遗传多样性分析2）遗传多样性研究3）品种鉴定4）杂交种子纯度鉴定5）转基因作物后代的选择6）目标质量性状的选择7）目标数量性状的选择8）回交结合分子标记辅助聚合育种技
7、术9）分子标记辅助选择与常规育种结合 补充：1.分子杂交：单链的 DNA 与 RNA，RNA 与 RNA 或 DNA 与 RNA 之间通过碱基 互补配对原则形成 DNA-DNA，RNA-RNA 或 DNA-RNA 的双螺旋结构的不同类 型的杂交分子。2. 同义 cSNP：SNP 所致的编码序列的改变并不影响其所翻译的蛋白质的氨基酸 序列，突变碱基与未突变碱基的含义相同。3. 非同义cSNP:碱基序列的改变可使其翻译的蛋白质序列发生改变，从而影响 了蛋白质的功能。4. 不同分子标记方法比较RFLPRAPDSSRISSRAFLP遗传方式共显性多数显性共显性共显性多数显性多态性中高高高非常高重复性高中等高高高DNA 样品量2-30ug1-100ug50-100ug2-50ng100ng可靠性高中等高高高引物单，10bp双，20bp单，20bp双，20bp左右
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