功能区隔与蛋白分选

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1、INTRACELLULAR COMPARTMENT AND PROTEINS SORTING,第六章细胞内功能区隔与蛋白质分选,第一节 细胞质基质 第二节 蛋白质分选的基本原理 第三节 膜泡运输 第四节 内质网 第五节 高尔基体 第六节 溶酶体与过氧化物酶体,本章内容提要,第一节 细胞质基质,一、 细胞质基质的基本涵义,二、 细胞质基质的功能,三、细胞质基质与胞质溶胶,第一节 细胞质基质,一、细胞质基质的基本涵义 在细胞质中，除去可辨认细胞器以外的胶状物质。,A 与中间代谢有关的数千种酶类,例如：糖酵解、磷酸戊糖途径、糖醛酸途径； 糖原的合成、蛋白质与脂肪合成的重要场所,B 细胞周期、增殖、分

2、化、衰老、凋亡的调控因子。,主要成分： 蛋白质占总量的2030%，以水化物的形式存在,C 骨架系统（微丝 、微管、中间纤维）:是细胞质基质的组织者,D mRNA,一、细胞质基质的基本涵义,细胞质基质的组织结构 1、细胞质基质是一个高度有序的凝胶结构体系，形成精细的区域。 细胞骨架纤维形成复杂的三维纤维网络。多数蛋白直接或间接地与骨架结合或与生物膜结合 2、在细胞质基质结构体系中，蛋白质与蛋白质、蛋白质与其他大分子之间都是通过弱键相互作用的。 3、各组分之间的作用常常处于动态平衡之中。 细胞质基质所依赖的特殊环境 高蛋白浓度； 特定的离子环境,中间代谢的过程及其调节（底物与产物的定向转运机制？）

3、 控制细胞增殖、分化、衰老、凋亡所依赖的信号转导途径。 蛋白的分选及定向运输 由于细胞骨架的组织，使细胞中的成分，在结构功能上形成更为精细的区域。实现了细胞质中各功能的区域化。,二、细胞质基质的功能,各膜质细胞器 细胞核 细胞质基质,蛋白质的修饰 1、辅基或辅酶与酶的共价结合 2、磷酸化与去磷酸化，用以调节很多蛋白质的生物活性。 3、糖基化。多数为O-连接的糖基化。 在哺乳动物细胞中把N-乙酰葡萄糖胺分子加到蛋白质的丝氨酸的羟基上 。 4、蛋白质N端的甲基化修饰，使蛋白质维持较长的寿命。 例如：组蛋白 中间纤维 5、酰基化。 蛋白质与脂肪酸形成脂蛋白。 跨膜蛋白在内质网、高尔基体的转运过程中，

4、暴露在细胞质基质中的结构域被酰基化。 酶与癌基因的产物特异性的识别，将脂肪酸链共价结合在特异的蛋白质上。例如：Src、Ras中的脂肪酸链。,降解变性与错误折叠的蛋白和短寿命蛋白质,泛素：是一个由76个氨基酸残基构成的小分子蛋白质。 泛素的功能： 帮助清理细胞中短寿命蛋白和错误折叠的蛋白质； 参与细胞周期调控； DNA修复；细胞的程序性死亡。 容易降解蛋白质的特征： 决定蛋白质寿命的信号是N端第一个氨基酸残基。 Met Thr Ser Val Gly Pro Ala Cys，则稳定； 之外，则不稳定 降解机制是依赖泛素降解途径：泛素在一系列酶的作用下与靶蛋白结合，使靶蛋白被泛素标记，从而被蛋白酶

5、体水解。,帮助变形或错误折叠的蛋白重新折叠，形成正确的分子构象 利用热休克蛋白（heat shock protein ）Hsp,在消耗ATP的情况下把变性蛋白重新折叠成正确的构象。 热休克蛋白有三个家族：25KD、75KD、90KD,错变形或错误折叠的蛋白,正确的分子构象,Hsp,ATP,ADP,三、细胞质基质与胞质溶胶,细胞质基质 是由微管、微丝和中间纤维等形成的相互联系的结构体系。其中蛋白质和其他大分子以凝聚状态或暂时以凝聚状态存在与周围的溶液分子处于动态平衡。 是一种由精细区域化的凝胶结构体系，细胞在不同的发育间段和不同的生理状态下，可能有所不同 。 作为一个蛋白质是否属于细胞质基质中的

6、结构成分，主要取决于其在生命活动中是结合在细胞骨架上，还是溶解在周围的溶液中。,胞质溶胶 早期的实验细胞学家和生化学家用差速离心的方法分离细胞匀浆的各组分，获得的上清液称之为胞质溶胶。 乳胶小球实验：将乳胶小球用微注射的方法注入非洲爪蟾的卵母细胞中，经一段时间后，取出乳胶小球，分析渗入小球中的蛋白质。结合在细胞质基质中的蛋白质不容易渗入乳胶小球。 胞质溶胶与细胞质基质的关系 包涵关系,定义：结构、功能和发生上相关的内膜形成的细胞结构称为细胞内膜系统。 功能：区隔化；增加表面积。 系统发生上内膜起源于质膜的内陷和内共生。 个体发生上内膜来源于原有内膜系统的分裂，具有epigenetic的特性。,

7、细胞内膜系统,第二节 蛋白质分选的基本原理,细胞内合成的蛋白质、脂类等物质之所以能够定向的转运到特定的细胞器取决于两个方面： 其一是蛋白质中包含特殊的信号序列（signal sequence）。 其二是细胞器上具特定的信号识别装置（分选受体，sorting receptor）。,一、蛋白质分选信号,信号序列（signal sequence）：引导蛋白质定向转移的线性序列，通常15-60个氨基酸残基，对所引导的蛋白质没有特异性要求。 信号斑（signal patch）：存在于完成折叠的蛋白质中，构成信号斑的信号序列之间可以不相邻，折叠在一起构成蛋白质分选的信号。,signal sequence

8、and signal patch,二、蛋白质分选运输机制,1、门控运输（gated transport）：如通过核孔复合体的运输。 2、跨膜运输（transmembrane transport）：蛋白质通过跨膜通道进入目的细胞器。 3、膜泡运输（vesicular transport）：蛋白质在内质网或高尔基体中被包装成衣被小泡，选择性地运输到靶细胞器。,第三节 胞内膜泡运输,内膜系统之间的物质传递常通过膜泡运输进行。 多数运输小泡在膜的特定区域以出芽的方式产生。表面具有一个笼子状的由蛋白质构成的衣被（coat）。衣被在运输小泡与靶细胞器的膜融合之前解体。,衣被小泡在细胞内沿微管或微丝运输。

9、与膜泡运输有关的马达蛋白有3类，在这些马达蛋白的牵引下，可将膜泡运到特定的区域。 动力蛋白（dynein），趋向微管负端； 驱动蛋白（kinesin），趋向微管正端； 肌球蛋白（myosin），趋向微丝的正极。,一、衣被类型,已知三类： 笼形蛋白（clathrin） COPI COPII 主要作用： 选择性的将特定蛋白聚集在一起，形成运输小泡； 如同模具一样决定运输小泡的外部特征。,三种衣被小泡的功能,（一）笼形蛋白衣被小泡,运输途径：质膜内体；高尔基体内体；高尔基体溶酶体、植物液泡。 衣被结构：3重链、3轻链，形如triskelion。clathrin的曲臂交织在一起，形成5边形网孔的笼子。

10、 衔接蛋白：连接衣被与受体。,Clathrin coated vesicles,Deep-etch view of a typical clathrin lattice,Selective transport by clathrin coated vesicles,当衣被小泡形成时，可溶性蛋白dynamin聚集成一圈围绕在芽的柄部，使柄部的膜尽可能地拉近（小于1.5nm），导致膜融合，pinch off衣被小泡。,（二）COP I衣被小泡,功能：回收、转运内质网逃逸蛋白（escaped proteins）返回内质网；也可介导高尔基体不同区域间的蛋白质运输。 组成：由7种蛋白组成。 回收信号：L

11、ys-Asp-Glu-Leu（KDEL）。,COP I Vesicles,Cop I and II Vesicles,Lys-Asp-Glu-Leu（KDEL）,（三）COP衣被小泡,介导内质网到高尔基体的物质运输。形成于内质网出口位点，该处无核糖体。 主要亚基：Sar1GTP、Sec23/Sec24、Sec13/Sec31。 多数跨膜蛋白直接与COP II结合，少数跨膜蛋白和多数可溶性蛋白通过受体与COP II结合。 分选信号：位于跨膜蛋白胞质面，形式多样，常包含双酸性基序DEXDE ，如Asp-X-Glu。,COP II Vesicles,COPII Coated vesicle,二、衣被

12、形成,衣被召集GTP酶：为G蛋白，活化状态可引起衣被蛋白聚集，包括ARF和SAR 1。存在于细胞质，激活后转位到膜上。 ARF：参与clathrin和COP I衣被的形成。 SAR 1：参与COP II衣被的形成。,ER上形成COPII小泡时，SAR1交换GDP/GTP而激活。 激活的SAR1暴露出脂肪酸链尾巴，插入ER膜，促进衣被蛋白的核化和组装。 SAR1可激活磷脂酶D，将一些磷脂水解，使衣被蛋白牢固地结合在膜上。 当小泡从膜上释放后，衣被很快就解体。,Coat assembly,三、膜泡运输的定向机制,（一）SNAREs 功能：介导运输小泡与靶膜的融合。 类型：v-SNAREs和t-SN

13、AREs。 结构：具有一个螺旋结构域，相互缠绕形成跨SNAREs复合体，将小泡与靶膜拉在一起。,SNAREs,SNAREs in vesicle transport,神经细胞中，SNAREs负责突触小泡的停泊和融合。破伤风毒素和肉毒素能选择性地降解SNAREs，阻断神经传导。 病毒融合蛋白的工作原理与SNAREs相似，介导病毒与宿主质膜的融合。,HIV fusion protein,（二）Rabs,也叫targeting GTPase，属于G蛋白，起分子开关作用。已知30余种，不同膜上具有不同的Rabs。 Rabs促进和调节运输小泡的停泊和融合。 Rabs还有许多效应因子，帮助运输小泡聚集和靠

14、近靶膜，触发SNAREs抑制因子。,Rabs in docking,四、受体介导的内吞,批量内吞（Bulk-phase endocytosis）：非特异性的摄入细胞外物质，穴样内陷（caveolae）是发生批量内吞的部位。 受体介导的内吞 (receptor mediated endocytosis)是一种选择浓缩机制。LDL、运铁蛋白、生长因子、胰岛素等都通过RME转运。,衣被小窝（coated pits）是质膜内凹的部位，相当于分子过滤器(约占肝细胞表面积2%)。受体、笼形蛋白和衔接蛋白大量集中于此处。 受体胞质端的Tyr-X-X-是衔接蛋白识别的信号，X为任何氨基酸，为分子较大的疏水氨基

15、酸(如Phe、Leu、Met)。 受体同配体结合后启动内化作用，衣被开始组装。,Clathrin coated pit on the cytosolic face of a cell,低密脂蛋白的吸收： 胆固醇主要在肝细胞中合成，以低密脂蛋白（low-density lipoproteins，LDL）释放到血液。 LDL颗粒芯部含有被长链脂肪酸酯化的胆固醇分子。周围由磷脂和胆固醇构成的脂单层包围，有一个较大的Apo-B蛋白（配体）。,LDL Particle,LDL endocytosis,细胞需要胆固醇时，合成LDL跨膜受体蛋白。 受体与LDL颗粒结合后，形成衣被小泡； 进入细胞质的小泡随即

16、脱掉衣被，成为平滑小泡，同早期内体融合，内体中PH值低，使受体与LDL颗粒分离；再经晚期内体将LDL送人溶酶体。 在溶酶体中，LDL被水解成游离的胆固醇。,The receptor-mediated endocytosis of LDL,LDL Endocytosis,受体回收途径： 大部分返回原来的质膜结构域，如LDL受体； 有些进入溶酶体被消化，如EGF的受体，称为受体下行调节（receptor down-regulation）； 有些被运至质膜不同的结构域，形成穿胞运输（transcytosis）。,Transcytosis,五、外排作用,组成型外排途径：由TGN区分泌囊泡向质膜运输，通

17、过default pathway完成转运。更新膜蛋白和膜脂、形成ECM、营养成分或信号分子。 调节型外排途径：如激素或酶储于分泌泡内，当细胞在受到胞外信号刺激时，分泌泡释放出去。,The constitutive and regulated secretory pathways,第四节 内质网,Porter等于1945年发现于培养的小鼠成纤维细胞，因最初看到的是位于细胞质内部的网状结构，故名endoplasmic reticulum，ER。,一、形态与组成,约占细胞总膜面积的一半，是封闭的网络系统。 分为RER和SER。 RER呈扁平囊状，排列整齐，有核糖体附着。 SER呈分支管状或小泡状，无

18、核糖体附着。 细胞不含纯粹的RER或SER，它们分别是ER连续结构的一部分。,RER,SER,膜含60%的蛋白和40%的脂类，PC含量较高，SM含量较少，没有或很少含胆固醇。 约30多种膜结合蛋白，另有30多种位于ER网腔。 葡糖-6-磷酸酶是ER标志酶，核糖体结合糖蛋白（ribophorin）只分布在RER，P450酶系只分布在SER。,二、ER的功能,（一）蛋白质合成 内质网上合成的蛋白主要有： 向细胞外分泌的蛋白、如抗体、激素； 膜的整合蛋白； 需要与其它细胞组分严格分开的酶，如溶酶体的各种水解酶； 需要进行修饰的蛋白，如糖蛋白。,Blobel等（1975）提出信号假说，认为蛋白质N端的

19、信号肽，指导蛋白质转至内质网上合成，获1999年诺贝尔生理医学奖。,Blobel with members of his laboratory,Gnter Blobel,蛋白质转移到内质网合成涉及以下成分： 信号肽：位于N端，约1630个氨基酸，含有6-15个连续排列的带正电荷的非极性氨基酸，又称开始转移序列。 信号识别颗粒（SRP）：6种多肽和1个7S RNA组成，属RNP。与信号序列结合，导致Pr合成暂停。,AA Sequences of ER Signal Peptides,SRP受体，ER膜的整合蛋白，异二聚体，可与SRP特异结合。 停止转移序列，与内质网膜的亲合力很高，阻止肽链继续进

20、入网腔，成为跨膜蛋白。 转位因子，由3-4个Sec61蛋白构成的通道，每个Sec61由3条肽链组成。,Translocation of proteins across ER,蛋白质转入内质网合成的过程：,信号肽与SRP结合肽链延伸终止SRP与受体结合SRP脱离肽链进入内质网信号肽切除肽链延伸至终止。 这种肽链边合成边向内质网腔转移的方式，称为co-translation。,Insertion of Transmembrane protein into the ER membrane,（二）蛋白质的修饰与加工,包括糖基化、羟基化、酰基化、二硫键形成等，几乎所有内质网上合成的蛋白最终都被糖基化。

21、糖基化的作用： 使蛋白质能够抵抗消化酶的作用； 赋予蛋白质传导信号的功能； 某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。,糖基一般连接在4种氨基酸上，分为2种： N-连接的糖基化：与天冬酰胺残基的NH2连接，糖为N-乙酰葡糖胺。 O-连接的糖基化：与Ser、Thr和Hyp的OH连接，连接的糖为半乳糖或N-乙酰半乳糖胺，在高尔基体上进行。,内质网上进行N-连接的糖基化。糖的供体为核苷糖，如GDP-甘露糖、UDP-N-乙酰葡糖胺。 糖分子首先被糖基转移酶转移到膜上的磷酸长醇分子上，装配成寡糖链。 再被寡糖转移酶转到Asn-X-Ser或Asn-X-Thr的Asn上。,Protein glycosylati

22、on in RER,Protein glycosylation in RER,Protein glycosylation in RER,（三）新生肽链的折叠、组装和运输,蛋白的折叠在hsp70家族的ATP酶的作用下完成 。 无法正确折叠的蛋白被转入溶酶体降解，约90%的新合成T细胞受体亚单位和Ach受体都被降解，而从未到达靶膜。 COP II介导由ER输出的膜泡运输。,（四）内质网的其它作用,合成磷脂、胆固醇等。 解毒，如肝细胞的细胞色素P450酶系。 参与甾体类激素的合成。 使葡糖6-磷酸水解，释放糖至血液中。 储存钙离子，作为胞内信号物质，如肌质网。 提供酶附着的位点和机械支撑作用。,第五

23、节 高尔基体,发现于1855年，1889年，Golgi用银染法，在猫头鹰的神经细胞内观察到了清晰的结构，因此定名为高尔基体。,一、形态与组成,由扁平囊泡堆积而成，有极性。通常48个(某些藻类较多)扁平囊在一起，构成Golgi stack。 分布于ER与细胞膜间，呈弓形或半球形。 凸出的一面对着ER称为顺面（cis face），凹进的一面对着质膜称为反面（trans face）。,Structure of the Golgi Complex,Distribution，nucleus green，Golgi body red,膜含有约60%的蛋白和40%的脂类，具有一些和ER共同的蛋白成分。 主要

24、的酶有糖基转移酶、磺基-糖基转移酶、氧化还原酶、磷酸酶、蛋白激酶、甘露糖苷酶、转移酶和磷脂酶等。 标志酶为糖基转移酶。,二、功能区隔,cis Golgi network，CGN是入口区域。 medial Golgi，多数糖基修饰，糖脂的形成以及与高尔基体有关的糖合成发生于此处。 trans Golgi network，TGN是出口区域，参与蛋白质的分类与包装，最后输出。,Golgi network,高尔基体不同区域的细胞化学反应： 嗜锇反应：cis面膜囊被特异地染色； TPP酶：trans面的膜囊； NADP酶：显示中间的膜囊； CMP酶：trans面的囊状和管状结构。,三、主要功能,1、参与

25、细胞分泌活动：RER合成PrER腔COPII小泡CGNmedial Gdgi加工TGN区形成运输泡与质膜融合、排出。 高尔基体依据信号序列或信号斑对蛋白质分类。 2、O-连接的糖基化：糖的供体为核苷糖。,3、进行膜的转化功能：ER合成膜脂转移至高尔基体，经过修饰和加工，形成运输泡与质膜融合。 4、将蛋白水解为活性物质：如将胰岛素C端切除；或将神经肽前体降解为活性片段。 5、参与形成溶酶体。 6、植物细胞壁的形成，合成纤维素和果胶质。,第六节 溶酶体与过氧化物酶体,Lysosome为de Duve与Novikoff 1955年发现。Peroxisome由Rhodin 1954在鼠肾小管上皮细胞中

26、发现。,一、溶酶体的结构,含酸性水解酶（最适pH=5），执行细胞内消化。 具有异质性，酸性磷酸酶是标志酶。 膜有质子泵，溶酶体内pH值低。 膜蛋白高度糖基化。,1、初级溶酶体（primary lysosome） 由高尔基体分泌形成，含多种酸性水解酶。,2、次级溶酶体（secondary lysosome） 是正在进行或完成消化作用的溶酶体，分为自噬溶酶体和异噬溶酶体。 3、残体（residual body） 又称后溶酶体（post-lysosome），已失去酶活性，仅留未消化的残渣，故名。可排出细胞，也可能留在细胞内逐年增多，如表皮细胞的老年斑，肝细胞的脂褐质。,Secondary lysos

27、ome,肝细胞脂褐质,二、溶酶体的功能,细胞内消化：如从LDL释放胆固醇，单细胞真核生物籍其消化食物。 自体吞噬：清除无用生物大分子，衰老细胞、细胞器、个体发育中多余的细胞。 防御作用：如巨噬细胞。 参与分泌过程的调节：如将甲状腺球蛋白降解成有活性的甲状腺素。 形成精子的顶体。,三、溶酶体的发生,在高尔基体的trans面以出芽的方式形成： 前溶酶体蛋白N-连接的糖基化高尔基体磷酸转移酶识别信号斑将N-乙酰葡糖胺磷酸转移在12个甘露糖残基上在中间膜囊切去N-乙酰葡糖胺形成M6P配体与trans膜囊上M6P受体结合通过clathrin衣被包装成运输小泡与晚期的内体融合，受体解离切除甘露糖残基上的磷

28、酸 。,The recognition of a lysosomal hydrolase in Golgi and mannose phosphorylation,Transport of newly synthesized hydrolases to lysosomes,四、溶酶体与疾病,矽肺：二氧化硅尘粒（矽尘）吸入肺泡后被巨噬细内吞噬，导致吞噬细胞溶酶体破裂。激活成纤维细胞，导致胶原纤维沉积，肺组织纤维化。 肺结核：结核杆菌引起肺组织钙化和纤维化。 类风湿性关节炎：溶酶体膜易脆裂。,3各类贮积症 台-萨氏综合症：缺少氨基已糖酯酶A。 II型糖原累积病：缺乏-1,4-葡萄糖苷酶。 Gauc

29、her病：缺乏- 葡萄糖苷酶。 细胞内含物病：N-乙酰葡糖胺磷酸转移酶单基因突变。,台-萨氏综合症溶酶体的同心圆结构,五、过氧化物酶体,Rhodin 1954发现于鼠肾小管上皮细胞。 具有异质性，由单层膜围绕而成。 特点：含过氧化氢酶（标志酶）和一至多种依赖黄素（flavin）的氧化酶，已发现40多种氧化酶。酶特点是将底物氧化后生成过氧化氢，而过氧化氢酶又利用H2O2去氧化其它底物。 RH2+O2R+H2O2,Peroxisome of hepatocyte,烟草叶肉细胞的过氧化物酶体（中央具有尿酸氧化酶形成的晶体状核心）,在动物中： 参与脂肪酸的-氧化； 具有解毒作用，过氧化氢酶氧化有害物质，饮入的酒精1/4是在微体中氧化为乙醛。 在植物中：参与光呼吸，将光合作用的副产物乙醇酸氧化为乙醛酸和过氧化氢，在萌发的种子中，进行脂肪的-氧化。,酶由核基因编码，在细胞质基质中合成，信号序列为-Ser-Lys-Leu-COO-。 膜脂在内质网上合成，通过磷脂转移蛋白PTP转移而来。 已有的过氧化物酶体在细胞分裂时，以分裂方式传给子代细胞。,Zellweger综合征： 也叫脑肝肾综合征； 患者细胞的过氧化物酶体中，酶蛋白输入有关的蛋白质变异，酶体是“空的”； 脑、肝、肾异常，出生3-6个月后死亡。,