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1、CASTAP学习总结1. CASTAP计算是要进行的三个任务中的一个，即单个点的 能量计算，几何优化或分子动力学CASTAP计算是要进 行的三个任务中的一个，即单个点的能量计算，几何优化 或分子动力学.2. CASTAP几何优化任务允许改善结构的几何，获得稳定结 构或多品型物.3. CASTAP动力学任务允许模拟结构中原子在计算力的影 响下将如何移动。4. CASTAP性质任务允许在完成能量，几何优化或动力学运 行之后求出电子和结构性质。5. 不是很明白的地方：自洽计算与非自洽计算的定义域意义 所在【好好看看CASTAP计算是要进行的三个任务中的 一个，即单个点的能量计算，几何优化或分子动力学
2、 CASTAP计算是要进行的三个任务中的一个，即单个点的 能量计算，几何优化或分子动力学.6. CASTAP几何优化任务允许改善结构的几何，获得稳定结 构或多品型物.7. CASTAP动力学任务允许模拟结构中原子在计算力的影 响下将如何移动。8. CASTAP性质任务允许在完成能量，几何优化或动力学运 行之后求出电子和结构性质。9. 不是很明白的地方：自洽计算与非自洽计算的定义域意义所在【好好看看DFT方面量于计算的知识】10. 如果存在的话，CASTEP使用的则是格子的全部对称。既 包含有两个原子的原胞和包含有8个原子的单胞是相对 应的。不论单胞如何定义，电荷密度，键长，每一类原子 的总体能
3、量都是一样的，并且由于使用了较少的原子，使 计算时间得以减少。（这句话没有理解，是什么意思？）11. 有的不仅要优化几何结构有时还要优化品格，在more的 选项中有这个优化。12. AlAs Trajectory.xtd轨线文件，包含每一个优化步骤后的结构。（为什么没有这个文件）13. 用castap可以进行计算态密度和能带结构，而且可以分别 表示出来！MS学习总结1. LDA适合的体系:（1）密度变换比较缓慢的体系（例如金 属体系）（2）高密度体系（例如过渡金属）（3）大多数结构 优化过程2. LDA不适合的体系:（1）对电子非常少的体系（例如化学 反应中的过渡态）（2）对于结合能的绝对值3
4、. GGA在结合能（粘附能）方面更具优势4. CASTEP采用平面波的展开形式来描述电子波函数。按照原子动能的类型来选择相关的平面波。CASTEP使用赝势来重置真实原子势能，能够有效减少平面波的数量Doml31.请问过渡态虚频的物理意义该怎样理解？答：其实，这个问题是个数学问题。要搞懂过渡态虚频的物理意 义，首先要搞懂到底什么是频率。其实这一点经常有人忽视。中学的时候我们学过简谐振动，对应的回复力f=-kx,对应 的能量曲线，是一个开口向上的二次函数E=(k/2)x2.这样的振 动，对应的x=0的点是能量极小值点(简单情况下也就是最小值 点)。这时的振动频率我们也会求3 = (2n )sqrt
5、(k/m)。显然它是 一个正的频率，也就是通常意义下的振动频率。然后，从频率的概念引出虚频的概念。一维情况下，如果能量曲线是一个开口向下的二次曲线呢？ 首先，从能量上看，这是个不稳定的点，中学的物理书上称为“不 稳平衡”。用现在的观点看，就是这个点的一阶导数是零(受力为 0)，且是能量极大值。如果套用上面的公式，“回复力”f=-kx (实际上已经不是回复，而是让x越来越远了)，这里k是个负数，3 =2n sqrt(k/m)显然就是一个虚数了，即所谓的虚频。 Gaussian里面给出一个负的频率，就是对应这个虚频的。实际情况下，分子的能量是一个高维的势能面，构型优化的 时候，有时得到了极小值点，
6、这样这个点的任意方向上，都可以 近似为开口向上的二次函数，这样这里对应的振动频率就都是正 的。对于极大值点，在每个方向都是开口向下的二次函数，那么 频率就会都是负的一一当然一般优化很少会遇到这样的情况。对 于频率有正有负的情况，说明找到的点在某些方向上是极大值， 有些方向上是极小值。如果要得到稳定的能量最低构型，显然需 要通过微调分子的构型，消去所有的虚频。如何微调？要看虚频 的振动方向。想象着虚频对应的就是开口向下的二次函数，显然， 把分子坐标按照振动的方向移动一点点，分子应该就可以顺着势 能面找到新的稳定点，但是也不能太小。而所谓的过渡态，则是 连接反应物和产物之间的最低能量路径上的能量极大值。好比山 谷中的A，B两点，它们之间的一个小土丘，就是过渡态，从入到8 的反应，需要越过的是这个小土丘，而不是两边的高山。这样， 过渡态就是在一个方向上是极大值，而在其它方向上都是极小值 的点。因此，过渡态只有一个虚频。2.
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