凝胶电泳缓冲液及配制

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1、2测序凝胶加样缓冲液 98%去离子甲酰胺10mol/L EDTA(pH8.0)0.025%二甲苯青FF0.025%溴酚蓝甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70。3常用的电泳缓冲液 缓冲液使用液浓贮存液(每升)Tris-乙酸(TAE)1:0.04mol/L Tris-乙酸50:242g Tris碱0.001mol/L EDTA57.1ml冰乙酸100ml 0.5mol/L EDTA(p

2、H8.0)Tris-磷酸(TPE)1:0.09mol/L Tris-磷酸10:10g Tris碱0.002mol/L EDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-硼酸(TBE)a0.50.045mol/L Tris-硼酸5:54g Tris碱0.001mol/L EDTA27.5硼酸20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)碱性缓冲液b1:50mmol/L NaOH1:5ml 10mol/L NaOH1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)Tris-甘氨酸c1:25mmol/L Tri

3、s5:15.1g Tris250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3)0.1% SDS50ml 10% SDS(电泳级)说明:TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5溶液,出现沉淀后则予以废弃。以片都以1TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1TBE以提供足够的缓冲容量。碱性电泳缓冲液应现用现配。Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电

4、泳。42SDS凝胶加样缓冲液 100mmol/L TrisHCl(6.8)200mmol/L二硫苏糖醇(DTT)4%SDS(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油不含DTT的2SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。5凝胶加样缓冲液 缓冲液类型6缓冲液贮存温度0.25%溴酚蓝40.25%二甲苯青FF40%(W/V)蔗糖水溶液0.25溴酚蓝室温0.25%二甲苯青FF15%聚蔗糖(Ficoll400)0.25%溴酚蓝40.25%二甲苯青FF30%甘油水溶液0.25%溴酚蓝440%(W/V)蔗糖水溶液碱性加样缓冲液:300mmol/L NaOH6mmol/L E

5、DTA18%聚蔗糖(Ficoll400)40.15%溴甲酚绿0.25%二甲苯青FF使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍,而与琼脂糖浓度无关。以0.5TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。

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