医药信息检索与利用精简版

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1、医药信息检索与利用医药信息检索与利用 极光十帝联合编写极光十帝联合编写 弑神之剑 信息、知识、情报、文献信息、知识、情报、文献1.信息(information):在自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动的规律、特点的外在表现。2.知识(knowledge):人们通过信息对自然界、人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。3.文献(literature):以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体就是文献。4.情报(information):传递着的有特定效用的知识。信息、知识、情报的联系与

2、区别（信息、知识、情报的联系与区别（考选择或者填空考选择或者填空）u信息信息 知识知识 情报情报情报情报知识知识信息信息文献文献信息源的分类：(1)零次信息 指未经正式发表或不宜公开和大范围内交流的比较原始的素材、底稿、手稿、书信、工作文稿、工程图纸、考察记录、实验记录、调查稿、原始统计数字，以及各种口头交流的知识、经验或意见论点等。这类文献在较小的范围内交流、使用、参考，其传播渠道少，或常保密，或限制使用以及因珍稀的原因，不为人们知晓。其形式多是抄件、打字件、油印件以及内部录音、录像等等。其特点是信息来源直接、真实，内容新颖。因特网的普及，为广大网民提供了跨越空间的口头交流便利，如各种聊天工

3、具。信息源的分类：(2)一次信息 又称原始文献，也称原始信息源，它是作者依据本人的科研和工作成果而形成的文献，这类文献是脑力劳动的正式产品，是科研成果的一种主要表述方式，代表新知识，组成了可供交流的系统性信息。此类文献主要包括：专著、期刊和报纸、科学考察报告、研究报告、会议论文、学位论文、专利说明书、技术标准、政府出版物、产品样本等。信息源的分类：（3）二次信息 指根据实际需要，按照一定的科学方法，将特定范围内的分散的一次信息进行加工整理使之简化和有序化而形成的文献信息。它能较为全面地系统地反映某学科某专业文献的线索，是检索一次信息的工具。这类文献有：书目、题录、索引和文摘等。信息源的分类：（

4、4）三次信息 指通过二次信息提供的线索，选用一次信息的内容，进行分析、综合、研究后而编成的信息。一般包括专题述评、动态综述、系统评价、进展报告、学科年度总结、年鉴、指南和百科全书等。知识产生 记录 原始文献知识重组 知识浓缩词典 名录 指南手册 年鉴 书目等述评 专著 教科书 论文丛集百科全书等三次文献 期刊论文会议论文科技报告学位论文专利说明书文献整理目录 索引 文摘新书通报等二次文献一次文献零次文献 研究活动（实验、观察、思考）研究活动（实验、观察、思考）信息的直接记录或传递信息的直接记录或传递 零次文献（创造知识的素材）零次文献（创造知识的素材）将知识以文字等形式固化将知识以文字等形式固

5、化 一次文献（初始的知识产品）一次文献（初始的知识产品）将分散的文献序列化将分散的文献序列化 二次文献（一次文献的替代品）二次文献（一次文献的替代品）将知识重新组合，使知识序列化将知识重新组合，使知识序列化 三次文献（浓缩的新的信息产品）三次文献（浓缩的新的信息产品）学位论文 是为了取得某一级学位而提交的论文，包括学士论文、硕士论文和博士论文。它们的特点是：论文的水平和质量差别较大，论题比较专一，阐述系统、具体，有一定的独创性观点，且经过一定的审查，故有一定的参考价值。信息交流和信息素养信息交流和信息素养u信息交流：个体之间借助于共同的符号系统所进行的信息传播、交换和分享。u信息需要：就是指人

6、们在从事各项实践活动的过程中，为解决所遇到的各种问题而产生的对信息的需求。u信息动机：指激励和推进个体发动并维持其信息行为导向某一目标的心理过程。u信息行为：人们满足自己信息需要的社会活动的过程。用户的信息行为主要有信息检索行为、信息的选择行为和信息利用行为。u信息需要信息需要是信息行为发生的是信息行为发生的根本基础根本基础，而，而信息动机信息动机则是信息行为发生的则是信息行为发生的根本动根本动力力。u信息素养：包括信息获取的意识，评价、判断信息的能力，查找、收集、组织信息的能力，信息决策及处理能力。u标准：2000年1月18日，美国大学与研究图书馆协会(ACRL)通过了美国高等教育信息素养能

7、力标准信息检索语言信息检索语言u（1）自然语言：指文献作者或文摘提要的作者原来使用的语言，即 出现在文献题名、摘要或正文中的语词。u自然语言检索不足：u (1)不能简单明了而又专指地表达文献及检索课题的主题概念；u (2)不能够语词与概念一一对应，不能够排除多词一义、一词u 多义和词义含糊现象；u 例如：艾滋病、爱滋病、aids 获得性免疫缺陷综合症u (3)不能显示出概念之间的关系；u (4)不能将概念进行系统排列；u (5)不能够在检索时便于将标引用语和检索用语进行相符 性比较。u人工语言情报检索语言：u 情报检索语言是根据情报检索的需要而创制的人工语言，专门用于各种手工的和计算机化的情报

8、检索系统，表达文献主题概念和检索课题概念。其实质是一系列概括文献情报内容的概念及其相互关系的概念标示系统。u 情报检索语言可分为分类检索语言、主题检索语言主题检索语言和代码检索语言三大语系。u举例:医学主题词表医学主题词表（这个考选择，必考，作为一个常年开小差听课的我，（这个考选择，必考，作为一个常年开小差听课的我，是知道的哦是知道的哦）u美国医学主题词表（mesh）u荷兰医学文摘的主题词表（EMTree）u中国中医药学主题词表u（pubmed）主题词表考察检索效率的常用指标考察检索效率的常用指标 u检全率与漏检率检全率与漏检率u 检全率与漏检率是可以说是同一问题的两个相对的概念。检全率高则漏

9、检率就低，而漏检率高则检全率就低：如果检全率为65，则漏检率就是35。检全率是情报检索质量的主要标志，因为漏检率高表明重要情报被遗漏的危险性大，所以在情报检索中，总是力求提高检全率，或者说力求降低漏检率。u检准率与误检率检准率与误检率u 检准率也是文献检索质量的重要标志，因为误检率高表明用于甄别所检出文献是否真正有用的劳动的增加利时间的延误，虽不如遗漏重要文献那样严重，但对检索效率也有重大影响，所以在文献检索中，总是力求提高检准率或者说力求降低误检率。文献数据库的结构文献数据库的结构（填空或选择）（填空或选择）v 文献数据库一般由记录、字段、文档组成。v 文档在数据库中有顺排文档和倒排文档之分

10、。顺排文档是数据库的主体，又称主文档，它按每条记录的顺序号排列。数据库中得到的检索结果都来自于顺排文档。倒排文档是供检索顺排文档的工具，在一个数据库中可能有若干个倒排文档，如主题词索引、著者索引、刊名索引等，它按索引的字顺排列。检索时，计算机按输入检索词的字顺先从指定的倒排文档（索引）中找到匹配的索引词，然后根据索引词后的记录顺序号到主文档中调出记录。v 记录是构成文献数据库的一个完整的信息单元，每条记录描述了一原始信息的外部特征和内部特征。例如，书目数据库中的一条记录通常代表一篇文献，其他类型数据库中的记录可能是一种治疗方案、一组理化指数。v 字段是组成记录的数据项目。例如，在MEDLINE

11、中一条记录代表一篇书目文献，在这条记录中有题名、著者、来源、文摘、主题词等字段。每个字段都有自己的字段标识符（Field tag），如TI（篇名）、AU（著者）、SO（文献出处）、AB（文摘）、AD（著者所在结构）、AN（记录顺序号）等。将记录细划成字段作用是：帮助识别记录内容，方便检索结果输出时格式的选择，便于进行字段检索。v 文献数据库的类型文献数据库的类型（1）按文献数据库的记录内容划分：书目数据库 全文数据库 混合数据库（2）按文献数据库的运行方式划分：光盘数据库 联机数据库 网络数据库几种主要的文献数据库几种主要的文献数据库（1）题录数据库：（论文结构）“题录”是指文献的基本信息，也

12、称为目录。包括题名、作者题名、作者、关键词、作者机构、文献来源文献来源、摘要等。题录数据库是用各种索引方法制作的二次文献数据库，又称题录数据库或篇名数据库，以简略的形式向用户提供文献的信息。如：中国生物医学文献服务系统中国生物医学文献服务系统(Sinomed)(Sinomed)、（2）文摘数据库 （3）图书馆馆藏目录数据库（4）全文数据库（5）光盘数据库（6）多媒体数据库（7）网络数据库 布尔运算符的优先级为：-、*、+，使用括号可改变运算顺序。如果含两个或两个以上的逻辑算符，应先算NOT，然后算AND，最后算OR。也可以用（）来改变计算次序，因为（）里的部分可最先算。()-()-*+3 3

13、截词检索截词检索 截词检索是指在检索词中保留相同的部分，用截词符号代替可变化的部分。它是为了部分解决由于检索式中对同义词列举不全造成的漏检现象而提出的，相当于用逻辑“或”扩展检索范围。截词符号一般用“?”或“*”等。？代表零或一个字母；*代表任意个以上字母 举例：Child*可代表child,children,childly,childhoodColo?r可检索出color,colourDra?t可检索出drat,draft,draught 截词检索主要用于年代、作者、同根词和单复数词的检索，减少输入负担，节省检索时间和费用，提高检全率。SinoMed介绍 中国生物医学文献数据库(sinome

14、d)由中国医学科学院医学信息研究所开发研制。数据规范 sinomed 注重数据的规范化处理和知识管理，全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版医学主题词表（MeSH）中译本、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表，以及中国图书馆分类法医学专业分类表进行主题标引和分类标引。检索系统与 PUBMED 具有良好兼容性 sinomed 检索系统具有检索入口多，检索方式灵活，以及主题、分类、期刊、作者等多种词表辅助查询功能，可满足简单检索和复杂检索的需求，与 PUBMED 具有良好兼容性。可获得良好的查全率和查准率。与维普链接全文 文摘型数据库 中国生物医学文献数据库（CBM）收录1978以来

15、1600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献40余万篇，每月更新。学科范围覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学和中药学等生物医学各领域。CBM中的主题检索（力荐！）主题词的作用：主题词的作用：对同一概念具有不同表达方式的词语进行规范 利于查全率和查准率 便于扩大或缩小检索范围 便于限定文献的主要概念及方面 主题检索的功能：主题检索的功能：将非主题词引见到主题词形式 提供主题词的定义和注释 显示主题词之间的族性关系（上位词、下位词、同位词）副主题词 对主题词进行限定，用于描述某个主题范围内的某个方面，

16、如药物副作用、疾病的诊断、治疗等。目前MeSH词表中共有83个副主题词，中医药学主题词表有11个，每个副主题词都有严格的适用范围。有了副主题词的限定，更能提高文献检索的准确性（查准率）。CBM中的检索历史 最多允许保存200条检索表达式。可从中选择一个或多个检索表达式并用逻辑运算符组成更恰当的检索策略。根据需求选择一个或多个有意义的检索表达式保存成特定的“检索策略”。在“我的空间”中可定期调用该检索策略，及时获取最新信息。无意义的检索表达式选中后点击“删除检索史”可进行删除。系统退出后，检索历史清除。或或 （会考的哦）（会考的哦）PubMed是由美国国立医学图书馆（是由美国国立医学图书馆（NL

17、M）所属的生物技术信息中心（）所属的生物技术信息中心（NCBI）研制开发的网络数据库，是目前国际上公研制开发的网络数据库，是目前国际上公认的检索生物医学文献最具权威、影响最认的检索生物医学文献最具权威、影响最广的数据库。广的数据库。PubMed于于1997年年6月月26日开日开始始，免费向公众开放。，免费向公众开放。维普资讯维普期刊资源整合服务平台收录我国1989年至今出版的8000余种科技期刊的全部原文，其中全文2000余万篇。系统功能概述（考选择或者填空）期刊文献检索文献引证跟踪科学指标分析搜索引擎服务维普镜像网站（呵，这堂课我翘课了，估计是个考点吧！）南京大学镜像：苏州大学镜像矿业大学镜

18、像万方数据知识服务平台万方数据股份有限公司是国内第一家以信息服务为核心的股份制高新技术企业，是在互联网领域，集信息资源产品、信息增值服务和信息处理方案为一体的综合信息服务商。网址：万方数据库检索规则1.PQL语言（PairQuery Language）（1）PQ表达式的基本用法：每个PQ表达式由多个空格分隔的部分组成，每个部分称为一个Pair，每个Pair由冒号分隔符“：”分隔为左右两部分，“：”左侧为限定的检索字段，右侧为要检索的词或短语。（2）精确匹配：使用”实现精确匹配（3）各文献类型的检索字段2.精确检索/模糊检索中国知网中国知识基础设施工程（China National Knowle

19、dge Infrastructure，简称CNKI工程）涵盖了我国自然科学、工程技术、人文与社会科学期刊、博硕士论文、会议论文等公共知识信息资源。读秀学术搜索读秀学术搜索是一个由海量全文数据及元数据组成的超大型数据库。它能够为读者提供260万种图书、10亿页全文资料、100万个人物简介等一系列海量学术资源检索及使用。同时，通过读秀学术搜索，还能一站式检索、借阅馆藏纸质图书、电子图书、期刊等各种异构资源，几乎囊括了图书馆内的所有信息资源。PubMed 主要包括三个层次的数据库 MEDLINE PREMEDLINE（处于加工阶段的文献记录，提供基本的书目数据和文摘，但尚未标引主题词）与出版商直接提

20、供给PUBMED的文献数据（这部分文献是由出版商以电子版形式先传送给PUBMED，然后再传输到NLM标引部加到PREMEDLINE数据库）Mesh Database（考个简答题）（考个简答题）外文电子全文数据库学术性电子期刊出版方式分：印刷版本期刊电子化；纯电子形式出版服务方式：出版商的电子数据库；数据库商集成；OpenAccess开放存取资源全文格式：PDF；HTML（考的）Elsevier全文数据库-ScienceDirect（含Cell Press）MD consult（医学资讯）EBSCOhost全文数据库Ovid(lww)全文数据库ProQuest（PQDD）Wiley-Blackw

21、ell全文数据库Thieme Color Atlas E-BookOvid(lww)全文数据库Ovid公司是全球著名医学信息服务商，通过其检索平台OvidSP，可以检索电子期刊（Journalsovid）、电子图书（Booksovid）以及近百种数据库。电子期刊JournalsOvid 提供访问包括LippincottWilliams&Wilkins（LWW）、美国医学协会和Adisinternational医学药学期刊。电子书BooksOvid数据库DatabasesOvid检索结果：排序保存/输出二次检索星级排序：5星：所有搜索的概念都完整出现在段落里。4星：大多数搜索概念都出现在段落里，

22、但有些不完整3星：缺少一个概念2星：缺少两个概念1星：缺少2个以上的概念其他：个性化服务与定制Wiley-Blackwell全文数据库（老师课上讲过，当时还放了个搞笑视频，不过对于搞笑视频我一般不笑的）John Wiley&Sons Inc.和Blackwell PublishingHoldings LtdWiley出版高质量的学术期刊、过刊集、图书、参考工具书、实验室指南、循证医学图书馆（The CochraneLibrary）、数据库等，是众多的国际权威学会的合作伙伴。Wiley整合科学、技术及医学业务（STM）和Blackwell。Wiley Online Library科学、技术、医学

23、、社会科学及人文1996-这是一个非常好的数据库，医学资源丰富。漫游功能开通后可在三个月内非校内IP访问此库。引文：引文：引文指一篇学术论文中引用的参考文献，通常以脚注或者尾注的形式出现。引文索引：引文索引：引文索引以某一文献(包括作者、题名、发表年份、出处等基本数据)作为标目,标目下著录引用或参考过该文献的全部文献及出处，它主要供用户从被引文献查找引用文献。用于科学绩效的评估 评估学术论文的影响力杰出青年基金、成果评奖、职称评定 评估国家宏观科研状况 中国科技论文统计结果发布会 学术期刊的评价 JCR、国内的期刊引证报告、核心期刊评选ISI Web of Science 包括著名的三大引文索

24、引：Science Citation Index Expanded(SCIE,1990至今)Social Sciences Citation Index(SSCI,1956至今)Arts&Humanities Ciation Index(AHCI,1975至今)JCR（期刊引（期刊引证报告）证报告）影响因子，指的是该刊前二年发表的论文在当年被引用的次数除以该期刊前两年发表的论文的总数所得到的值。（可能会给你个图，让你数学计算！）特种文献(Special Categories of Documents)是指那些在出版发行和获取途径两方面都较为特殊的科技文献。包括：会议文献（这节课我好像又翘了不懂

25、，记住吧）、专利文献、学位论文、标准文献及科技报告等。专利文献(Patent Documents)是实行专利制度的国家及国际性专利组织在审批专利过程中产生的官方文件及其出版物的总称。科技报告(Scientific and Technical Report)是关于某科研项目或活动的正式报告或记录。PQDD：UMI出版的博硕士论文数据库。涵盖从1861年开始至今的论文题录。可以免费阅读1997年以来论文全文前24页。SUMMARY 这些PPT总结基本都是从口腔一位同学给的PPT里面筛选出来的，比较基础的一些知识，对立面的考点或者重要知识点基本做了标注和标记，估计考试会有二十分左右的小题目在里面。知识点主要是绪论，pubmed,以及CBM的知识，其他太碎，不好整理。（什么都写得话也不叫重点了！)对于大题目，主要以作业和宋黎明老师的课件上的题目为主，过几天也会有相应材料上传