生物化学基础知识篇

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1、 基 础 知 识 篇 生 物 化 学 知识点：1、 各类糖分子的结构和功能；2、 脂类中与生物膜有关的物质结构与功能；3、 核酸的基本结构、相互关系与功能；4、 各类氨基酸的基本结构、特征以及蛋白的构象与功能的关系；5、 酶的分类、作用机制、抑制类型、动力学过程与调节；6、 代谢中的生物氧化过程特别是光合磷酸化过程的机理及意义；7、 代谢中的糖代谢过程；8、 核酸的生物合成、复制、转录及基因表达；9、 各种代谢过程的调控及相互关系；10、 现代生物学的方法和实验手段特别是分离、纯化、活性册顶的基本方法等；11、 生物化学研究进展； 将两种旋光不同的葡萄糖分别溶与水后，其旋光率均逐渐变为+52.

2、7。，称为变旋现象。 羟甲基在糖环平面的上方的为D-型，在平面的下方的为L-型。在D-型中，半缩醛羟基在平面的下方的为-型，在平面的上方的为-型。 一切糖类都有不对称碳原子，都具旋光性。 区分酮糖、醛糖用Seliwanoff反应。 天然糖苷多为-型。 糖醛酸是肝脏内的一种解毒剂。 自然界存在的糖胺都是己糖胺。 麦芽糖为-D-葡萄糖-（14）-D-葡萄糖苷，异麦芽糖为-D-葡萄糖-（16）-D-葡萄糖苷，蔗糖为-D-葡萄糖-，（14）-果糖苷，乳糖为半乳糖-（14）-D-葡萄糖苷，纤维二糖为-D-葡萄糖-（14）-D-葡萄糖苷。 直链淀粉成螺旋状复合物，遇碘显紫蓝色，碘位于其中心腔内，在6205

3、80nm有最大光吸收。支链淀粉分支平均有2430个葡萄糖，遇碘显紫红色，在530555nm有最大光吸收。糖原遇碘显棕红色，在4305490nm有最大光吸收。 与糖蛋白相比，蛋白聚糖的糖是一种长而不分支的多糖链，即糖胺聚糖。其一定的部位上与若干肽链连接，糖含量超过95%，多糖是系列重复双糖结构。 糖蛋白是病毒、植物凝集素、血型物质的基本组成部分，Fe2+、Cu2+、血红蛋白和甲状腺素转运蛋白是糖蛋白，它们分别叫转铁蛋白、铜蓝蛋白、触珠蛋白、甲状腺素结合蛋白。参与凝血过程的糖蛋白有：凝血酶原、纤维蛋白酶原。 血型物质含75%的糖，它们是：岩藻糖、半乳糖、葡萄糖、半乳糖胺。 木糖-Ser连接为结缔组

4、织蛋白聚糖所特有。 动植物体的不饱和脂肪酸为顺式，细菌中含脂肪酸种类少，大多为饱和脂肪酸，有的有分支。 分析脂肪酸混合物的分离用气液柱层析，即气液色谱技术。 甘油三酯、甘油单酯形成小颗粒微团，叫micelles。 烷基醚脂酰甘油含有2个脂肪酸分子和一个长的烷基或烯基链分别与甘油分子以酯键、醚键相连。 糖基脂酰甘油中，糖基与甘油分子第三个羟基以糖苷键相连。 磷脂根据所含醇类可分为甘油磷脂类和鞘氨醇磷脂类。 不饱和脂肪酸常与甘油分子的第二个碳原子羟基相连。 肝脏、心肌中的甘油磷脂多为磷脂酰肌醇，脑中的甘油磷脂多为磷脂酰肌醇磷酸、磷脂酰肌醇二磷酸。 缩醛磷脂中一个碳氢键以醚键与甘油C1羟基相连。 除

5、了11-顺-视黄醛外，多数直链萜类的双键均为反式。 柠檬油的主要成分是柠檬苦素，薄荷油的主要成分是薄荷醇，樟脑油的主要成分是樟脑。 胆石几乎全是由胆固醇组成，它易与毛地黄核苷结合沉淀。 脊椎动物体内，胆酸能与甘氨酸、牛黄氨酸结合成甘氨胆酸、牛黄胆酸。 蟾毒不以糖苷而以酯的形式存在。 前列腺素是花生四烯酸及其他不饱和脂肪酸的衍生物。分为PGA、PGB、PGD、PGE、PGF、PGG、PGH、PGI等八类，其功能有：平滑肌收缩、血液供应、神经传递、发炎反应的发生、水潴留、电解质去钠、血液凝结。 在tay-sachs病中，神经节苷脂在脑中积累。 按生理功能，蛋白质可分为酶、运输蛋白、营养和贮存蛋白、

6、收缩蛋白运动蛋白、结构蛋白质和防御蛋白质。 胱氨酸、酪氨酸不溶于水。脯氨酸、羟还能溶于乙醇或乙醚中。 氨基酸分类：按R基的极性，可以分为：、非极性R基氨基酸：Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro。、不带电荷的极性氨基酸：Ser、Thr、Tyr、Asn、Gln、Cys、Gly。、带正电荷的极性氨基酸：Lys、Arg、His。、带负电荷的极性氨基酸：Asp、Glu。按R基的化学结构分：脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环族氨基酸。 锁链素的吡啶环结构由4个Lys侧链组成，只存在于弹性蛋白中。 氨基酸的旋光符号和大小取决于其R基的性质，并与测定时溶液的PH值有关。 在远紫外区，

7、氨基酸均有光吸收，但在近紫外区（220300nm），只有Tyr、Phe、Trp等氨基酸有光吸收。因为其R基含有苯环共轭双键系统。 含有1氨基1羧基和不解离R基的氨基酸均有类Gly的滴定曲线。 PI以上的PH，氨基酸带净负电荷，在电场中向正极移动。 氨基酸氨基的一个H为烃基（包括环烃基及其衍生物）取代，如2，4-二硝基苯（FDNB）在弱碱溶液中发生亲核芳环取代而生成二硝基苯基氨基酸（DNP-氨基酸），即烃基化反应。 蛋白质的化学修饰，是在较温和的条件下，以可控制的方式使蛋白与某种试剂（称化学修饰剂）起特异反应，以引起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变。 酪氨酸的酚基在3和5位上容易发

8、生亲电取代反应，它也可以与重氮化合物（如对氨基苯磺酸的重氮盐）结合成桔黄色化合物，叫Pauly反应。组氨酸的侧链咪唑基与重氮苯磺酸结合成棕红色化合物。 蛋氨酸侧链上的甲硫基是一个很强的亲核基团，与烃化试剂如甲基碘容易形成锍盐，该反应为巯基试剂所逆转。 半胱氨酸的巯基能打开乙撑亚胺（即氮丙啶）的环，生成的侧链带正电荷，为胰蛋白酶的水解提供一个新的位点。 巯基的氧化的底物是巯基与金属的络合物。 逆流分溶仪只用于制备分离，如蛋白质、肽、核酸和抗生素等的分离提纯。 肽键的结构实际是一个共振杂化体，由于氧电挨离域形成了包括肽键的羧基氧、羧基碳、酰胺氮在内的O-C-N 轨道系统。 双缩脲反应是肽、蛋白所特

9、有的。 嗜热菌蛋白酶含锌和钙两种金属。 牛胰核糖核酸酶是测定一级结构的第一个酶分子，有124个残基组成，分子内含有4个二硫键。 同源蛋白质是指不同机体实现同一功能的蛋白质，它的氨基酸顺序中这样的相似性被称为顺序同源现象。 凝血酶属于丝氨酸蛋白水解酶类。 蛋白人工合成中氨基保护基有苄氧甲酰基、三苯甲基、叔丁氧甲酰基、对甲苯磺酰基，可用HBr/CH3COOH在室温下除去。Cys-SH常用苄基（Bzl）或对甲氧苄基（MBzl）保护，前者用Na-液氨处理除去，后者在液HF中于0处理30分钟除去。Lys的远-NH2用Tosyl保护，用Na-液氨处理除去。 羧基活化方法有：酰氯法、叠氮法、活化酯法、混合酸

10、酐法。 最有效的接肽缩合剂是N，N-二环己基碳二亚胺（DCCI）。 研究蛋白二级结构的方法X-射线衍射法。利用重氢交换法可以测定蛋白分子中螺旋的含量。核磁共振光谱法可以测定蛋白分子中哪个氨基酸残基发生构象变化。圆二色性法可以用测定螺旋和折叠片的含量。荧光偏振法可以测定疏水微区、Trp、Tyr微区。喇曼光谱用于研究主链构象。用Damachandran图来表示。 肽平面内C=O、N-H呈反式排列。 当的旋转键N1-C两侧的N1-C1和C-C2呈顺式时，规定=0；同样，的旋转键C-C2两侧的C-N1和C2- N2呈顺式时，规定=0。从C向N1看，沿顺时针方向旋转C-N1键所形成的角度规定为正值，反时

11、针旋转为负值；从C向C2看，沿顺时针方向旋转C-C2键所形成的角度规定为正值，反时针旋转为负值。螺旋中 =57，=48。平行式片层中=119，=+113。反平行式片层中 =139，=+135。 -螺旋的比旋不等于构成其本身的氨基酸的比旋之和，但无规卷曲则相等。测定蛋白质的比旋特别是其旋光色散是研究二级结构的重要方法。 -螺旋中的Pro或Hyp形成一个“结节”（kink）。 Glu主要在-螺旋，Asp、Gly分布于转角，Pro在-螺旋C末端或转角中，二级结构预测是用概率统计学方法获得的。 （超二级结构）存在于-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白、纤维蛋白等。 可溶性纤维蛋白有角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白

12、，不可溶性纤维蛋白有肌球蛋白、纤维蛋白原。 胶原的链间氢键是一条连的三联体（Gly-x-Y）Gly的酰胺氢与另一条链相邻三联体x位上的羰基氧之间形成的，此外Hyp的羟基也参与链间氢键的形成。链间共价交联键主要是在Lys、Hyl之间形成的。在胶原蛋白中，还存在链间二硫键。 随着年龄的增长，胶原三螺旋内，三螺旋间的共价交联越来越多，胶原纤维越硬越碎。 弹性蛋白的重复序列为Lys-Ala-Ala-Lys和Lys-Ala-Ala，可以以赖氨酰正亮氨酸、锁链素、异锁链素交联。 三级结构决定于氨基酸顺序的直接证据是某些蛋白的可逆变性。White、Anfinsen用8mol/L尿素、-巯基乙醇处理牛胰核糖核

13、酸酶及复性的实验。 蛋白折叠的策略是：使主链肽基间形成最大数目的分子内氢键同时保持大部分能成氢键的侧链处于蛋白分子的表面与水相互作用。 三级结构是多肽链上各个单链的旋转自由度受到各种限制的总结果，这些限制包括：肽键的硬度即肽键的平面性质、C-C键和C-N键旋转的许可角度、肽链中疏水基和亲水基的数目和位置、带正电荷和带负电荷的R基的数目和位置几溶剂和其它溶质等。 范德华力包括定向效应、诱导效应、分散效应。定向效应发生在极性分子或极性基团之间，是永久偶极间的静相互作用。分散效应在多数情况下起主要作用，是非极性分子或极性基团仅有的一种范德华力。 范德华吸引力只有当两个非键合原子处于一定距离时最大，这

14、个距离叫接触距离或范德华距离。 疏水化合物或基团进入水中，其周围的水分子将排列成刚性的有序结构笼形结构。 二硫键的形成并不指令多肽链的折叠。 变性是一个协同性的过程，是在所加变性剂的很窄浓度或很窄的温度和PH间隔内突然发生的。 肌红蛋白是由一条多肽链和一个血红素（heme）辅基组成的，有8段螺旋，排为2层。 分析球状蛋白的晶体结构必须向待分析的蛋白晶体中引进适当的重金属原子，以便得到同晶置换晶体。 给定气压下，肌红蛋白的Y值比血红蛋白高 降低PH值、增加亚基的协同作用而促进血红蛋白释放氧气。这种H+和O2释放的关系称为波尔效应。（Bohr effect） 血红蛋白发生氧合时，连接分子内各亚基的

15、盐桥全部断裂。 镰形贫血症由于血红蛋白中的链的Glu-6被Val-6所取代，可用KCNO修饰而抑制成镰形。 抗原决定簇：抗原分子中决定抗原特异性并能与和它互补的抗体结合的那部分结构。抗原-抗体等价存在时将发生最大交联，产生最大量的免疫沉淀或者沉淀素。 IgG、IgA、IgM、IgD、IgE五类免疫球蛋白的重链分别为、。其中A、M分子量大。A是分泌液（眼泪、粘液和唾液）中存在的一类主要抗体。 抗体的一级结构的每一个结构域，在自己的辖区内都有一个二硫键。免疫球蛋白的三级结构最主要的特点是免疫求蛋白折叠，它是由二个折叠片夹着疏水残基内核而形成的一种结构式样。 连接可变区、恒定区的短的多肽链叫开关区。

16、 在维持生命过程中不可缺少的，而来自亲代的基因又是相同的，即同型合子，这种突变是致命的。 人的某些生理、病理性缺氧可通过红细胞中DPG浓度的改变来调节组织的获氧量。贮存血液中加入肌苷（inosine），即可防止DPG的下降，因为它可以通过红细胞膜并在细胞内经一系列反应转变为DPG。 氧的S形曲线、波尔效应及DPG效应物的调节使血红蛋白的输氧能力达最高效力。 别构效应在生物系统分子过程的调节中起关键作用。血红蛋白是了解得最清楚的别构蛋白。 分离和提纯蛋白质的各种方法主要是利用蛋白质之间的各种特异性差异，包括分子大小和形状、酸碱性质、溶解度、吸附性质和对其它分子的生物学亲和力。 分散相质点在胶体系

17、统中保持稳定的条件有：分散相质点在1100nm范围内；分散相的质点带同种电荷；分散相的质点能与溶剂形成溶剂化层。 蛋白质沉淀的方法有：盐析法、有机溶剂沉淀法、重金属盐沉淀法、生物碱试剂和某些酸类沉淀法、加热变性沉淀法。 测定蛋白总量的方法有：凯氏定氮法、双缩脲法、Folin-酚法、紫外吸收法。 较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由2个或2个以上相对独立的三维实体（结构域）缔合而成的。结构域是球状蛋白质的折叠单位，多肽链折叠的最后一步是结构域的缔合（association）。 很多结构域的酶，其活性中心都位于结构域之间，通过结构域更容易构建特定三维排布的活性中心。 Hill系数不为1.0，表明蛋

18、白质多于一个结合位点，并且各个位点间彼此有相互作用。 生物大分子的可变性（柔性）和它结构的精确性（刚性）是保证生物大分子行使其特有生物的独立统一的性质。结构的刚性是它们相互识别和结合的基础，结构的柔性则允许并保证它们在结合过程中和结合后发生各种需要的构象变化。 四级结构的蛋白质（quaternary protein）中每个球状蛋白质称为亚基（subunit）。亚基一般只有一条链，也有由2条、多条肽链由S-S连接而成的亚基。对称的寡聚蛋白分子是由2个、多个不对称的等同结构成分组成的，这种等同结构成分称为原体（protomer）。对称性是四级结构的重要性质之一。 别构效应（allostric ef

19、fect）指蛋白质与配基结合后改变蛋白质的构象，进而改变蛋白质的生物活性的现象。同位效应（homotropic effic）是指别构蛋白质与同一种配基的结合对于和同种配基结合能力的影响。 酶的辅助因子在反应中传递电子、原子及某些化学基团。它们可以是金属离子及有机化合物，本身无催化作用。 米氏方程的前提是酶与底物反应的“快速平衡说”。 不可逆抑制剂有Ks型和Kcat型两类，多数为Ks型。 大部分非竞争性抑制是由于与酶的活性中心外的硫氢基结合引起。 砷化物的毒理作用在于破坏了硫辛酸辅酶，从而抑制了丙酮酸氧化酶系统。 Kcat型不可逆抑制剂以潜伏状态存在，它与某些酶的活性中心结合后而激活成有抑制活性

20、的抑制剂，被看作是酶的“自杀性低物”。 酶的分类：氧化-还原酶类、移换酶类、水解酶类、裂合酶类（醛缩酶、水化酶、脱氢酶）、异构酶类、合成酶类。 加入竞争性抑制剂，Vmax不变，Km变大，且Km=Km； 加入非竞争性抑制剂，Km不变，Vmax变小，且Km=Km； 加入反竞争性抑制剂，Vmax、Km变小，且KmKm. Koshland提出了“诱导稧合”假说（induced-fit hypothesis）：当酶与底物分子接近时，酶蛋白受底物分子的诱导，其构象发生有利于底物结合的变化，酶与底物在此基础上互补稧合，进行反应。 TPCK（N-对甲苯磺酰苯丙酰氯甲基酮）通过使His烷化对酶进行亲和标记。而碘

21、乙酸、对氯汞苯甲酸可以与巯基作用。 共价催化的最一般的形式是催化剂的亲核基团对底物中亲电子的碳原子进行攻击。 酶蛋白中的亲核基团有：丝氨酸羟基、半胱氨酸巯基、组氨酸咪唑基、 广义的酸碱催化反应包括将水加到羰基上，羧酸酯、磷酸酯的水解，从双键脱水，各种分子重排及许多取代反应等 广义的酸碱催化与共价催化可使酶反应速度大大提高，如牛胰核糖核酸酶、牛凝乳蛋白酶。 溶菌酶（lysozyme）含129个残基的单肽链，有四对二硫键，其活性中心有Glu35、Asp52等残基。 胰凝乳蛋白酶选择性地水解由芳香族氨基酸羧基形成的肽键，其最适底物为N-对甲苯磺酰苯丙酰乙酯或甲苯碘酰胺苯丙酰胺。 羧肽酶Tyr248、

22、Arg145、Glu270及Zn2+将底无分子定位于活性中心中。 L19RNA既有核糖核酸酶（ribonuclease）活性，又有RNA聚合酶活性，对竞争性抑制剂敏感。 许多多酶体系的自我调节都是通过其体系中的别构酶来实现的。 某些酶由于结合了专一性的激促蛋白质或抑制蛋白质而改变活性，这类蛋白质有钙调蛋白、抗血友病因子。 称为调节酶的酶有别构酶、共价调节酶。 底物浓度变化引起的变构酶促反应速度的变化几乎是全或无的，由于正协同效应，使得酶的反应速度对底物浓度变化敏感。 Hill系数可作为判断协同效应的一个指标，具正协同效应的酶的Hill系数大于1。 ATCase（天冬氨酰转氨甲酰酶）是嘧啶核苷酸

23、生物合成-合成CTP-多酶体系反应序列中的第一个酶。受CTP反馈抑制，ATP增强其与底物的亲和力，均不影响Vmax。 PALA： N-（磷乙酰）-L-天冬氨酸 ATCase是既有同促效应又有异促效应的别构酶，它符合齐变模型（MWC）。 3-磷酸甘油醛脱氢酶有四个亚基，可与4个NAD+结合，结合常数不同。 齐变模型（MWC）不适用于负协同效应。 胰蛋白酶只水解赖氨素养、精氨酸的羧基形成的肽键；胰凝乳蛋白酶只水解芳香族氨基酸的羧基形成的肽键；被肠激酶激活形成的胰蛋白酶是所有胰脏蛋白酶原的共同激活剂。在它的操纵控制下，可以使所有胰脏蛋白酶同时作用。 寡聚酶可分类为：含相同亚基的寡聚酶、含不同亚基的寡

24、聚酶（它包括双功能寡聚酶、含有专一性的非酶蛋白亚基的寡聚酶、具有底物载体亚基的寡聚酶。）。 乳酸脱氢酶亚基有：骨胳肌型（M）和心肌型（H）。其同功酶有HHHH、HHHM、HHMM、HMMM、MMMM等几种。 化学酶工程包括自然酶、化学修饰酶、固定化酶及化学人工酶的研究与应用。 影响酶促反速度的因素有：底物浓度、PH、温度、酶浓度、激活剂、抑制剂。 酶活性中心常有的基团是：Ser、His、Lys、Cys。 酵母脱氢酶在催化时，辅酶的尼克酰胺环C4上只有一侧是可以加氢或脱氢的，这种专一性定为A型。凡是酵母脱氢酶中尼克酰胺环上氢位置相似，同处一侧，具同侧专一性的酶均称A型专一的酶。凡是酵母脱氢酶中尼

25、克酰胺环上氢位置不同，处于异侧，具另一侧专一性的酶均称B型专一的酶。如Glu脱氢酶、-甘油磷酸脱氢酶。 活性中心的形成要求酶蛋白分子具有一定的空间构象。辅酶分子或辅酶分子的一部分往往是活性中心的组成部分。 酶分子中可以被修饰的基团包括：硫氢基、羟基、咪唑基、氨基、羧基等。 通过共价催化而提高反应速度的酶有：丝氨酸类酶与酰基形成酰基-酶，或与磷酸形成磷酸-酶，如磷酸葡萄糖变位酶。半胱氨酸类酶活性中心的半胱氨酸硫氢基与底物酰基形成含有共价硫酯键的中间物。组氨酸类酶活性中心的组氨酸咪唑基在反应中被磷酸化。赖氨酸类酶的赖氨酸远端氨基与底物羰基形成西夫碱中间物。 酶蛋白中的广义酸碱催化功能基团有：硫氢基

26、、酚羟基、咪唑基、氨基、羧基等。 催化中有“Asp-His-Ser”电荷中继网的酶有：胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、弹性蛋白酶及枯草杆菌蛋白酶。 来自共同祖先、通过基因改变而得到不同专一性的结果，称“倾异进化”。酶来源各异，但它们的电荷中继网组成又相同，称异源的“倾同进化”。 多酶复合体有：丙酮酸脱氢酶复合体、脂肪酸合成酶复合体。 有的别构酶只有一个专一性调节物，称单价别构酶。有的别构酶有2个或2个以上的专一性调节物，称多价别构酶。通2个或多个多价别构酶可以将2个或多个多酶体系连接在一个控制网中进行调节。 调节酶可以在多酶体系中对代谢反应起调节作用，它们本身的活性受到严格的调节控制。 调节物或效应物

27、与酶分子中的别构中心（调节中心或控制中心）结合后，诱导出或稳定住酶分子的某种构象，使酶活性中心对底物的结合与催化作用受到影响，从而调节酶的反应速度及代谢过程，此效应称为酶的别构效应。酶的别构效应与酶的四级结构有关。 嘧啶核苷酸C1-N1 N糖苷键，嘌呤核苷酸C1-N9 N糖苷键。 A、C中，N原子常处于氨基状态，极少处于亚胺基状态；G、T中，C6氧原子常为酮式，极少为烯醇式。 DNA可塑性是DNA分子、多核苷酸连的骨架上的共价键的转角改变引起的。 双链RNA、DNA-RNA均为A构象。 tRNA5末端为pG或pC。 不同tRNA有不同的额外环，是tRNA分类的指标。 TC环（假尿嘧啶核苷-胸腺

28、嘧啶核糖核苷环）由7个核苷酸组成，所有的tRNA此环中都有TC。 纯DNA的OD260为1.8，纯DNA的OD260为2.0。 1 OD 值相当50g/ml双螺旋DNA，40g/ml单链DNA（RNA），20g/ml寡核苷酸。 RNA分离用蔗糖梯度离心，DNA分离用氯化铯梯度离心 人体不能合成维生素，必须从食物中获取。 脂溶性维生素有：维生素A、维生素D、维生素E、维生素K。水溶性维生素有：维生素C、维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12。 维生素D有维生素D3、维生素D2两种。与胆固醇同具环戊烷多氢菲结构。 人皮肤的维生素原为7-脱氢胆固醇，麦角、真菌的维生素D2原为麦角固醇，维生

29、素D3、胆钙化醇进入肠后，促进钙的运输。 维生素E为一种抗氧化剂，保护线粒体膜上的磷脂抗自由基作用。 维生素K的主要化学结构为2-甲基-1，4-萘醌。依赖于维生素K的凝血因子有：凝血因子、凝血因子、凝血因子、凝血因子。 人、猴、豚鼠在肝脏内缺少一种古洛内酯氧化酶而不能合成维生素C。 VB1为硫胺素。VB2为核黄素，存在与FMN、FAD中。 泛酸又称遍多酸（patothenic acid），与辅酶A（coenzyme A）有了解。 四氢叶酸所传递的一碳单位，可以是甲基、亚甲基、甲川基、甲酰基、亚胺甲基。 羧化酶形成酶与生物素复合体的反应是：Enz+ATP+biotinEnz-biotin+AMP

30、+Pi 硫辛酰胺是与酶结合的辅酶，传递氢和乙酰基。与硫辛酰胺有关的酶有：硫辛酰胺转乙酰酶、二氢硫辛酰胺脱氢酶。 VB12又名钴胺素，深红色吸水结晶不熔。以5-脱氢腺嘌呤核苷基取代其氢成为VB12辅酶，化学，名称为5-脱氢腺嘌呤核苷钴胺素，是变位酶甲基促丙二酸单酰辅酶A变位酶的辅酶。 青霉素只对革兰氏阳性菌有作用，多粘菌素只对革兰氏阴性菌有作用。 细菌耐抗生素的即理有：耐药菌产生导致抗生素失效的酶；耐药菌改变对抗生素的敏感部位；耐药菌降低细胞透过抗生素的能力。 内酰亚胺环破裂导致内酰胺类抗生素失效，乙酰化导致氯霉素失效，腺苷酰化或N-乙酰化导致氨基环醇类抗生素失效。 防线菌素D含有一个发色团，吩

31、噁嗪酮（phenoxazone）和两个环五肽，它特异地与双链DNA非共价结合使之失去模板功能，不与单链DNA、RNA、DNA-RNA结合。 丝裂霉素参与同DNA交联的是氮丙啶基和氨甲酰基。 利福霉素是含萘氢醌的大型内酯环抗生素，抑制细菌转录，它与起始的嘌呤核苷酸5三磷酸（pppG、pppA）竞争与酶结合。 吲哚霉素竞争抑制Ser-tRNA合成。氨基环醇类抗生素引起原核mRNA的错读。春日霉素专一抑制30S起始复合体的形成。四环素族抗生素封闭30S上的A位点。氯霉素与50S结合抑制肽酰转移酶活性。环己亚胺抑制真核生物抑制肽酰转移酶活性。红霉素、大环内酯类抗生素抑制50S移位反应。嘌呤霉素与50S

32、亚基A位结合，抑制氨酰tRNA的进入，过早终止肽链的合成（对处于A位的tRNA无作用）。 多肽类抗生素降低膜表面张力而改变膜的透性多烯类抗生素选择性地作用于含固醇的膜。 肽聚糖的生物合成分为五步：合成UDP-糖-肽单位；向载体脂转移糖-肽单位；二糖-肽单位的合成；向增长的多糖链转移二糖-肽单位；多糖链通过转肽作用而交联。 对青霉素分子的改造有：更换侧链R；从羧基部分制成盐或连接其他化合物或基团；改造母核。 6-ADA：6-氨基勤霉烷酸。7-ACA：7-氨基头孢晚酸。 青霉素的主要结构是内酰胺环（A环）。各型青霉素的区别是侧链R的不同。 链霉素的结构有链霉胍和链霉二糖胺两部分，后者由链霉糖和2-

33、甲氨基葡萄糖构成。 链霉糖中醛基是链霉素的药效部分，易为半胱氨酸、维生素C、羟胺等破坏。 链霉素为氨基环醇类化合物，碱性强。 氨基环醇类抗生素含一个环己醇型配基，以糖苷键与氨基糖结合。 氯霉素有2个不对称碳原子，只有左旋异构体有抗菌的能力。 临床用的四环素族抗生素有：金霉素、土霉素、四环素。 大环内酯类抗生素有红霉素、碳霉素、竹桃霉素、麦迪霉素。 多烯大环内酯类抗生素的结构特点是在分子中既有经内酯化作用而闭合的大碳环，又有一系列的共轭双键。如制霉菌素。 丝裂霉素是一种吲哚醌衍生物。分子中含氮丙啶、氨甲酸酯、氨基苯醌等抗肿瘤活性的基团。争光霉素是一族与铜离子螯合的含硫配糖多肽抗生素，具弱碱性。进

34、入体内后，集中在皮肤、食道、肺、阴茎等组织。能抑制迅速增殖细胞的DNA合成。 链霉素、勤霉素、多粘菌素B曾用于家畜的人工受精。 激素按其化学本质分为：含氮激素、甾醇类激素、脂肪酸衍生物激素。 激素是生物体内特殊的组织或腺体产生的直接分泌到体液中（动物的血液、淋巴液、脑脊液、肠液），通过体液运输到特定的作用部位，从而引起特殊的激动反应的一群微量的有机化合物。 钙调蛋白及其它钙传感器含有重度出现的“螺旋区-泡区-螺旋区”结构，这种结构也被称为EF手图象。 七螺旋区结构是激活G蛋白的跨膜受体所具有的普遍性质，它是各种G蛋白级了解列中多次出现的主旋律。 cAMP在细胞中的作用受到cGMP的拮抗，游离钙

35、离子、前列腺素均影响其作用的发挥。 碘离子在甲状腺过氧化酶及过氧化氢的作用下，氧化为活性碘。碘化只发生在甲状腺球蛋白中的原球蛋白的酪氨酸残基上。 甲状腺素的生物合成受到硫脲、硫脲嘧啶的抑制。 甲状腺素刺激糖、蛋白、脂肪和盐的代谢，促进机体生长发育和组织分化。对中枢神经系统、循环系统、造血过程、肌肉活动等有显著的作用。 垂体前叶分泌的激素有促肾上腺皮质激素、促甲状腺激素、促卵泡激素、促黄体生成激素、生长激素、催乳激素。 生长激素刺激骨软骨的生长、促进粘多糖及胶原的合成。 促肾上腺皮质激素（ACTH）可促进体内贮存的胆甾醇在肾上腺表皮中转化为肾上腺皮质酮，并刺激肾上腺表皮分泌激素。 ACTH族激素

36、及-LPH族激素来源于ACTH-LPH前体。 垂体后叶激素指催产素和加压素，是含二硫键的二十元环。其活性为胰蛋白酶破坏。 催产素有种属特异性，使多种平滑肌收缩，具催产及使乳腺排乳的功能，为孕酮抑制。 加压素无种属特异性，使小动脉收缩而增高血压，并较少排尿。 胰岛素促进组织吸取葡萄糖，促进肝脏、肌肉、脂肪组织的合成代谢，抑制分解代谢。 神经生长因子是在脊椎动物的交感神经元和感觉神经元的发育中起关键作用的有生物活性的蛋白因子。 c-型、v-型的yes、fgr、fes、abl、ras基因均编码酪氨酸级酶。 胰高血糖素主要作用于肝脏，并不使肌糖原分解。 甲状旁腺素、降钙素作用于骨基质及肾脏，共同调节钙

37、磷代谢，使血中钙磷浓度相对稳定。 Ca2+可以形成具较大半径的不对称的复合物，Mg2+偏向于形成小的对称的壳状复合物。 抑制CaM使细胞生长阻断在G1-S期转换上。 Ca2+-CaM通过活化NAD激酶，触发受精卵分裂。 肾上腺皮质、性腺及胎盘分泌的激素都是甾醇类激素。 胆甾醇（27碳）转变为孕酮（即黄体酮，21碳）后转变为其他的激素。 7种皮质激素都含有21个碳原子。 皮质激素按生理功能分为糖皮质激素和盐皮质激素，前者包括皮质酮、可的松，后者包括醛甾酮、脱氧皮质酮。 糖皮质激素能抑制糖的氧化，促进蛋白转化为糖，调节糖代谢，升高血糖，并能利尿。大剂量也能减轻炎症及过敏反应。 盐皮质激素促使体内保

38、留钠及排除钾，调节水盐代谢。 胎盘是妊娠后期体内孕酮的主要来源。 体内孕酮、雌二醇联合作用，是月经及妊娠过程能正常完成。 雄性激素和雌性激素均由胆甾醇转化而成，可以相互转变。 雄性激素在机体内可变为雌性激素，由尿排出。雌性激素在机体内可变为雄性激素，由尿排出。 在雄体中，平衡偏向雄性激素，雄体中排出较多的雌酮。 由于环戊烷上的不饱和链的位置或取代基团不同，可将已知的前列腺素分为E、F、A、B四类。 前列腺素对全身系统如生殖、心血管、呼吸、消化几神经等都有作用。能使子宫及输卵管收缩，可用于引产；能溶解黄体可治疗持久性黄体，提高怀孕率；能使血管扩张或收缩；支气管平滑肌解痉；抑制胃酸分泌；调节各种特

39、殊器官血流量，控制离子及对某些膜的穿透以及突触传递，抑制脂质分解。 前列腺素在体内并不作为激素起作用，而是通过对激素的调节起作用。 外围激素对下丘脑或垂体的调节称长（负）反馈；激素对下丘脑或的调节称短（负）反馈；下丘脑本身产生的激素对下丘脑的调节称为超短（负）反馈。 激素相互的制约、依赖而受到的调控称多元调控。 昆虫从卵到成虫的几个阶段，都受到返幼激素、蜕皮激素的协调作用而控制。 多肽激素的分子特征有：无游离的N-端或C-端；具有二硫键的二十元环；活性多肽两侧有成对的碱新法氨基酸。 动物细胞的胆固醇含量较植物细胞高，质膜的胆固醇含量较细胞器膜多。 糖脂仅分布在细胞外侧的单分子层中，暴露在膜的表

40、面。 细菌、植物细胞质膜的糖脂几乎都是甘油的衍生物，动物细胞质膜的糖脂几乎都是神经鞘氨醇的衍生物。 叶绿体、嗜盐菌膜上有含硫的脂质。 磷脂分子在水溶液中，以微团还是以双层微囊的形式存在，取绝于磷脂的组成。天然磷脂分子倾向于后一种形式。 磷脂酰胆碱、鞘磷脂等一般形成稳定的脂双层结构，而不饱和脂肪酰链的磷脂酰乙醇胺（PE）、单葡萄糖甘油二脂、单半乳糖甘油二脂则易形成六角形相（H）结构。磷脂酰丝氨酸、磷脂酰甘油在中性与低温时，以脂双层结构存在，在酸性和高温时转变为六角形相（H）结构。 细胞的胞吞外排、细胞融合、脂质分子的翻转运动、蛋白质的跨膜运动等均可能出现非脂双层结构。 光合作用：6CO2+12N

41、ADPH+12H+18ATP1己糖（hexose）+18ADP+18Pi+12NAD+ Franz knoop用苯甲酸苯乙酸示踪，产马尿酸、苯乙尿酸，提出脂肪酸的-氧化学说。 G与反应速度无关。 高能化合物水解放能大于5千卡（20.92KJ）。 易兴奋组织的磷酸肌酸、无脊椎动物肌肉中的磷酸精氨酸通过磷酸基团的转移而作为贮能物质，称为磷酸原（phosphagens）。 ATP=AMP+Ppi 参与“虫荧光腺苷酸” 的形成，参与脂肪酸同CoA的反应。 在腺苷酸激酶的作用下，2ADP=ATP+AMP，可以维持细胞内ATP含量的动态平衡。 平衡态的能量变化为0，而稳定态消耗量着能量和物质。 主动运输的

42、特点有：专一性；饱和性；方向性；选择性抑制；消耗能量； 肌质网是肌细胞含有的一种特化的内质网膜系统，在肌细胞中形成一种由许多精细通道构成的网状结构，是细胞内的Ca2+库之一。 钙调蛋白（CaM）参与调节神经突触膜、脂肪细胞膜、小肠基底细胞膜、红细胞膜Ca2+运送，存在于所有脊椎动物组织中。 基团转移：PEP+糖（外侧） 糖-磷酸（内侧）+丙酮酸 ATP/ADP交换体以二聚体存在，在内负外正电势时，输出ATP，输入ADP。其机制为两态闸门-孔道机制。 并非所有跨膜运送的线粒体蛋白都以前体形式存在，如细胞色素C。 移动性离子载体：缬氨霉素，K+；A23187，Ca2+，Mg2+；尼日利亚菌素（多环

43、醚羧酸），H+/K+交换体。通道性离子载体：短菌杆肽A，使一价阳离子顺势流动。 呼吸链组成有：FMN、CoQ、及一些铁硫蛋白，不同的电子载体和蛋白结合而存在。 6-磷酸葡萄糖脱氢酶以NADP+为脱氢辅酶，谷氨酸脱氢酶以NADP+、NAD+为脱氢辅酶，一般以NAD+为脱氢辅酶。 NADPH上的氢由吡啶核苷酸转氢酶作用转到NAD+上。 CoQ是含长的异戊二烯侧链的醌类化合物。 细胞色素类含铁，参与内质网羟基化作用。 Cytb、Cytc1、Cyta、Cyta3整合在一起aa3含两个必须的Cu2+。 细胞色素C是唯一可溶的细胞色素，用于绘制系统发生树。 鱼藤酮、安密妥、杀粉蝶菌素抑制NADH-CoQ；

44、抗霉素A（链霉素）抑制Cytb-Cytc1；CN、硫化氢、叠氮化物、CO抑制aa3-O2。 不同种类细胞的线粒体所含有的细胞色素、黄素酶、铁硫中心的比例不一致，但内膜单位面积的Cyta分子数一致，称呼吸功能数。 ADP作为关键物质对氧化磷酸化的调节作用，称呼吸控制。其定量表达为ADP存在时（）的氧气利用速度与无ADP存在时（）的氧气利用速度的比值。是鉴定分离线粒体完整状况的指标，比值高的较完整。 解偶联剂：2，4-二硝基苯酚。氧化磷酸化抑制剂：寡霉素。离子载体抑制剂：缬氨霉素。 Na离子介导的葡萄糖运输受根本苷的抑制，不需钠的葡萄糖运输受细胞松弛素的抑制。 凡是连接两个羟基化合物（如醛与酮）形

45、成醛醇化合物的反应即醛缩反应。该反应的同工酶在肌肉中为A型，在肝中为B型，在脑中为C型，不需金属及辅助因子。酵母、细菌来源的需要Fe2+、Cu2+、Zn2+。 凡是催化分子内功能基团移动的酶为变位酶，Mg2+为必需。 乙醇脱氢酶含Zn2+，由2个Cys的S、His的N螯合。 丙酮酸脱氢酶系含：丙酮酸脱羧酶E1（24）、二氢硫辛酸乙酰转移酶E2（24）、二氢硫辛酸脱氢酶E3（12）、TPP、硫辛酸、FAD、NAD+、CoA、Mg2+。其中，酰基转移酶的Lys与硫辛酸形成反应长臂。其调节有：产物抑制、核苷酸反馈调节（GTP抑制，AMP活化）、可逆磷酸化作用共价调节。 氟乙酰CoA与柠檬酸合成酶反应

46、形成氟柠檬酸，可抑制下一步反应的酶，称致死合成。 顺乌头酸酶含4 Fe、4无机硫、4Cys的S结合的铁硫中心簇，参与底物的去水加水反应。是含铁的非铁卟啉蛋白。 异柠檬酸脱氢酶分2类，类以NAD为电子受体，为Mg2+、Mn2+活化，仅存在于线粒体。类以NADP+为电子受体，存在线粒体中，也存在胞质中。 -酮戊二酸脱氢酶系含有：-酮戊二酸脱羧酶E1、二氢硫辛酸乙酰转移酶E2、二氢硫辛酸脱氢酶E3、TPP、硫辛酸、FAD、NAD+、CoA、Mg2+。 Cori循环：乳酸氧化为丙酮酸参加糖异生为葡萄糖，进入血液运输至肌肉中。 糖原降解：由糖原磷酸化酶催化从糖原还原性末端葡萄糖的-1，4糖苷键断裂。 糖

47、原磷酸化酶亚基中特殊的氨酸的远端氨基与磷酸吡哆醛（PLP）以Schiff碱形式结合，参与糖原裂解为C1构型的糖原和G-1-P的反应。 催化G-1-PG-1-P的酶是磷酸葡萄糖变位酶，其活性中心有磷酸化丝氨酸。 新的葡萄糖残基加在糖原引物（大于4G）非还原末端G的C4-OH上，糖原合成需糖原起始合成酶及引发蛋白质。 UDP-己糖胺以F-6-P为底物由Gln提供NH3，乙酰辅酶A提供乙酰合成。 唾液酸由PEP与6-P-N-乙酰氨基甘露糖缩合而成。 解酵调节酶：己糖激酶、二磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶。 因一个Ser上的磷酸基转移而活性不同的酶称为前后酶或双功能酶。 三羧酸循环调控酶有：柠檬酸合成酶、异

48、柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶。 酵解与糖异生的控制点在F-6-P 、F-1，6-P的转化。糖异生的关键调控酶为果糖-1，6-二磷酸酶，而酵解的关键调控酶为F-1，6-P激酶。 无效循环：由不同的酶催化两个相反代谢，反应条件不一样，一个方面需要消耗ATP，另一方面则自动水解，结果ATP水解，消耗了能量，反应物没有变化，只产生能量供身体所需。酵解、糖异生中有3个位点可能产生无效循环。 肾上腺素、高血糖素、糖皮质激素、胰岛素可调节糖原磷酸化酶及糖原合成酶的活性与非活性形式的比例，除胰岛素促糖原合成增加外，均降解糖原。 磷酸化酶作用需Ca2+、磷酸化激酶、ATP、Mg2+。 大脑下部、下丘脑接受神经

49、信号，分泌皮质释放因子，通过血液运到靶腺体。 肾上腺皮质，使糖译剩加强，血糖增多 3羧酸物质：柠檬酸、顺乌头酸、异柠檬酸、草酰琥珀酸。 红降：光合效率在680nm以上是急剧下降。在700nm、600nm光照射下，光合速度比分别在700nm、600nm光照射下的光合总和要高称增效现象。 质蓝素为水溶性蛋白，氧化还原中心有Cu2+，与Cys、Met、2His螯合。 磷酸乙醇酸可转化为甘氨酸或乙醛酸途径中放出CO2，植物消耗氧气二磷酸核酮糖转化为CO2的过程称光呼吸。 四碳循环的初始反应为：PEP +CO2草酰乙酸+Pi。 脂肪和氨基酸可刺激十二指肠分泌肠促胰酶素和胆囊收缩素释放。 游离脂肪酸、胆固

50、醇、甘油2-单酯等脂解产物在光面内质网重新酯化形成含有三酯酰甘油的前乳糜微粒。 脂蛋白由疏水脂类为核心围绕着极性脂类及载脂蛋白（apoprotein，APO）组成。载脂蛋白在小肠、肝中合成，有APOA、APOA、APOA、APOB48、APOB100、APOC、APOE等七类。 对激素敏感的脂肪酶是限制脂解速度的限速酶。 氧化涉及末端甲基的羟基化，形成一级醇，继而氧化成醛转化为羧酸。 酮体是指：乙酰乙酸、丙酮、D-羟丁酸。 在形成软脂酸的过程中，8个乙酰辅酶A仅有一个以乙酰辅酶A的形式反应，其余均以丙二酸单酰辅酶A的形式反应。至形成16C的脂肪酸。 哺乳动物组织的脂肪酸合成酶体系为同二聚体，每

51、个亚基中肽链折叠成三个结构域，中间由可变区连接。结构域为底物进入酶系进行缩合反应的单元，含有乙酰转移酶（AT）、丙二酸单酰转移酶（MT）、缩合酶（CE）。结构域为进行还原反应的单元，含载脂蛋白、酮脂酰还原酶（KR）、脱水酶（DH）、烯脂酰还原酶（ER）。结构域为释放软脂酸（棕榈酸）的单元，含硫脂酶。 真核细胞的多酶体系是多功能蛋白，不同的酶共价连接成单一多肽链。 肝、脂肪组织的不饱和酶系由NADH-细胞色素b5还原酶、细胞色素b5、去饱和酶组成。 哺乳动物多烯脂肪酸依据前体、双键的数目分棕榈油酸、油酸、亚油酸、亚麻酸。 花生四烯酸是含量最丰富的多烯脂酸。 甘油三酯的前体是：L-磷脂甘油、脂酰辅

52、酶A。 胞嘧啶核苷酸在磷脂酸合成磷脂中作载体，可以是醇基的载体，也可以是磷脂酸的载体。 心磷脂的前体是CDP甘油二酯和磷脂酰甘油。鞘磷脂的前体是神酰胺即胆碱。 鞘糖脂的基本结构是鞘氨醇、脂肪酸和糖。 神经节苷脂在动物脑组织、神经组织细胞中含量相当高，特别是神经末梢与神经递质接触的受体部位，含有N-乙酰神经氨糖酸（即唾液酸）。 肝脏是合成胆固醇的主要场所。 HMG-CoA（-羟-甲基戊二酰辅酶A）在哺乳动物体内是脂肪酸代谢和胆固醇合成的分支点。 鲨烯合成后，底物产物都不溶于水，酶存在于内质网的微粒体中，由固醇载体蛋白（SCP）将胞液中的鲨烯转运到微粒体中，在其中环化为羊毛脂固醇。 7羟化为7-胆

53、固醇胆汁酸合成的限速步骤。7-羧化酶是单加氧酶，存在于微粒体中，需要NADP+、O2。 维生素D由类固醇转化而来，麦角固醇是其直接前体。 前列腺素（PG）、凝血噁烷酸、白三烯总称为类二十烷，是二十四碳四烯酸（花生四烯酸）的衍生代谢物。 前列腺素的释放速度取决于其合成速度（不贮存），其合成经历氧化、环化、异构化、还原等作用。参与作用的酶是与膜结合的多酶体系。 cAMP磷酸二酯酶降解cAMP，甲基黄嘌呤（茶碱、咖啡碱）可抑制它。 磷脂酸与CTP反应形成胞嘧啶核苷二磷酸二脂腺甘油酯，是磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌酸、心磷脂的前体。 机体获取的蛋白质量和排出的蛋白质量在正常情况下处于平衡状态，称氮平衡。 氧

54、化脱氨基作用普遍存在于动植物体中，动物的脱氨基作用在肝脏中进行。非氧化脱氨基作用出现在微生物体内。 转氨酶催化的反应都是可逆的，平衡常数为1左右。 胞内不同部分转氨酶的功能相同，但结构性质不同。 哺乳动物细胞中氨基酸氨基的集合作用在胞液中进行，由Asp转氨酶催化形成谷氨酸。 以磷酸吡哆醛为辅酶（辅基）的不同酶类催化氨基酸的不同反应，包括：转氨反应、脱羧作用、-羟氨酸脱水作用、-D-氨基酸消旋作用、Cys脱硫氢基作用。 组胺有降血压作用。酪胺有升血压作用。 血液中1%的氨就引起神经系统中毒。 氨转运主要通过Glu，肌肉中可以由葡萄糖-Ala循环利用丙氨酸将氨送到肝脏。 氨基酸的脱氨形成氨甲酰磷酸

55、等在线粒体中进行，可以防止过量游离氨积累在血液中而引起神经中毒。 尿酸以内酰胺、内酰亚胺和完全解离三种形式存在。 色氨酸碳架转化产物为：乙酰乙酰辅酶A、1乙酰辅酶A、4CO2、1甲酸。 脯氨酸经氧化、加水、脱氢形成Glu，而羟脯氨酸降解为丙酮酸和乙醛酸。 凡能形成丙酮酸、-酮戊二酸、琥珀酸、草酰乙酸的氨基酸称生糖氨基酸。 可作为一碳单位来源的氨基酸有；甘氨酸、苏氨酸、组氨酸、甲硫氨酸。 参与肌酸合成的氨基酸有：精氨酸、甘氨酸、甲硫氨酸。 人类和大白鼠的必需氨基酸是相同的。高等植物能合成自己所需的全部氨基酸，可以以氨、硝酸作为N源。 -酮戊二酸衍生的氨基酸有：L-谷氨酸、L-谷酰胺、L-脯氨酸、

56、L-精氨酸、L-赖氨酸。 草酰乙酸衍生的氨基酸有：L-天冬氨酸、L-天冬酰胺、L-甲硫氨酸、L-苏氨酸、L-异亮氨酸。 丙酮酸衍生的氨基酸有：L-丙氨酸、L-缬氨酸、L-亮氨酸、L-异亮氨酸、L-赖氨酸。3-磷酸甘油酸衍生的氨基酸有：L-丝氨酸、L-半胱氨酸、甘氨酸。 抑制谷酰胺的含氮物有：氨基葡萄糖-6-磷酸、色氨酸、丙氨酸、甘氨酸、组氨酸、胞嘧啶核苷三磷酸、AMP、氨甲酰磷酸。 谷酰酸合酶供氢体，在细菌中是NADPH，蕈类为NADH，植物中一种是还原型铁氧还蛋白，另一种是NADPH或NADH。 尿素的前体物质是精氨酸。 谷酰胺合成反应中ATP转变为ADP和磷酸。天冬酰胺合成反应中ATP转变

57、为AMP和焦磷酸。 异亮氨酸有4个碳来自于天冬氨酸，2个碳来自丙酮酸。 丙氨酸合成没有反馈抑制效应，机体中有许多丙氨酸库。 芳香氨基酸包括：苯丙氨酸、色氨酸、丝氨酸。只能由植物、微生物合成。 莽草酸途径是指从莽草酸到形成分支酸的一段过程。 吲哚环上苯环C1、C6来自PEP，C2-C5来自赤藓糖-4-磷酸。色氨酸吲哚环上N来自Asn的氮，吲哚环上C7、C8来自PRPP，色氨酸侧链部分来自丝氨酸。 丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸的生物合成不受终产物的反馈抑制。 A.Meister提出的-谷酰胺循环解释了谷胱甘肽参与的跨膜转运。 卟啉是血红素、细胞色素、叶绿素等的核心部分，其合成以甘氨酸和琥珀酰辅酶A为基本原料，含二价铁离子。 胆色素原是吡咯化合物的母体。 铁卟啉或血红蛋白、血红素降解产物为三价铁离子和胆红素。 短杆菌肽S合酶体系中的硫酯键为氨基酰基腺苷酸。 D-氨基酸是由L